RNA–Protein interactions for RNA: YJL057C

IKS1, Transcript of Protein kinase of unknown cellular role, yeast

Gene IKS1, Length 2,004 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IKS1	YJL057C	ISC10	P32645	267 aa		5.13	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	HSP78	P33416	811 aa		5.13	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	SAP185	P40856	1058 aa		5.13	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	PFD1	P46988	109 aa		5.13	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	PUS6	P53294	404 aa		5.13	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	YNL193W	P53870	558 aa		5.13	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	UGO1	Q03327	502 aa		5.13	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	FMP25	Q08023	583 aa		5.13	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	SAS3	P34218	831 aa		5.13	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	PTH2	P34222	208 aa		5.13	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	BET3	P36149	193 aa		5.13	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	CAJ1	P39101	391 aa		5.13	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	YJR115W	P47152	169 aa		5.13	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	YNL011C	P53980	444 aa		5.13	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	EEB1	Q02891	456 aa		5.13	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	TAF8	Q03750	510 aa		5.13	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	SPO75	Q07798	868 aa		5.13	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.13	□□□□□ -1.59	not detected
IKS1	YJL057C	TFB4	Q12004	338 aa		5.13	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	UBP1	P25037	809 aa		5.12	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	MEF1	P25039	761 aa		5.12	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	KIP2	P28743	706 aa		5.12	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	PTP2	P29461	750 aa		5.12	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	DBF20	P32328	564 aa		5.12	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	NPL4	P33755	580 aa		5.12	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	NUP120	P35729	1037 aa		5.12	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	FIG4	P42837	879 aa		5.12	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	ERO1	Q03103	563 aa		5.12	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	YLR001C	Q07895	862 aa		5.12	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	PSR2	Q07949	397 aa		5.12	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	TEC1	P18412	486 aa		5.11	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	AAD3	P25612	363 aa		5.11	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	IMP2'	P32351	346 aa		5.11	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	HXT5	P38695	592 aa		5.11	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	MRPS18	P42847	217 aa		5.11	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	SPC19	Q03954	165 aa		5.11	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	GUT2	P32191	649 aa		5.11	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	KTR4	P38131	464 aa		5.11	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	CAB1	Q04430	367 aa		5.11	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	DAL4	Q04895	635 aa		5.11	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	YDR286C	Q05530	114 aa		5.11	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	CDC73	Q06697	393 aa		5.11	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	ALR1	Q08269	859 aa		5.11	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	TRE2	Q08693	809 aa		5.11	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	MCD1	Q12158	566 aa		5.11	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.1	□□□□□ -1.59	not detected
IKS1	YJL057C	CHS3	P29465	1165 aa		5.1	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	MKK2	P32491	506 aa		5.1	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	EAP1	P36041	632 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	HEH2	Q03281	663 aa		5.1	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	RCF1	Q03713	159 aa		5.1	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	SDH5	Q08230	162 aa		5.1	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	TCB1	Q12466	1186 aa		5.1	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	YHL041W	P38730	149 aa		5.09	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	YHR218W	P38899	603 aa		5.09	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	MAM1	P40065	302 aa		5.09	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	DJP1	P40564	432 aa		5.09	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	ERF2	Q06551	359 aa		5.09	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	INO80	P53115	1489 aa		5.09	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	GCR1	P07261	785 aa		5.09	□□□□□ -1.6
IKS1	YJL057C	ARE1	P25628	610 aa		5.09	□□□□□ -1.6
IKS1	YJL057C	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.6
IKS1	YJL057C	UGA4	P32837	571 aa		5.09	□□□□□ -1.6
IKS1	YJL057C	NIC96	P34077	839 aa		5.09	□□□□□ -1.6
IKS1	YJL057C	YKL050C	P35736	922 aa		5.09	□□□□□ -1.6
IKS1	YJL057C	GDH3	P39708	457 aa		5.09	□□□□□ -1.6
IKS1	YJL057C	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.6
IKS1	YJL057C	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.6
IKS1	YJL057C	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.6
IKS1	YJL057C	BTN2	P53286	410 aa		5.09	□□□□□ -1.6
IKS1	YJL057C	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.6
IKS1	YJL057C	RSC4	Q02206	625 aa		5.09	□□□□□ -1.6
IKS1	YJL057C	EAF1	Q06337	982 aa		5.09	□□□□□ -1.6
IKS1	YJL057C	YPL191C	Q08930	360 aa		5.09	□□□□□ -1.6
IKS1	YJL057C	CEX1	Q12453	761 aa		5.09	□□□□□ -1.6
IKS1	YJL057C	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
IKS1	YJL057C	PEX5	P35056	612 aa		5.08	□□□□□ -1.6
IKS1	YJL057C	NTH2	P35172	780 aa		5.08	□□□□□ -1.6

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