RNA–Protein interactions for RNA: YML063W

RPS1B, Transcript of Ribosomal protein 10 (rp10) of the small (40S) subunit, yeast

Gene RPS1B, Length 768 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS1B	YML063W	SCW11	P53189	542 aa		5.42	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	YOR131C	Q12486	218 aa		5.42	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	DOP1	Q03921	1698 aa		5.42	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	DNF2	Q12675	1612 aa		5.41	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	ARG82	P07250	355 aa		5.41	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	MNR2	P35724	969 aa		5.41	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	MNN4	P36044	1178 aa		5.41	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	BOL3	P39724	118 aa		5.41	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	QDR1	P40475	563 aa		5.41	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	GAS4	Q08271	471 aa		5.41	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		5.41	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	MLP2	P40457	1679 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	SPR3	P41901	512 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	EMP47	P43555	445 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	LSO1	Q3E827	93 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RPS1B	YML063W	ULS1	Q08562	1619 aa		5.39	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	DLD1	P32891	587 aa		5.39	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	FYV10	P40492	516 aa		5.39	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	YJR098C	P47139	656 aa		5.39	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	LSC2	P53312	427 aa		5.39	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	YPR084W	Q06821	456 aa		5.39	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	PUN1	Q06991	263 aa		5.39	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	FRT1	Q99332	602 aa		5.39	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	MMS1	Q06211	1407 aa		5.39	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	MYO4	P32492	1471 aa		5.39	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	5.38	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	ROM1	P53046	1155 aa		5.38	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	VAN1	P23642	535 aa		5.37	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.37	□□□□□ -1.55	not detected
RPS1B	YML063W	MNN1	P39106	762 aa		5.37	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	MDG1	P53885	366 aa		5.37	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	TRS120	Q04183	1289 aa		5.37	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	BDF2	Q07442	638 aa		5.37	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	FRA1	Q07825	749 aa		5.37	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	TSC13	Q99190	310 aa		5.37	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	TRS33	Q99394	268 aa		5.37	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	NUP170	P38181	1502 aa		5.37	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	TEC1	P18412	486 aa		5.36	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	DPB3	P27344	201 aa		5.36	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	MKS1	P34072	584 aa		5.36	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	UBP12	P39538	1254 aa		5.36	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	YGR035C	P53222	116 aa		5.36	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	UBP2	Q01476	1272 aa		5.36	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	DFG5	Q05031	458 aa		5.36	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	YOL057W	Q08225	711 aa		5.36	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	TCB1	Q12466	1186 aa		5.36	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	DRS2	P39524	1355 aa		5.35	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	TRK2	P28584	889 aa		5.35	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	BOI2	P39969	1040 aa		5.35	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	HPF1	Q05164	967 aa		5.35	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	MRC1	P25588	1096 aa		5.34	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	VPS35	P34110	944 aa		5.34	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	YFL034W	P43564	1073 aa		5.34	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	YDL121C	Q07541	149 aa		5.34	□□□□□ -1.55
RPS1B	YML063W	KAR1	P11927	433 aa		5.33	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	GUT2	P32191	649 aa		5.33	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	5.33	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	5.33	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	PAF1	P38351	445 aa		5.33	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	5.33	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	ROG3	P43602	733 aa		5.33	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	APL6	P46682	809 aa		5.33	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	TY4A-J	P47023	414 aa		5.33	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	YJR142W	P47173	342 aa		5.33	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	UFD2	P54860	961 aa		5.33	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	5.33	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	CCP1	P00431	361 aa		5.32	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	FBP26	P32604	452 aa		5.32	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	5.32	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	GRX7	P38068	203 aa		5.32	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	OSH7	P38755	437 aa		5.32	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		5.32	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	5.32	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	GDB1	Q06625	1536 aa		5.32	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	SNT2	P53127	1403 aa		5.31	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	STE6	P12866	1290 aa		5.31	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.31	□□□□□ -1.56	not detected
RPS1B	YML063W	MCM2	P29469	868 aa		5.31	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	ISF1	P32488	338 aa		5.31	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	PET112	P33893	541 aa		5.31	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	TAT2	P38967	592 aa		5.31	□□□□□ -1.56

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