RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001872.4

Hoxd13-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd13, Length 2,483 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 NischQ80TM9 1593 aa35.6■■■■□ 3.29
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa35.31■■■■□ 3.24
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Abcc9P70170 1546 aa34.65■■■■□ 3.14
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rtl1Q7M732 1744 aa34.09■■■■□ 3.05
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rhox8Q6VSS7 320 aa34.02■■■■□ 3.04
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Abcc8B2RUS7 1588 aa33.9■■■■□ 3.02
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ccdc180J3QNE4 1664 aa33.74■■■□□ 2.99
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa33.68■■■□□ 2.98
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Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP32.77■■■□□ 2.84
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP32.33■■■□□ 2.77
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Dcaf1Q80TR8 1506 aa32.11■■■□□ 2.73
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Pcgf6Q99NA9 353 aa32.1■■■□□ 2.73
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 HrcG5E8J6 738 aa32.07■■■□□ 2.72
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 ScribQ80U72 1612 aa32.01■■■□□ 2.71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa31.49■■■□□ 2.63
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Trim41Q5NCC3 630 aa31.36■■■□□ 2.61
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP31.32■■■□□ 2.6
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa31.24■■■□□ 2.59
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Kdm5dQ62240 1548 aa31.1■■■□□ 2.57
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 NacadQ5SWP3 1504 aa30.98■■■□□ 2.55
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Neurod1Q60867 357 aa30.93■■■□□ 2.54
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Baz1aO88379 1555 aa30.88■■■□□ 2.53
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cep164Q5DU05 1446 aa30.84■■■□□ 2.53
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Zeb1Q64318 1117 aa30.54■■■□□ 2.48
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Crybg2B7ZCC2 1516 aa30.44■■■□□ 2.46
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Sycp2Q9CUU3 1500 aa30.37■■■□□ 2.45
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 NefmP08553 848 aa30.36■■■□□ 2.45
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cngb1E1AZ71 1325 aa30.32■■■□□ 2.44
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Smarca2Q6DIC0 1577 aa30.28■■■□□ 2.44
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Sall2Q9QX96 1004 aa30.26■■■□□ 2.43
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Mier1Q5UAK0 511 aa30.24■■■□□ 2.43
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Chic1Q8CBW7 227 aa30.19■■■□□ 2.42
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gab3Q8BSM5 595 aa30.17■■■□□ 2.42
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Anks4bQ8K3X6 423 aa30.05■■■□□ 2.4
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa30.04■■■□□ 2.4
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Csrnp3P59055 597 aa29.91■■■□□ 2.38
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 BicraF8VPZ9 1578 aa29.91■■■□□ 2.38
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa29.84■■■□□ 2.37
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Golga3P55937 1487 aa29.62■■■□□ 2.33
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Wdr66E9Q743 1299 aa29.61■■■□□ 2.33
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Aplp2Q06335 707 aa29.48■■■□□ 2.31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 UbtfP25976 765 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 ClspnQ80YR7 1315 aa29.44■■■□□ 2.3
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa29.4■■■□□ 2.3
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 CenpbP27790 599 aa29.36■■■□□ 2.29
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Myt1Q8CFC2 1127 aa29.32■■■□□ 2.28
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Synj1Q8CHC4 1574 aa29.32■■■□□ 2.28
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa29.29■■■□□ 2.28
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Top2bQ64511 1612 aa29.14■■■□□ 2.26
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm38655A0A286YDK6 273 aa29.1■■■□□ 2.25
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 TonslQ6NZL6 1363 aa29.06■■■□□ 2.24
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa29.06■■■□□ 2.24
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 CftrP26361 1476 aa29.01■■■□□ 2.23
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa28.92■■■□□ 2.22
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa28.9■■■□□ 2.22
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cep162Q6ZQ06 1403 aa28.82■■■□□ 2.2
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Myt1lP97500 1187 aa28.82■■■□□ 2.2
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa28.66■■■□□ 2.18
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa28.64■■■□□ 2.17
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Fmn1Q05860 1466 aa28.63■■■□□ 2.17
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Clip1Q922J3 1391 aa28.58■■■□□ 2.17
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Fam71e1A1L3C1 212 aa28.55■■■□□ 2.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa28.55■■■□□ 2.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tnnt3Q9QZ47 272 aa28.49■■■□□ 2.15
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Npm2Q80W85 207 aa28.47■■■□□ 2.15
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa28.46■■■□□ 2.15
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.13
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa28.38■■■□□ 2.13
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa28.37■■■□□ 2.13
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Eid3Q3V124 375 aa28.36■■■□□ 2.13
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ercc6F8VPZ5 1481 aa28.3■■■□□ 2.12
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Kdm5bQ80Y84 1544 aa28.3■■■□□ 2.12
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Bcl11aQ9QYE3 773 aa28.23■■■□□ 2.11
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Frmpd1A2AKB4 1549 aa28.18■■■□□ 2.1
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Wdr62Q3U3T8 1523 aa28.18■■■□□ 2.1
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Znf710Q3U288 666 aa28.14■■■□□ 2.1
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Arap1Q4LDD4 1452 aa28.13■■■□□ 2.09
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rpap1Q80TE0 1409 aa28.12■■■□□ 2.09
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Arhgap35Q91YM2 1499 aa28.08■■■□□ 2.09
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Eea1Q8BL66 1411 aa28.06■■■□□ 2.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Anp32aO35381 247 aa28.06■■■□□ 2.08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa28■■■□□ 2.07
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ccdc18Q640L5 1455 aa28■■■□□ 2.07
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Baz1bQ9Z277 1479 aa27.98■■■□□ 2.07
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