RNA–Protein interactions for RNA: YJR083C

ACF4, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene ACF4, Length 930 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ACF4	YJR083C	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ACF4	YJR083C	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ACF4	YJR083C	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ACF4	YJR083C	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ACF4	YJR083C	QDR1	P40475	563 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ACF4	YJR083C	ATG1	P53104	897 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ACF4	YJR083C	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ACF4	YJR083C	DUR3	P33413	735 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ACF4	YJR083C	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ACF4	YJR083C	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ACF4	YJR083C	ADP1	P25371	1049 aa		5	□□□□□ -1.61
ACF4	YJR083C	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ACF4	YJR083C	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ACF4	YJR083C	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ACF4	YJR083C	ALT1	P52893	592 aa		5	□□□□□ -1.61
ACF4	YJR083C	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ACF4	YJR083C	YCR015C	P25616	317 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ACF4	YJR083C	YKL222C	P35995	705 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ACF4	YJR083C	ERP5	P38819	212 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ACF4	YJR083C	MSH6	Q03834	1242 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ACF4	YJR083C	ACF4	P47129	309 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ACF4	YJR083C	YNL011C	P53980	444 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ACF4	YJR083C	CDA2	Q06703	312 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ACF4	YJR083C	TRE1	Q08919	783 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ACF4	YJR083C	SLD2	P34252	453 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACF4	YJR083C	ORC3	P54790	616 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACF4	YJR083C	EAR1	Q03212	550 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACF4	YJR083C	SSY1	Q03770	852 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACF4	YJR083C	ESC8	Q08119	714 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACF4	YJR083C	FLP1	P03870	423 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACF4	YJR083C	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ACF4	YJR083C	NFS1	P25374	497 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACF4	YJR083C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ACF4	YJR083C	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ACF4	YJR083C	TRS120	Q04183	1289 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACF4	YJR083C	BSC2	Q05611	235 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACF4	YJR083C	YVC1	Q12324	675 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACF4	YJR083C	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ACF4	YJR083C	SAP155	P43612	1002 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ACF4	YJR083C	YGR045C	P53229	120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ACF4	YJR083C	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ACF4	YJR083C	YML020W	Q03722	664 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ACF4	YJR083C	PMT7	Q06644	662 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ACF4	YJR083C	AVO1	Q08236	1176 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ACF4	YJR083C	PRO1	P32264	428 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACF4	YJR083C	NNK1	P36003	928 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACF4	YJR083C	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ACF4	YJR083C	PEX7	P39108	375 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACF4	YJR083C	MDJ2	P42834	146 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACF4	YJR083C	NUT1	P53114	1132 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACF4	YJR083C	YAF9	P53930	226 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACF4	YJR083C	CDC55	Q00362	526 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACF4	YJR083C	YHL050C	P38721	697 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACF4	YJR083C	YHR219W	P38900	624 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACF4	YJR083C	MNL2	Q12205	849 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACF4	YJR083C	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ACF4	YJR083C	SEC20	P28791	383 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACF4	YJR083C	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ACF4	YJR083C	THI80	P35202	319 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACF4	YJR083C	TAF1	P46677	1066 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACF4	YJR083C	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ACF4	YJR083C	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACF4	YJR083C	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACF4	YJR083C	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACF4	YJR083C	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACF4	YJR083C	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACF4	YJR083C	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACF4	YJR083C	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACF4	YJR083C	YKL077W	P36081	392 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACF4	YJR083C	PTC7	P38797	343 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACF4	YJR083C	GIP4	P39732	760 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACF4	YJR083C	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ACF4	YJR083C	NUT2	Q06213	157 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACF4	YJR083C	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACF4	YJR083C	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ACF4	YJR083C	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ACF4	YJR083C	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ACF4	YJR083C	THI12	P42883	340 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACF4	YJR083C	THI5	P43534	340 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACF4	YJR083C	THI11	P47183	340 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACF4	YJR083C	THI13	Q07748	340 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACF4	YJR083C	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ACF4	YJR083C	FRT1	Q99332	602 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACF4	YJR083C	GTS1	P40956	396 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACF4	YJR083C	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ACF4	YJR083C	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ACF4	YJR083C	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ACF4	YJR083C	PPX1	P38698	397 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACF4	YJR083C	SHU2	P38957	223 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACF4	YJR083C	MON1	P53129	644 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACF4	YJR083C	TPP1	Q03796	238 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACF4	YJR083C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ACF4	YJR083C	EXO5	P38289	585 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ACF4	YJR083C	IPL1	P38991	367 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ACF4	YJR083C	SLS1	P42900	643 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ACF4	YJR083C	MRPL22	P53881	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ACF4	YJR083C	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ACF4	YJR083C	FLR1	P38124	548 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ACF4	YJR083C	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ACF4	YJR083C	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63

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