RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025262.5

Ltb-201, Transcript of Lymphotoxin-beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ltb, Length 1,160 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nlgn1Q99K10 843 aa27.35■■□□□ 1.97
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Fam184bQ0KK56 942 aa27.34■■□□□ 1.97
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
Ltb-201ENSMUST00000025262 Kif16bB1AVY7 1312 aa27.34■■□□□ 1.97
Ltb-201ENSMUST00000025262 FancaQ9JL70 1439 aa27.33■■□□□ 1.97
Ltb-201ENSMUST00000025262 AtrnQ9WU60 1428 aa27.33■■□□□ 1.97
Ltb-201ENSMUST00000025262 Kif23E9Q5G3 953 aa27.32■■□□□ 1.96
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sik1Q60670 779 aa27.32■■□□□ 1.96
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pak3Q61036 559 aa27.32■■□□□ 1.96
Ltb-201ENSMUST00000025262 Stard8Q8K031 1019 aa27.32■■□□□ 1.96
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ginm1Q91WR6 327 aa27.32■■□□□ 1.96
Ltb-201ENSMUST00000025262 Srcin1Q9QWI6 1250 aa27.32■■□□□ 1.96
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mst1rQ62190 1378 aa27.32■■□□□ 1.96
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fmnl2A2APV2 1086 aa27.29■■□□□ 1.96
Ltb-201ENSMUST00000025262 TatQ8QZR1 454 aa27.28■■□□□ 1.96
Ltb-201ENSMUST00000025262 Trpc5Q9QX29 975 aa27.28■■□□□ 1.96
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nol11Q8BJW5 723 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nsd3Q6P2L6 1439 aa27.26■■□□□ 1.95
Ltb-201ENSMUST00000025262 Exoc5Q3TPX4 708 aa27.26■■□□□ 1.95
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Afg3l2Q8JZQ2 802 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
Ltb-201ENSMUST00000025262 Akt1s1Q9D1F4 257 aa27.25■■□□□ 1.95
Ltb-201ENSMUST00000025262 CrklP47941 303 aa27.23■■□□□ 1.95
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rad23bP54728 416 aa27.23■■□□□ 1.95
Ltb-201ENSMUST00000025262 Q8BT18 775 aa27.23■■□□□ 1.95
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cabp4Q8VHC5 271 aa27.23■■□□□ 1.95
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ptpn23Q6PB44 1692 aa27.22■■□□□ 1.95
Ltb-201ENSMUST00000025262 OptnQ8K3K8 584 aa27.22■■□□□ 1.95
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cnga1P29974 684 aa27.2■■□□□ 1.94
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ciz1Q8VEH2 845 aa27.2■■□□□ 1.94
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slit1Q80TR4 1531 aa27.2■■□□□ 1.94
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rnf180Q3U827 592 aa27.19■■□□□ 1.94
Ltb-201ENSMUST00000025262 Hirip3Q8BLH7 601 aa27.19■■□□□ 1.94
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fam198bQ3UPI1 517 aa27.17■■□□□ 1.94
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zpr1Q62384 459 aa27.17■■□□□ 1.94
Ltb-201ENSMUST00000025262 Emilin1Q99K41 1017 aa27.17■■□□□ 1.94
Ltb-201ENSMUST00000025262 InsrP15208 1372 aa27.17■■□□□ 1.94
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sgip1Q8VD37 806 aa27.16■■□□□ 1.94
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tmem132eQ6IEE6 982 aa27.15■■□□□ 1.94
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ankrd13dQ6PD24 605 aa27.15■■□□□ 1.94
Ltb-201ENSMUST00000025262 Kcnh4A2A5F7 1018 aa27.14■■□□□ 1.94
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fchsd2Q3USJ8 740 aa27.13■■□□□ 1.93
Ltb-201ENSMUST00000025262 Plekhd1B2RPU2 505 aa27.12■■□□□ 1.93
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ano8Q6PB70 1060 aa27.11■■□□□ 1.93
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zdbf2Q5SS00 2493 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cdk12Q14AX6 1484 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sos2Q02384 1333 aa27.1■■□□□ 1.93
