RNA–Protein interactions for RNA: YMR063W

RIM9, Transcript of Plasma membrane protein of unknown function, yeast

Gene RIM9, Length 720 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RIM9	YMR063W	DNF2	Q12675	1612 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RIM9	YMR063W	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RIM9	YMR063W	QDR1	P40475	563 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RIM9	YMR063W	CUZ1	P53899	274 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RIM9	YMR063W	YML020W	Q03722	664 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RIM9	YMR063W	LSO1	Q3E827	93 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RIM9	YMR063W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
RIM9	YMR063W	KAP122	P32767	1081 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RIM9	YMR063W	KTR2	P33550	425 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RIM9	YMR063W	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RIM9	YMR063W	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RIM9	YMR063W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RIM9	YMR063W	RGP1	P16664	663 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RIM9	YMR063W	LDH1	P38139	375 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RIM9	YMR063W	ATG1	P53104	897 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RIM9	YMR063W	DOP1	Q03921	1698 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RIM9	YMR063W	NUP170	P38181	1502 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RIM9	YMR063W	TY3B-G	Q99315	1547 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RIM9	YMR063W	YBT1	P32386	1661 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RIM9	YMR063W	DIT1	P21623	536 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RIM9	YMR063W	BSD2	P38356	321 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RIM9	YMR063W	MDJ2	P42834	146 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RIM9	YMR063W	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RIM9	YMR063W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RIM9	YMR063W	DYS1	P38791	387 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RIM9	YMR063W	APC11	Q12157	165 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RIM9	YMR063W	RPC31	P17890	251 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM9	YMR063W	MSN1	P22148	382 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM9	YMR063W	HXT8	P40886	569 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM9	YMR063W	SPR3	P41901	512 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM9	YMR063W	YNR040W	P53736	256 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM9	YMR063W	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RIM9	YMR063W	STH1	P32597	1359 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM9	YMR063W	DRS2	P39524	1355 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM9	YMR063W	MMS1	Q06211	1407 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM9	YMR063W	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RIM9	YMR063W	PDR10	P51533	1564 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM9	YMR063W	YHL050C	P38721	697 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM9	YMR063W	YHR219W	P38900	624 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM9	YMR063W	CEM1	P39525	442 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM9	YMR063W	HPF1	Q05164	967 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM9	YMR063W	FRT1	Q99332	602 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM9	YMR063W	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RIM9	YMR063W	YOR296W	Q08748	1289 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RIM9	YMR063W	FPS1	P23900	669 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RIM9	YMR063W	GIP1	P38229	639 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RIM9	YMR063W	RGD2	P43556	714 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RIM9	YMR063W	ACF4	P47129	309 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RIM9	YMR063W	SKP1	P52286	194 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RIM9	YMR063W	ITC1	P53125	1264 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RIM9	YMR063W	NUT2	Q06213	157 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RIM9	YMR063W	SYT1	Q06836	1226 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RIM9	YMR063W	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RIM9	YMR063W	IQG1	Q12280	1495 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RIM9	YMR063W	ISW1	P38144	1129 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RIM9	YMR063W	MSC7	P38694	644 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RIM9	YMR063W	APM2	P38700	605 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RIM9	YMR063W	IPL1	P38991	367 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RIM9	YMR063W	FIR1	P40020	876 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RIM9	YMR063W	YGR035C	P53222	116 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RIM9	YMR063W	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RIM9	YMR063W	TRM3	Q07527	1436 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RIM9	YMR063W	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RIM9	YMR063W	RAD55	P38953	406 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RIM9	YMR063W	MET10	P39692	1035 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RIM9	YMR063W	YPL062W	Q02781	134 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RIM9	YMR063W	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RIM9	YMR063W	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RIM9	YMR063W	TRS120	Q04183	1289 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RIM9	YMR063W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RIM9	YMR063W	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RIM9	YMR063W	BUD3	P25558	1636 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RIM9	YMR063W	SMC1	P32908	1225 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RIM9	YMR063W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RIM9	YMR063W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RIM9	YMR063W	THI12	P42883	340 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RIM9	YMR063W	THI5	P43534	340 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RIM9	YMR063W	THI11	P47183	340 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RIM9	YMR063W	UFD2	P54860	961 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RIM9	YMR063W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RIM9	YMR063W	THI13	Q07748	340 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RIM9	YMR063W	GPI13	Q07830	1017 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RIM9	YMR063W	MNL2	Q12205	849 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RIM9	YMR063W	YOR093C	Q12275	1648 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RIM9	YMR063W	MRP10	O75012	95 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RIM9	YMR063W	IDI1	P15496	288 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RIM9	YMR063W	SLD2	P34252	453 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RIM9	YMR063W	AIM46	P38885	310 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RIM9	YMR063W	PSY2	P40164	858 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RIM9	YMR063W	NTA1	P40354	457 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RIM9	YMR063W	PRK1	P40494	810 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RIM9	YMR063W	JJJ3	P47138	172 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RIM9	YMR063W	LYS5	P50113	272 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RIM9	YMR063W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RIM9	YMR063W	WHI5	Q12416	295 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RIM9	YMR063W	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RIM9	YMR063W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RIM9	YMR063W	YIL165C	P40446	119 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RIM9	YMR063W	YJL181W	P46987	611 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RIM9	YMR063W	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64

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