RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001872.4

Hoxd13-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd13, Length 2,483 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 NischQ80TM9 1593 aa35,6■■■■□ 3,29
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa35,31■■■■□ 3,24
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Abcc9P70170 1546 aa34,65■■■■□ 3,14
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rtl1Q7M732 1744 aa34,09■■■■□ 3,05
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rhox8Q6VSS7 320 aa34,02■■■■□ 3,04
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Abcc8B2RUS7 1588 aa33,9■■■■□ 3,02
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ccdc180J3QNE4 1664 aa33,74■■■□□ 2,99
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa33,68■■■□□ 2,98
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP32,85■■■□□ 2,85
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP32,77■■■□□ 2,84
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP32,33■■■□□ 2,77
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Dcaf1Q80TR8 1506 aa32,11■■■□□ 2,73
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Pcgf6Q99NA9 353 aa32,1■■■□□ 2,73
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 HrcG5E8J6 738 aa32,07■■■□□ 2,72
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 ScribQ80U72 1612 aa32,01■■■□□ 2,71
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa31,49■■■□□ 2,63
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Trim41Q5NCC3 630 aa31,36■■■□□ 2,61
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP31,32■■■□□ 2,6
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa31,24■■■□□ 2,59
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Kdm5dQ62240 1548 aa31,1■■■□□ 2,57
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 NacadQ5SWP3 1504 aa30,98■■■□□ 2,55
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Neurod1Q60867 357 aa30,93■■■□□ 2,54
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Baz1aO88379 1555 aa30,88■■■□□ 2,53
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cep164Q5DU05 1446 aa30,84■■■□□ 2,53
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Zeb1Q64318 1117 aa30,54■■■□□ 2,48
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Crybg2B7ZCC2 1516 aa30,44■■■□□ 2,46
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Sycp2Q9CUU3 1500 aa30,37■■■□□ 2,45
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP30,37■■■□□ 2,45
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 NefmP08553 848 aa30,36■■■□□ 2,45
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cngb1E1AZ71 1325 aa30,32■■■□□ 2,44
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Smarca2Q6DIC0 1577 aa30,28■■■□□ 2,44
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Sall2Q9QX96 1004 aa30,26■■■□□ 2,43
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Mier1Q5UAK0 511 aa30,24■■■□□ 2,43
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Chic1Q8CBW7 227 aa30,19■■■□□ 2,42
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP30,18■■■□□ 2,42
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gab3Q8BSM5 595 aa30,17■■■□□ 2,42
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Anks4bQ8K3X6 423 aa30,05■■■□□ 2,4
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa30,04■■■□□ 2,4
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Csrnp3P59055 597 aa29,91■■■□□ 2,38
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 BicraF8VPZ9 1578 aa29,91■■■□□ 2,38
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa29,84■■■□□ 2,37
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP29,64■■■□□ 2,34
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Golga3P55937 1487 aa29,62■■■□□ 2,33
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Wdr66E9Q743 1299 aa29,61■■■□□ 2,33
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP29,6■■■□□ 2,33
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP29,52■■■□□ 2,32
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Aplp2Q06335 707 aa29,48■■■□□ 2,31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP29,46■■■□□ 2,31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 UbtfP25976 765 aaKnown RBP29,44■■■□□ 2,3
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 ClspnQ80YR7 1315 aa29,44■■■□□ 2,3
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa29,4■■■□□ 2,3
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 CenpbP27790 599 aa29,36■■■□□ 2,29
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Myt1Q8CFC2 1127 aa29,32■■■□□ 2,28
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Synj1Q8CHC4 1574 aa29,32■■■□□ 2,28
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa29,29■■■□□ 2,28
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Top2bQ64511 1612 aa29,14■■■□□ 2,26
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm38655A0A286YDK6 273 aa29,1■■■□□ 2,25
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP29,1■■■□□ 2,25
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 TonslQ6NZL6 1363 aa29,06■■■□□ 2,24
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa29,06■■■□□ 2,24
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 CftrP26361 1476 aa29,01■■■□□ 2,23
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa28,92■■■□□ 2,22
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa28,9■■■□□ 2,22
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP28,87■■■□□ 2,21
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP28,84■■■□□ 2,21
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cep162Q6ZQ06 1403 aa28,82■■■□□ 2,2
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Myt1lP97500 1187 aa28,82■■■□□ 2,2
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP28,72■■■□□ 2,19
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP28,71■■■□□ 2,19
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa28,66■■■□□ 2,18
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa28,64■■■□□ 2,17
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Fmn1Q05860 1466 aa28,63■■■□□ 2,17
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP28,61■■■□□ 2,17
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Clip1Q922J3 1391 aa28,58■■■□□ 2,17
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Fam71e1A1L3C1 212 aa28,55■■■□□ 2,16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa28,55■■■□□ 2,16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP28,54■■■□□ 2,16
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tnnt3Q9QZ47 272 aa28,49■■■□□ 2,15
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Npm2Q80W85 207 aa28,47■■■□□ 2,15
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa28,46■■■□□ 2,15
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP28,41■■■□□ 2,14
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP28,39■■■□□ 2,13
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa28,38■■■□□ 2,13
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa28,37■■■□□ 2,13
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Eid3Q3V124 375 aa28,36■■■□□ 2,13
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP28,34■■■□□ 2,13
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ercc6F8VPZ5 1481 aa28,3■■■□□ 2,12
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Kdm5bQ80Y84 1544 aa28,3■■■□□ 2,12
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Bcl11aQ9QYE3 773 aa28,23■■■□□ 2,11
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Frmpd1A2AKB4 1549 aa28,18■■■□□ 2,1
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Wdr62Q3U3T8 1523 aa28,18■■■□□ 2,1
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Znf710Q3U288 666 aa28,14■■■□□ 2,1
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Arap1Q4LDD4 1452 aa28,13■■■□□ 2,09
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rpap1Q80TE0 1409 aa28,12■■■□□ 2,09
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Arhgap35Q91YM2 1499 aa28,08■■■□□ 2,09
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Eea1Q8BL66 1411 aa28,06■■■□□ 2,08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Anp32aO35381 247 aa28,06■■■□□ 2,08
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa28■■■□□ 2,07
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ccdc18Q640L5 1455 aa28■■■□□ 2,07
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Baz1bQ9Z277 1479 aa27,98■■■□□ 2,07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 9,5 ms