RNA–Protein interactions for RNA: YML023C

NSE5, Transcript of Component of the SMC5-SMC6 complex, yeastyeast

Gene NSE5, Length 1,671 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE5YML023C YNL018CP53976 612 aa7.3□□□□□ -1.24
NSE5YML023C TSR2Q06672 205 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
NSE5YML023C YKL069WP36088 180 aa7.29□□□□□ -1.24
NSE5YML023C PMT3P47190 753 aa7.29□□□□□ -1.24
NSE5YML023C PRP43P53131 767 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
NSE5YML023C YGR053CP53234 283 aa7.29□□□□□ -1.24
NSE5YML023C YNL058CP53947 316 aa7.29□□□□□ -1.24
NSE5YML023C ALO1P54783 526 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
NSE5YML023C RRP9Q06506 573 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
NSE5YML023C YRR1Q12172 810 aa7.29□□□□□ -1.24
NSE5YML023C CDC34P14682 295 aa7.28□□□□□ -1.24
NSE5YML023C TPM1P17536 199 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
NSE5YML023C YBR071WP38243 211 aa7.28□□□□□ -1.24
NSE5YML023C ESL1P40456 1118 aa7.28□□□□□ -1.24
NSE5YML023C SEC27P41811 889 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
NSE5YML023C HLJ1P48353 224 aa7.28□□□□□ -1.24
NSE5YML023C YGR016WP53209 190 aa7.28□□□□□ -1.24
NSE5YML023C SPC19Q03954 165 aa7.28□□□□□ -1.24
NSE5YML023C TOS4Q06266 489 aa7.28□□□□□ -1.24
NSE5YML023C ESC2Q06340 456 aa7.28□□□□□ -1.24
NSE5YML023C MLP2P40457 1679 aa7.28□□□□□ -1.24
NSE5YML023C PDR12Q02785 1511 aa7.28□□□□□ -1.24
NSE5YML023C CAN1P04817 590 aa7.28□□□□□ -1.24
NSE5YML023C CYT1P07143 309 aa7.28□□□□□ -1.24
NSE5YML023C NPR1P22211 790 aa7.28□□□□□ -1.24
NSE5YML023C VAN1P23642 535 aa7.28□□□□□ -1.24
NSE5YML023C KRR1P25586 316 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
NSE5YML023C STO1P34160 861 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
NSE5YML023C PTH2P34222 208 aa7.28□□□□□ -1.24
NSE5YML023C ABZ1P37254 787 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
NSE5YML023C GGA2P38817 585 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
NSE5YML023C SOL3P38858 249 aa7.28□□□□□ -1.24
NSE5YML023C ALA1P40825 983 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
NSE5YML023C GPG1P53130 126 aa7.28□□□□□ -1.24
NSE5YML023C TFB2Q02939 513 aa7.28□□□□□ -1.24
NSE5YML023C PSR2Q07949 397 aa7.28□□□□□ -1.24
NSE5YML023C TRP5P00931 707 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
NSE5YML023C HXK1P04806 485 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
NSE5YML023C SLY41P22215 453 aa7.27□□□□□ -1.25
NSE5YML023C ECM32P32644 1121 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
NSE5YML023C BNA1P47096 177 aa7.27□□□□□ -1.25
NSE5YML023C YGR125WP53273 1036 aa7.27□□□□□ -1.25
NSE5YML023C MET14Q02196 202 aa7.27□□□□□ -1.25
NSE5YML023C YML131WQ03102 365 aa7.27□□□□□ -1.25
NSE5YML023C RCF1Q03713 159 aa7.27□□□□□ -1.25
NSE5YML023C REH1Q06709 432 aa7.27□□□□□ -1.25
NSE5YML023C MSB4Q12317 492 aa7.27□□□□□ -1.25
NSE5YML023C TSC13Q99190 310 aa7.27□□□□□ -1.25