Ltb-201ENSMUST00000025262 Egfem1Q8C088 590 aa27.08■■□□□ 1.93
Ltb-201ENSMUST00000025262 IncenpQ9WU62 880 aa27.08■■□□□ 1.93
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zranb3Q6NZP1 1069 aa27.06■■□□□ 1.92
Ltb-201ENSMUST00000025262 FocadA2AKG8 1798 aa27.06■■□□□ 1.92
Ltb-201ENSMUST00000025262 Arfgef2A2A5R2 1792 aa27.05■■□□□ 1.92
Ltb-201ENSMUST00000025262 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ubr1O70481 1757 aa27.02■■□□□ 1.92
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rock2P70336 1388 aa26.99■■□□□ 1.91
Ltb-201ENSMUST00000025262 CemipQ8BI06 1361 aa26.99■■□□□ 1.91
Ltb-201ENSMUST00000025262 Col15a1O35206 1367 aa26.98■■□□□ 1.91
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Mtfr1lQ9CWE0 289 aa26.98■■□□□ 1.91
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cc2d1aQ8K1A6 943 aa26.97■■□□□ 1.91
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ppm1fQ8CGA0 452 aa26.95■■□□□ 1.9
Ltb-201ENSMUST00000025262 Kiaa0319lQ8K135 1048 aa26.95■■□□□ 1.9
Ltb-201ENSMUST00000025262 Magea6O89010 325 aa26.94■■□□□ 1.9
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rundc1Q0VDN7 615 aa26.94■■□□□ 1.9
Ltb-201ENSMUST00000025262 Magea3Q6T340 320 aa26.94■■□□□ 1.9
Ltb-201ENSMUST00000025262 Usp21Q9QZL6 566 aa26.94■■□□□ 1.9
Ltb-201ENSMUST00000025262 Scn7aB1AYL1 1681 aa26.94■■□□□ 1.9
Ltb-201ENSMUST00000025262 Chd4Q6PDQ2 1915 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rps6ka4Q9Z2B9 773 aa26.91■■□□□ 1.9
Ltb-201ENSMUST00000025262 TkfcQ8VC30 578 aa26.9■■□□□ 1.9
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fam50bQ9WTJ8 334 aa26.9■■□□□ 1.9
Ltb-201ENSMUST00000025262 Abca3Q8R420 1704 aa26.9■■□□□ 1.9
Ltb-201ENSMUST00000025262 Adgrb1Q3UHD1 1582 aa26.89■■□□□ 1.9
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zswim8Q3UHH1 1832 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
Ltb-201ENSMUST00000025262 Hoxc9P09633 260 aa26.89■■□□□ 1.9
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ahnak2E9PYB0 1738 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm10471E9Q1C7 252 aa26.88■■□□□ 1.89
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gpr162Q3UN16 588 aa26.87■■□□□ 1.89
Ltb-201ENSMUST00000025262 Chrna2Q91X60 512 aa26.87■■□□□ 1.89
Ltb-201ENSMUST00000025262 Map2P20357 1828 aa26.87■■□□□ 1.89
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm21680A0A0G2JGR8 267 aa26.86■■□□□ 1.89
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mrps5Q99N87 432 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
Ltb-201ENSMUST00000025262 Igsf1Q7TQA1 1317 aa26.83■■□□□ 1.89
Ltb-201ENSMUST00000025262 Shank3Q4ACU6 1730 aa26.82■■□□□ 1.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 MeiocA2AG06 965 aa26.82■■□□□ 1.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Scaf1Q5U4C3 1256 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Msl1Q6PDM1 616 aa26.82■■□□□ 1.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fam122aQ9DB52 284 aa26.82■■□□□ 1.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Hmgb2P30681 210 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Prom2Q3UUY6 835 aa26.8■■□□□ 1.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Col23a1Q8K4G2 532 aa26.8■■□□□ 1.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Jdp2P97875 163 aa26.79■■□□□ 1.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Klc3Q91W40 508 aa26.78■■□□□ 1.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Speer4bQ9D9F7 267 aa26.78■■□□□ 1.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mier1Q5UAK0 511 aa26.77■■□□□ 1.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Znrd1-asQ8R0E5 213 aa26.77■■□□□ 1.88
Ltb-201ENSMUST00000025262 Kcnn1Q9EQR3 537 aa26.76■■□□□ 1.87
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