RNA–Protein interactions for RNA: YHR066W

SSF1, Transcript of Constituent of 66S pre-ribosomal particles, yeast

Gene SSF1, Length 1,362 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SSF1	YHR066W	MRP10	O75012	95 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SSF1	YHR066W	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SSF1	YHR066W	PSY2	P40164	858 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SSF1	YHR066W	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SSF1	YHR066W	GPI13	Q07830	1017 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SSF1	YHR066W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SSF1	YHR066W	AIM46	P38885	310 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SSF1	YHR066W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SSF1	YHR066W	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SSF1	YHR066W	RSC4	Q02206	625 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SSF1	YHR066W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SSF1	YHR066W	NHA1	Q99271	985 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SSF1	YHR066W	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SSF1	YHR066W	YBR287W	P38355	427 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SSF1	YHR066W	IPL1	P38991	367 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SSF1	YHR066W	PPT1	P53043	513 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SSF1	YHR066W	YNL011C	P53980	444 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SSF1	YHR066W	WHI5	Q12416	295 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SSF1	YHR066W	CTR9	P89105	1077 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SSF1	YHR066W	ALG14	P38242	237 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SSF1	YHR066W	PPX1	P38698	397 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SSF1	YHR066W	CDC55	Q00362	526 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SSF1	YHR066W	COB	P00163	385 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SSF1	YHR066W	AI3	P03877	415 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SSF1	YHR066W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SSF1	YHR066W	YJL181W	P46987	611 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SSF1	YHR066W	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SSF1	YHR066W	SEC20	P28791	383 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSF1	YHR066W	MET4	P32389	672 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSF1	YHR066W	SLD2	P34252	453 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSF1	YHR066W	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SSF1	YHR066W	ALD3	P54114	506 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSF1	YHR066W	BSC2	Q05611	235 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSF1	YHR066W	RSC2	Q06488	889 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSF1	YHR066W	GAS5	Q08193	484 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SSF1	YHR066W	DUR3	P33413	735 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSF1	YHR066W	TFA2	P36145	328 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSF1	YHR066W	YKR073C	P36153	106 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSF1	YHR066W	GIS4	Q04233	774 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SSF1	YHR066W	TRP3	P00937	484 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SSF1	YHR066W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SSF1	YHR066W	FUS1	P11710	512 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SSF1	YHR066W	THI12	P42883	340 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SSF1	YHR066W	THI5	P43534	340 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SSF1	YHR066W	THI11	P47183	340 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SSF1	YHR066W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SSF1	YHR066W	AOS1	Q06624	347 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SSF1	YHR066W	THI13	Q07748	340 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SSF1	YHR066W	GLO4	Q12320	285 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SSF1	YHR066W	FLP1	P03870	423 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSF1	YHR066W	HVG1	P0CE11	249 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSF1	YHR066W	SAC7	P17121	654 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSF1	YHR066W	YHL008C	P38750	627 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSF1	YHR066W	SOG2	Q08817	791 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SSF1	YHR066W	YJR124C	P47159	448 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SSF1	YHR066W	SAM37	P50110	327 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SSF1	YHR066W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SSF1	YHR066W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SSF1	YHR066W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SSF1	YHR066W	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SSF1	YHR066W	MED7	Q08278	222 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SSF1	YHR066W	ATE1	P16639	503 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SSF1	YHR066W	HEM3	P28789	327 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SSF1	YHR066W	ELM1	P32801	640 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SSF1	YHR066W	RIM11	P38615	370 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SSF1	YHR066W	GIP2	P40036	548 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SSF1	YHR066W	DAK2	P43550	591 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SSF1	YHR066W	CTH1	P47976	325 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SSF1	YHR066W	YNR065C	P53751	1116 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SSF1	YHR066W	MSH6	Q03834	1242 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SSF1	YHR066W	TOS4	Q06266	489 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SSF1	YHR066W	TED1	P40533	473 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SSF1	YHR066W	NUT1	P53114	1132 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SSF1	YHR066W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SSF1	YHR066W	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSF1	YHR066W	NPR1	P22211	790 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSF1	YHR066W	LIP5	P32875	414 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSF1	YHR066W	VPS35	P34110	944 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSF1	YHR066W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SSF1	YHR066W	RRM3	P38766	723 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSF1	YHR066W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SSF1	YHR066W	GUP1	P53154	560 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSF1	YHR066W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SSF1	YHR066W	SLP1	Q12232	587 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSF1	YHR066W	YLR122C	Q12312	125 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSF1	YHR066W	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SSF1	YHR066W	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SSF1	YHR066W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SSF1	YHR066W	KAE1	P36132	386 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSF1	YHR066W	PAN5	P38787	379 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSF1	YHR066W	SAP155	P43612	1002 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSF1	YHR066W	POL32	P47110	350 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSF1	YHR066W	MON1	P53129	644 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSF1	YHR066W	YCS4	Q06156	1176 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SSF1	YHR066W	COQ2	P32378	372 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSF1	YHR066W	SFA1	P32771	386 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSF1	YHR066W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SSF1	YHR066W	TOS1	P38288	455 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SSF1	YHR066W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SSF1	YHR066W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.53	□□□□□ -1.68	not detected

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