RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089950.10

Rabggtb-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Rabggtb, Length 1,381 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Robo1O89026 1612 aa16.94■□□□□ 0.3
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Ccne1Q61457 408 aa16.94■□□□□ 0.3
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Ggt6Q6PDE7 497 aa16.94■□□□□ 0.3
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Smim5Q8BT42 78 aa16.94■□□□□ 0.3
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa16.94■□□□□ 0.3
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Ddx54Q8K4L0 874 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Esx1O88933 382 aa16.93■□□□□ 0.3
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Emilin2Q8K482 1074 aa16.93■□□□□ 0.3
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 PalmQ9Z0P4 383 aa16.93■□□□□ 0.3
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Ciz1Q8VEH2 845 aa16.92■□□□□ 0.3
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Zeb2Q9R0G7 1215 aa16.92■□□□□ 0.3
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Slit2Q9R1B9 1521 aa16.92■□□□□ 0.3
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Plekhd1B2RPU2 505 aa16.91■□□□□ 0.3
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Eya1P97767 591 aa16.91■□□□□ 0.3
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Ncbp3Q8BZR9 615 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Iqcf3Q9D498 203 aa16.91■□□□□ 0.3
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Pard3Q99NH2 1333 aa16.91■□□□□ 0.3
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Kdm6aO70546 1401 aa16.91■□□□□ 0.3
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 OptnQ8K3K8 584 aa16.9■□□□□ 0.3
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Ptpn23Q6PB44 1692 aa16.9■□□□□ 0.3
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Znf541Q0GGX2 1363 aa16.9■□□□□ 0.3
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 CrklP47941 303 aa16.89■□□□□ 0.3
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Gsdma3Q5Y4Y6 464 aa16.89■□□□□ 0.29
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa16.88■□□□□ 0.29
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 PtprvP70289 1705 aa16.88■□□□□ 0.29
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 MpripP97434 1024 aa16.88■□□□□ 0.29
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Nyap1Q6PFX7 833 aa16.88■□□□□ 0.29
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Uspl1Q3ULM6 1089 aa16.87■□□□□ 0.29
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Stk31Q99MW1 1018 aa16.87■□□□□ 0.29
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Fnbp4Q6ZQ03 1031 aa16.86■□□□□ 0.29
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 RgmbQ7TQ33 436 aa16.86■□□□□ 0.29
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Ecm2Q5FW85 670 aa16.85■□□□□ 0.29
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 HypkQ9CR41 129 aa16.85■□□□□ 0.29
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Slit1Q80TR4 1531 aa16.85■□□□□ 0.29
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Col15a1O35206 1367 aa16.84■□□□□ 0.29
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Cavin4A2AMM0 362 aa16.84■□□□□ 0.29
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Sema6bO54951 886 aa16.84■□□□□ 0.29
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Simc1E9Q6E9 1354 aa16.84■□□□□ 0.29
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Cntnap1O54991 1385 aa16.84■□□□□ 0.29
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Apaf1O88879 1249 aa16.83■□□□□ 0.28
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Q4VA45 678 aa16.83■□□□□ 0.28
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Zpr1Q62384 459 aa16.83■□□□□ 0.28
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 TnikP83510 1323 aa16.83■□□□□ 0.28
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 InhbeO08717 350 aa16.82■□□□□ 0.28
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Spef2Q8C9J3 1734 aa16.82■□□□□ 0.28
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Usp19Q3UJD6 1360 aa16.81■□□□□ 0.28
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Gm10471E9Q1C7 252 aa16.8■□□□□ 0.28
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Pak3Q61036 559 aa16.8■□□□□ 0.28
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Ralbp1Q62172 648 aa16.8■□□□□ 0.28
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Zranb3Q6NZP1 1069 aa16.8■□□□□ 0.28
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Ppp1r37Q8BKR5 712 aa16.8■□□□□ 0.28
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Anks4bQ8K3X6 423 aa16.8■□□□□ 0.28
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 MypopQ8R4U1 393 aa16.79■□□□□ 0.28
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Amotl1Q9D4H4 968 aa16.79■□□□□ 0.28
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Pm20d1Q8C165 503 aa16.78■□□□□ 0.28
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Cc2d1aQ8K1A6 943 aa16.78■□□□□ 0.28
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Swt1Q9DBQ9 907 aa16.78■□□□□ 0.28
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Parp14Q2EMV9 1817 aa16.78■□□□□ 0.28
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Aplp2Q06335 707 aa16.77■□□□□ 0.28
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Mcm10Q0VBD2 885 aa16.77■□□□□ 0.28
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 TmpoQ61033 693 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 4930572O03RikQ8C5Y0 211 aa16.77■□□□□ 0.28
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Ofd1Q80Z25 1017 aa16.77■□□□□ 0.27
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 ThemisQ8BGW0 636 aa16.77■□□□□ 0.27
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Uhrf1bp1B2KF50 1429 aa16.76■□□□□ 0.27
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Dusp27Q148W8 1138 aa16.76■□□□□ 0.27
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 CrbnQ8C7D2 445 aa16.76■□□□□ 0.27
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Plin1Q8CGN5 517 aa16.76■□□□□ 0.27
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa16.76■□□□□ 0.27
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Cabp2Q9JLK4 216 aa16.76■□□□□ 0.27
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Nhsl1Q8CAF4 1587 aa16.75■□□□□ 0.27
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Shank2Q80Z38 1476 aa16.75■□□□□ 0.27
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Sf3b2Q3UJB0 878 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Vps33bP59016 617 aa16.74■□□□□ 0.27
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Ginm1Q91WR6 327 aa16.74■□□□□ 0.27
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Psrc1Q9D0P7 329 aa16.74■□□□□ 0.27
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Ccdc129Q14B48 1034 aa16.73■□□□□ 0.27
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Lrp6O88572 1613 aa16.72■□□□□ 0.27
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Rtf1A2AQ19 715 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Zfp444Q3TDV8 331 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Mst1rQ62190 1378 aa16.71■□□□□ 0.27
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 FocadA2AKG8 1798 aa16.71■□□□□ 0.26
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Larp1bA0A0A6YXJ7 370 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Kcnh4A2A5F7 1018 aa16.69■□□□□ 0.26
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Cypt2Q6P924 180 aa16.69■□□□□ 0.26
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Hoxd11P23813 323 aa16.68■□□□□ 0.26
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Eif3bQ8JZQ9 803 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Fam50bQ9WTJ8 334 aa16.68■□□□□ 0.26
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Neurod2Q62414 383 aa16.67■□□□□ 0.26
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Dmrt2Q8BG36 561 aa16.67■□□□□ 0.26
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Ccdc30Q8BVF4 654 aa16.67■□□□□ 0.26
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Trpm3Q5F4S9 1721 aa16.67■□□□□ 0.26
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Adgrb1Q3UHD1 1582 aa16.66■□□□□ 0.26
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Nup153E9Q3G8 1462 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Abcc12Q80WJ6 1366 aa16.66■□□□□ 0.26
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Eno4Q8C042 619 aa16.66■□□□□ 0.26
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Elp1Q7TT37 1333 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Gnai1B2RSH2 354 aa16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 50.2 ms