RNA–Protein interactions for RNA: YMR179W

SPT21, Transcript of Protein with a role in transcriptional silencing, yeast

Gene SPT21, Length 2,277 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPT21	YMR179W	PAN5	P38787	379 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SPT21	YMR179W	BOL3	P39724	118 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SPT21	YMR179W	YLR122C	Q12312	125 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SPT21	YMR179W	HVG1	P0CE11	249 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SPT21	YMR179W	OMA1	P36163	345 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SPT21	YMR179W	LEM3	P42838	414 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SPT21	YMR179W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SPT21	YMR179W	TRP3	P00937	484 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SPT21	YMR179W	YKR073C	P36153	106 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SPT21	YMR179W	RAD55	P38953	406 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SPT21	YMR179W	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SPT21	YMR179W	REC8	Q12188	680 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SPT21	YMR179W	COQ2	P32378	372 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SPT21	YMR179W	KAE1	P36132	386 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SPT21	YMR179W	SAF1	P38352	637 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SPT21	YMR179W	PSY2	P40164	858 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SPT21	YMR179W	SMC1	P32908	1225 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SPT21	YMR179W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SPT21	YMR179W	YNR065C	P53751	1116 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SPT21	YMR179W	RLF2	Q12495	606 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SPT21	YMR179W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SPT21	YMR179W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.18	□□□□□ -1.9	not detected
SPT21	YMR179W	MED7	Q08278	222 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SPT21	YMR179W	GLO4	Q12320	285 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SPT21	YMR179W	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SPT21	YMR179W	YJR124C	P47159	448 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SPT21	YMR179W	NCE103	P53615	221 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SPT21	YMR179W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SPT21	YMR179W	CTH1	P47976	325 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SPT21	YMR179W	CTR9	P89105	1077 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SPT21	YMR179W	SPO71	Q03868	1245 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SPT21	YMR179W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SPT21	YMR179W	AKR1	P39010	764 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SPT21	YMR179W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SPT21	YMR179W	ELG1	Q12050	791 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SPT21	YMR179W	CHS2	P14180	963 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SPT21	YMR179W	ERS1	P17261	260 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SPT21	YMR179W	COB	P00163	385 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SPT21	YMR179W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.15	□□□□□ -1.91	not detected
SPT21	YMR179W	TOS1	P38288	455 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SPT21	YMR179W	YGR130C	P53278	816 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SPT21	YMR179W	NEO1	P40527	1151 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SPT21	YMR179W	RSC4	Q02206	625 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SPT21	YMR179W	SPO74	P45819	413 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SPT21	YMR179W	FET4	P40988	552 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SPT21	YMR179W	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SPT21	YMR179W	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SPT21	YMR179W	BRE4	Q07660	1125 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SPT21	YMR179W	CYC7	P00045	113 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SPT21	YMR179W	QDR1	P40475	563 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SPT21	YMR179W	ATG1	P53104	897 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SPT21	YMR179W	UFD2	P54860	961 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SPT21	YMR179W	KAR5	Q04746	504 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SPT21	YMR179W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SPT21	YMR179W	LIP5	P32875	414 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SPT21	YMR179W	DUR3	P33413	735 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SPT21	YMR179W	RIM11	P38615	370 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SPT21	YMR179W	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SPT21	YMR179W	MNL2	Q12205	849 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SPT21	YMR179W	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SPT21	YMR179W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SPT21	YMR179W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SPT21	YMR179W	SEA4	P38164	1038 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SPT21	YMR179W	IRC24	P40580	263 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SPT21	YMR179W	AVT1	P47082	602 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SPT21	YMR179W	ACF4	P47129	309 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SPT21	YMR179W	FAR11	P53917	953 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SPT21	YMR179W	GIC2	Q06648	383 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SPT21	YMR179W	NPR1	P22211	790 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SPT21	YMR179W	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SPT21	YMR179W	MSH6	Q03834	1242 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SPT21	YMR179W	YOR223W	Q12015	292 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SPT21	YMR179W	TRS120	Q04183	1289 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SPT21	YMR179W	YIG1	Q08956	461 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SPT21	YMR179W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SPT21	YMR179W	SAP155	P43612	1002 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SPT21	YMR179W	GCV1	P48015	400 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SPT21	YMR179W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.92
SPT21	YMR179W	ELM1	P32801	640 aa		3.09	□□□□□ -1.92
SPT21	YMR179W	YNL011C	P53980	444 aa		3.09	□□□□□ -1.92
SPT21	YMR179W	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SPT21	YMR179W	GPT2	P36148	743 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SPT21	YMR179W	CDC55	Q00362	526 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SPT21	YMR179W	SDH1	Q00711	640 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SPT21	YMR179W	AOS1	Q06624	347 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SPT21	YMR179W	FLP1	P03870	423 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SPT21	YMR179W	YMR074C	Q04773	145 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SPT21	YMR179W	BSC2	Q05611	235 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SPT21	YMR179W	MMM1	P41800	426 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SPT21	YMR179W	MDJ2	P42834	146 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SPT21	YMR179W	MEC3	Q02574	474 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SPT21	YMR179W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SPT21	YMR179W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SPT21	YMR179W	GPI13	Q07830	1017 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SPT21	YMR179W	YLL054C	Q12244	843 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SPT21	YMR179W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SPT21	YMR179W	CIT3	P43635	486 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SPT21	YMR179W	NUT1	P53114	1132 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SPT21	YMR179W	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
SPT21	YMR179W	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92

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