NSE5YML023C MSM1P22438 575 aa7.26□□□□□ -1.25
NSE5YML023C BUD31P25337 157 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
NSE5YML023C VPH1P32563 840 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
NSE5YML023C SUV3P32580 737 aa7.26□□□□□ -1.25
NSE5YML023C CAJ1P39101 391 aa7.26□□□□□ -1.25
NSE5YML023C DJP1P40564 432 aa7.26□□□□□ -1.25
NSE5YML023C VTC2P43585 828 aa7.26□□□□□ -1.25
NSE5YML023C UBA2P52488 636 aa7.26□□□□□ -1.25
NSE5YML023C PEX14P53112 341 aa7.26□□□□□ -1.25
NSE5YML023C GRE2Q12068 342 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
NSE5YML023C TRS33Q99394 268 aa7.26□□□□□ -1.25
NSE5YML023C NUP145P49687 1317 aa7.26□□□□□ -1.25
NSE5YML023C DOP1Q03921 1698 aa7.25□□□□□ -1.25
NSE5YML023C DUT1P33317 147 aa7.25□□□□□ -1.25
NSE5YML023C RXT2P38255 430 aa7.25□□□□□ -1.25
NSE5YML023C UFD2P54860 961 aa7.25□□□□□ -1.25
NSE5YML023C VTI1Q04338 217 aa7.25□□□□□ -1.25
NSE5YML023C CSC1Q06538 782 aa7.25□□□□□ -1.25
NSE5YML023C CCP1P00431 361 aa7.25□□□□□ -1.25
NSE5YML023C GAL1P04385 528 aa7.25□□□□□ -1.25
NSE5YML023C TRM1P15565 570 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
NSE5YML023C MRF1P30775 413 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
NSE5YML023C ATG3P40344 310 aa7.25□□□□□ -1.25
NSE5YML023C MNT3P40549 630 aa7.25□□□□□ -1.25
NSE5YML023C SAP185P40856 1058 aa7.25□□□□□ -1.25
NSE5YML023C BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data7.25□□□□□ -1.25not detected
NSE5YML023C UGO1Q03327 502 aa7.25□□□□□ -1.25
NSE5YML023C BUL2Q03758 920 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
NSE5YML023C MED1Q12321 566 aa7.25□□□□□ -1.25
NSE5YML023C TCB1Q12466 1186 aa7.25□□□□□ -1.25
NSE5YML023C IMP2'P32351 346 aa7.24□□□□□ -1.25
NSE5YML023C EUG1P32474 517 aa7.24□□□□□ -1.25
NSE5YML023C SMY2P32909 740 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
NSE5YML023C PEX5P35056 612 aa7.24□□□□□ -1.25
NSE5YML023C YKL050CP35736 922 aa7.24□□□□□ -1.25
NSE5YML023C UME1Q03010 460 aa7.24□□□□□ -1.25
NSE5YML023C UTP13Q05946 817 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
NSE5YML023C THI73Q07904 523 aa7.24□□□□□ -1.25
NSE5YML023C OXR1Q08952 273 aa7.24□□□□□ -1.25
NSE5YML023C RRP6Q12149 733 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
NSE5YML023C PLC1P32383 869 aa7.23□□□□□ -1.25
NSE5YML023C YHL008CP38750 627 aa7.23□□□□□ -1.25
NSE5YML023C YHR218WP38899 603 aa7.23□□□□□ -1.25
NSE5YML023C FAA3P39002 694 aa7.23□□□□□ -1.25
NSE5YML023C APL6P46682 809 aa7.23□□□□□ -1.25
NSE5YML023C HEL2Q05580 639 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
NSE5YML023C GDB1Q06625 1536 aa7.23□□□□□ -1.25
NSE5YML023C TOM70P07213 617 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
NSE5YML023C MEF1P25039 761 aa7.22□□□□□ -1.25
NSE5YML023C AAD3P25612 363 aa7.22□□□□□ -1.25
NSE5YML023C STE5P32917 917 aa7.22□□□□□ -1.25
NSE5YML023C NUP120P35729 1037 aa7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 76.5 ms