RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000218686.1

Trappc6b-207, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc6b, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fam184bQ0KK56 942 aa30,51■■■□□ 2,47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zdbf2Q5SS00 2493 aaKnown RBP30,51■■■□□ 2,47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Kif23E9Q5G3 953 aa30,5■■■□□ 2,47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pnpla7A2AJ88 1352 aa30,5■■■□□ 2,47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 FanciQ8K368 1330 aa30,49■■■□□ 2,47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ptpn23Q6PB44 1692 aa30,49■■■□□ 2,47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Znf335A2A5K6 1337 aa30,48■■■□□ 2,47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pak3Q61036 559 aa30,48■■■□□ 2,47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Kcnh5Q920E3 988 aa30,48■■■□□ 2,47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP30,48■■■□□ 2,47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Trpc5Q9QX29 975 aa30,48■■■□□ 2,47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mst1rQ62190 1378 aa30,47■■■□□ 2,47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 FancaQ9JL70 1439 aa30,47■■■□□ 2,47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Neurod1Q60867 357 aa30,46■■■□□ 2,47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ginm1Q91WR6 327 aa30,46■■■□□ 2,47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sik1Q60670 779 aa30,45■■■□□ 2,47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Dennd6aQ8BH65 605 aa30,45■■■□□ 2,47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Nlgn1Q99K10 843 aa30,45■■■□□ 2,47
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Nsd3Q6P2L6 1439 aa30,44■■■□□ 2,46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rnf180Q3U827 592 aa30,43■■■□□ 2,46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Kif16bB1AVY7 1312 aa30,43■■■□□ 2,46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Arfgef2A2A5R2 1792 aa30,42■■■□□ 2,46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rad23bP54728 416 aa30,42■■■□□ 2,46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Q8BT18 775 aa30,42■■■□□ 2,46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fmnl2A2APV2 1086 aa30,41■■■□□ 2,46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Exoc5Q3TPX4 708 aa30,41■■■□□ 2,46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Hirip3Q8BLH7 601 aa30,4■■■□□ 2,46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 TatQ8QZR1 454 aa30,4■■■□□ 2,46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ciz1Q8VEH2 845 aa30,4■■■□□ 2,46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Afg3l2Q8JZQ2 802 aaKnown RBP30,39■■■□□ 2,46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Akt1s1Q9D1F4 257 aa30,39■■■□□ 2,46
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Nol11Q8BJW5 723 aaKnown RBP30,38■■■□□ 2,45
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Srcin1Q9QWI6 1250 aa30,37■■■□□ 2,45
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Stard8Q8K031 1019 aa30,36■■■□□ 2,45
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 FocadA2AKG8 1798 aa30,36■■■□□ 2,45
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sgip1Q8VD37 806 aa30,35■■■□□ 2,45
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cabp4Q8VHC5 271 aa30,34■■■□□ 2,45
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 CrklP47941 303 aa30,33■■■□□ 2,45
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fchsd2Q3USJ8 740 aa30,33■■■□□ 2,45
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Emilin1Q99K41 1017 aa30,33■■■□□ 2,45
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Chd4Q6PDQ2 1915 aaKnown RBP30,33■■■□□ 2,45
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Slit1Q80TR4 1531 aa30,32■■■□□ 2,44
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fam198bQ3UPI1 517 aa30,32■■■□□ 2,44
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Egfem1Q8C088 590 aa30,32■■■□□ 2,44
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 OptnQ8K3K8 584 aa30,32■■■□□ 2,44
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ankrd13dQ6PD24 605 aa30,31■■■□□ 2,44
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zpr1Q62384 459 aa30,3■■■□□ 2,44
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 IncenpQ9WU62 880 aa30,27■■■□□ 2,44
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cnga1P29974 684 aa30,26■■■□□ 2,43
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ubr1O70481 1757 aa30,26■■■□□ 2,43
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Kcnh4A2A5F7 1018 aa30,24■■■□□ 2,43
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tmem132eQ6IEE6 982 aa30,24■■■□□ 2,43
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zswim8Q3UHH1 1832 aaKnown RBP30,23■■■□□ 2,43
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Plekhd1B2RPU2 505 aa30,22■■■□□ 2,43
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rundc1Q0VDN7 615 aa30,21■■■□□ 2,43
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sos2Q02384 1333 aa30,21■■■□□ 2,43
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 InsrP15208 1372 aa30,2■■■□□ 2,43
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Map2P20357 1828 aa30,19■■■□□ 2,42
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Abca3Q8R420 1704 aa30,19■■■□□ 2,42
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cdk12Q14AX6 1484 aaKnown RBP30,18■■■□□ 2,42
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zranb3Q6NZP1 1069 aa30,17■■■□□ 2,42
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Scn7aB1AYL1 1681 aa30,17■■■□□ 2,42
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP30,16■■■□□ 2,42
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ano8Q6PB70 1060 aa30,16■■■□□ 2,42
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ppm1fQ8CGA0 452 aa30,16■■■□□ 2,42
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ahnak2E9PYB0 1738 aaKnown RBP30,15■■■□□ 2,42
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mtfr1lQ9CWE0 289 aa30,13■■■□□ 2,41
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Magea6O89010 325 aa30,11■■■□□ 2,41
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 ErfeQ6PGN1 340 aa30,11■■■□□ 2,41
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Magea3Q6T340 320 aa30,11■■■□□ 2,41
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Usp21Q9QZL6 566 aa30,1■■■□□ 2,41
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP30,09■■■□□ 2,41
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Elp1Q7TT37 1333 aaKnown RBP30,08■■■□□ 2,41
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gpr162Q3UN16 588 aa30,07■■■□□ 2,4
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cc2d1aQ8K1A6 943 aa30,07■■■□□ 2,4
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa30,07■■■□□ 2,4
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Chrna2Q91X60 512 aa30,05■■■□□ 2,4
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Col15a1O35206 1367 aa30,04■■■□□ 2,4
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rock2P70336 1388 aa30,04■■■□□ 2,4
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa30,04■■■□□ 2,4
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Kiaa0319lQ8K135 1048 aa30,04■■■□□ 2,4
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Shank3Q4ACU6 1730 aa30,04■■■□□ 2,4
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Adgrb1Q3UHD1 1582 aa30,03■■■□□ 2,4
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fam122aQ9DB52 284 aa30,03■■■□□ 2,4
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 CemipQ8BI06 1361 aa30,02■■■□□ 2,4
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mrps5Q99N87 432 aaKnown RBP30■■■□□ 2,39
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rps6ka4Q9Z2B9 773 aa30■■■□□ 2,39
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Hoxd11P23813 323 aa29,99■■■□□ 2,39
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fam50bQ9WTJ8 334 aa29,98■■■□□ 2,39
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 TkfcQ8VC30 578 aa29,97■■■□□ 2,39
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Socs7Q8VHQ2 579 aa29,97■■■□□ 2,39
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Msl1Q6PDM1 616 aa29,95■■■□□ 2,39
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm21680A0A0G2JGR8 267 aa29,94■■■□□ 2,38
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm10471E9Q1C7 252 aa29,94■■■□□ 2,38
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Kcnn1Q9EQR3 537 aa29,94■■■□□ 2,38
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Igsf1Q7TQA1 1317 aa29,94■■■□□ 2,38
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 MeiocA2AG06 965 aa29,93■■■□□ 2,38
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Hoxc9P09633 260 aa29,93■■■□□ 2,38
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Jdp2P97875 163 aa29,92■■■□□ 2,38
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP29,92■■■□□ 2,38
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