Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN4

Agl, Amylo-1,6-glucosidase, 4-alpha-glucanotransferase, mousemouse

Predictions only

Length 1,532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AglF8VPN4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC61,46■■■■■ 7,43
AglF8VPN4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC57,33■■■■■ 6,77
AglF8VPN4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56,17■■■■■ 6,58
AglF8VPN4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC53,83■■■■■ 6,21
AglF8VPN4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC52,91■■■■■ 6,06
AglF8VPN4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52■■■■■ 5,92
AglF8VPN4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC51,74■■■■■ 5,87
AglF8VPN4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC51,72■■■■■ 5,87
AglF8VPN4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51,56■■■■■ 5,84
AglF8VPN4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51,49■■■■■ 5,83
AglF8VPN4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC51,17■■■■■ 5,78
AglF8VPN4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC50,36■■■■■ 5,65
AglF8VPN4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,96■■■■■ 5,59
AglF8VPN4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC49,9■■■■■ 5,58
AglF8VPN4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC49,84■■■■■ 5,57
AglF8VPN4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,62■■■■■ 5,53
AglF8VPN4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,32■■■■■ 5,49
AglF8VPN4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,03■■■■■ 5,44
AglF8VPN4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,84■■■■■ 5,41
AglF8VPN4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC48,83■■■■■ 5,41
AglF8VPN4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC48,82■■■■■ 5,41
AglF8VPN4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC48,78■■■■■ 5,4
AglF8VPN4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47,94■■■■■ 5,26
AglF8VPN4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC47,71■■■■■ 5,23
AglF8VPN4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47,56■■■■■ 5,2
AglF8VPN4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,56■■■■■ 5,2
AglF8VPN4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47,49■■■■■ 5,19
AglF8VPN4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,3■■■■■ 5,16
AglF8VPN4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC47,17■■■■■ 5,14
AglF8VPN4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC47,05■■■■■ 5,12
AglF8VPN4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,04■■■■■ 5,12
AglF8VPN4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC47,01■■■■■ 5,12
AglF8VPN4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,92■■■■■ 5,1
AglF8VPN4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC46,67■■■■■ 5,06
AglF8VPN4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC46,66■■■■■ 5,06
AglF8VPN4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46,47■■■■■ 5,03
AglF8VPN4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC46,43■■■■■ 5,02
AglF8VPN4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC46,42■■■■■ 5,02
AglF8VPN4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,4■■■■■ 5,02
AglF8VPN4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46,39■■■■■ 5,02
AglF8VPN4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46,32■■■■■ 5,01
AglF8VPN4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC46,27■■■■■ 5
AglF8VPN4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46,26■■■■■ 5
AglF8VPN4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,2■■■■■ 4,99
AglF8VPN4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC46,19■■■■■ 4,98
AglF8VPN4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC46,18■■■■■ 4,98
AglF8VPN4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46,08■■■■■ 4,97
AglF8VPN4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,04■■■■■ 4,96
AglF8VPN4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC46■■■■■ 4,95
AglF8VPN4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC45,93■■■■■ 4,94
AglF8VPN4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC45,93■■■■■ 4,94
AglF8VPN4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC45,84■■■■■ 4,93
AglF8VPN4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,78■■■■■ 4,92
AglF8VPN4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC45,59■■■■■ 4,89
AglF8VPN4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC45,59■■■■■ 4,89
AglF8VPN4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC45,43■■■■■ 4,86
AglF8VPN4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,43■■■■■ 4,86
AglF8VPN4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,16■■■■■ 4,82
AglF8VPN4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC45,14■■■■■ 4,82
AglF8VPN4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC45,14■■■■■ 4,82
AglF8VPN4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,08■■■■■ 4,81
AglF8VPN4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC45,05■■■■■ 4,8
AglF8VPN4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,93■■■■■ 4,78
AglF8VPN4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44,84■■■■■ 4,77
AglF8VPN4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC44,78■■■■■ 4,76
AglF8VPN4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC44,77■■■■■ 4,76
AglF8VPN4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC44,77■■■■■ 4,76
AglF8VPN4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC44,65■■■■■ 4,74
AglF8VPN4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,65■■■■■ 4,74
AglF8VPN4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44,62■■■■■ 4,73
AglF8VPN4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44,53■■■■■ 4,72
AglF8VPN4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,51■■■■■ 4,72
AglF8VPN4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC44,48■■■■■ 4,71
AglF8VPN4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC44,45■■■■■ 4,71
AglF8VPN4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44,41■■■■■ 4,7
AglF8VPN4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44,4■■■■■ 4,7
AglF8VPN4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,32■■■■■ 4,68
AglF8VPN4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,13■■■■■ 4,65
AglF8VPN4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC44,03■■■■■ 4,64
AglF8VPN4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC43,99■■■■■ 4,63
AglF8VPN4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,9■■■■■ 4,62
AglF8VPN4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43,89■■■■■ 4,62
AglF8VPN4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC43,89■■■■■ 4,62
AglF8VPN4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,86■■■■■ 4,61
AglF8VPN4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,81■■■■■ 4,6
AglF8VPN4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC43,79■■■■■ 4,6
AglF8VPN4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,78■■■■■ 4,6
AglF8VPN4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC43,76■■■■■ 4,6
AglF8VPN4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43,76■■■■■ 4,6
AglF8VPN4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43,75■■■■■ 4,59
AglF8VPN4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC43,75■■■■■ 4,59
AglF8VPN4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC43,73■■■■■ 4,59
AglF8VPN4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC43,73■■■■■ 4,59
AglF8VPN4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,73■■■■■ 4,59
AglF8VPN4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC43,72■■■■■ 4,59
AglF8VPN4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43,69■■■■■ 4,59
AglF8VPN4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC43,68■■■■■ 4,58
AglF8VPN4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43,67■■■■■ 4,58
AglF8VPN4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43,63■■■■■ 4,58
AglF8VPN4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC43,54■■■■■ 4,56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms