RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001872.4

Hoxd13-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd13, Length 2,483 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ccdc146E9Q9F7 977 aa24,4■■□□□ 1,5
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Fez1Q8K0X8 392 aa24,4■■□□□ 1,5
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Nsd3Q6P2L6 1439 aa24,4■■□□□ 1,5
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 PaskQ8CEE6 1383 aa24,4■■□□□ 1,5
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP24,4■■□□□ 1,5
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Nrxn1Q9CS84 1514 aa24,39■■□□□ 1,5
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 ImpactO55091 318 aa24,39■■□□□ 1,49
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Lrrc7Q80TE7 1490 aa24,38■■□□□ 1,49
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ankrd44B2RXR6 993 aa24,38■■□□□ 1,49
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Trim27Q62158 513 aa24,37■■□□□ 1,49
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Zkscan1Q8BGS3 561 aaKnown RBP24,37■■□□□ 1,49
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 ScaperF8VQ70 1398 aaKnown RBP24,37■■□□□ 1,49
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP24,37■■□□□ 1,49
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm9992B2RWK3 458 aa24,37■■□□□ 1,49
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Unc93aQ710D3 458 aa24,37■■□□□ 1,49
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 4931400O07RikQ9D4M5 137 aa24,37■■□□□ 1,49
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Swt1Q9DBQ9 907 aa24,37■■□□□ 1,49
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cfap65Q3V0B4 1847 aa24,37■■□□□ 1,49
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 CenppQ9CZ92 286 aa24,36■■□□□ 1,49
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Prex1Q69ZK0 1650 aa24,35■■□□□ 1,49
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Vamp4O70480 141 aa24,35■■□□□ 1,49
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ppip5k2Q6ZQB6 1129 aa24,35■■□□□ 1,49
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Lemd3Q9WU40 921 aa24,35■■□□□ 1,49
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Becn1O88597 448 aa24,34■■□□□ 1,49
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Pank2Q3U4S0 443 aa24,34■■□□□ 1,49
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Q4VA45 678 aa24,34■■□□□ 1,49
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa24,34■■□□□ 1,49
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Chrna2Q91X60 512 aa24,33■■□□□ 1,49
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Senp3Q9EP97 568 aaKnown RBP24,33■■□□□ 1,49
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ift172Q6VH22 1749 aa24,32■■□□□ 1,48
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cdc37l1Q9CZP7 335 aa24,32■■□□□ 1,48
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Anapc15-psA0A140T8L6 141 aa24,32■■□□□ 1,48
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 IbspQ61711 324 aa24,32■■□□□ 1,48
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Pnma3Q8JZW8 466 aa24,32■■□□□ 1,48
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gzf1Q4VBD9 706 aa24,31■■□□□ 1,48
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Slc12a5Q91V14 1138 aa24,31■■□□□ 1,48
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Chmp4bQ9D8B3 224 aaKnown RBP24,31■■□□□ 1,48
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Mdc1Q5PSV9 1707 aa24,3■■□□□ 1,48
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Znf541Q0GGX2 1363 aa24,3■■□□□ 1,48
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ppp6r3Q922D4 844 aa24,3■■□□□ 1,48
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 PalmQ9Z0P4 383 aa24,29■■□□□ 1,48
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa24,29■■□□□ 1,48
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Zdhhc9P59268 364 aa24,29■■□□□ 1,48
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cgnl1Q6AW69 1298 aa24,28■■□□□ 1,48
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa24,28■■□□□ 1,48
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Aldh8a1Q8BH00 487 aa24,28■■□□□ 1,48
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Zfp91Q62511 572 aa24,27■■□□□ 1,48
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Atp7bQ64446 1462 aa24,27■■□□□ 1,48
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Eif4g2Q62448 906 aaKnown RBP24,27■■□□□ 1,48
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Stk26Q99JT2 416 aa24,26■■□□□ 1,47
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 FanclQ9CR14 375 aa24,26■■□□□ 1,47
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cyp27a1Q9DBG1 533 aa24,26■■□□□ 1,47
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Syce3B5KM66 88 aa24,26■■□□□ 1,47
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Nucb1Q02819 459 aaKnown RBP24,25■■□□□ 1,47
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 AglF8VPN4 1532 aa24,25■■□□□ 1,47
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 OvosQ3UU35 1456 aa24,25■■□□□ 1,47
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Zscan25B2RX31 543 aa24,25■■□□□ 1,47
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rbm27Q5SFM8 1060 aaKnown RBP24,25■■□□□ 1,47
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Slc52a2Q9D8F3 450 aa24,25■■□□□ 1,47
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Pdia3P27773 505 aaKnown RBP24,24■■□□□ 1,47
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Fchsd2Q3USJ8 740 aa24,24■■□□□ 1,47
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rcan3Q9JKK0 239 aa24,23■■□□□ 1,47
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gdpd2Q9ESM6 539 aa24,23■■□□□ 1,47
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Atp10aO54827 1508 aa24,22■■□□□ 1,47
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gcc1Q9D4H2 778 aa24,22■■□□□ 1,47
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Prdm2A2A7B5 1709 aaKnown RBP24,21■■□□□ 1,47
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Lekr1B2RVN1 116 aa24,21■■□□□ 1,47
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rnf214Q8BFU3 668 aaKnown RBP24,21■■□□□ 1,47
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gadd45bP22339 160 aa24,2■■□□□ 1,46
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 NinlQ6ZQ12 1394 aa24,2■■□□□ 1,46
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Usp32F8VPZ3 1604 aa24,2■■□□□ 1,46
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 HnrnpuQ8VEK3 800 aaKnown RBP24,2■■□□□ 1,46
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cul9Q80TT8 1865 aa24,19■■□□□ 1,46
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 E4f1Q8CCE9 783 aa24,19■■□□□ 1,46
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Mindy4Q3UQI9 744 aa24,19■■□□□ 1,46
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Elp1Q7TT37 1333 aaKnown RBP24,19■■□□□ 1,46
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Kdm4aQ8BW72 1064 aa24,18■■□□□ 1,46
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gnai1B2RSH2 354 aa24,18■■□□□ 1,46
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gnai3Q9DC51 354 aa24,18■■□□□ 1,46
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tecpr2Q3UH45 1423 aa24,18■■□□□ 1,46
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Triml2E9PW10 424 aa24,17■■□□□ 1,46
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gys2Q8VCB3 704 aa24,17■■□□□ 1,46
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Smarca5Q91ZW3 1051 aaKnown RBP24,17■■□□□ 1,46
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ric3Q8BPM6 367 aa24,16■■□□□ 1,46
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 PtmsQ9D0J8 101 aaKnown RBP24,16■■□□□ 1,46
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Mcm2P97310 904 aa24,16■■□□□ 1,46
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 AdgbG3UZ78 1657 aa24,16■■□□□ 1,46
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gripap1Q8VD04 806 aa24,15■■□□□ 1,46
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Usp16Q99LG0 825 aa24,15■■□□□ 1,46
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Trim28Q62318 834 aa24,15■■□□□ 1,46
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 MarsQ68FL6 902 aaKnown RBP24,14■■□□□ 1,45
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Fam13aQ8BGI4 693 aa24,13■■□□□ 1,45
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 NcapgE9PWG6 1004 aa24,13■■□□□ 1,45
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gsto1O09131 240 aa24,13■■□□□ 1,45
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gli2Q0VGT2 1544 aa24,13■■□□□ 1,45
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Dhx30Q99PU8 1217 aaKnown RBP24,12■■□□□ 1,45
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Kif4P33174 1231 aa24,12■■□□□ 1,45
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 U2surpQ6NV83 1029 aaKnown RBP24,12■■□□□ 1,45
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Zkscan16A2ALW2 728 aa24,11■■□□□ 1,45
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa24,11■■□□□ 1,45
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 15,9 ms