RNA–Protein interactions for RNA: YGR228W

YGR228W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YGR228W, Length 345 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YGR228W	YGR228W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YGR228W	YGR228W	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YGR228W	YGR228W	BSC2	Q05611	235 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YGR228W	YGR228W	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YGR228W	YGR228W	SOG2	Q08817	791 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YGR228W	YGR228W	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YGR228W	YGR228W	SLP1	Q12232	587 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YGR228W	YGR228W	COB	P00163	385 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YGR228W	YGR228W	SEC20	P28791	383 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YGR228W	YGR228W	IPL1	P38991	367 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YGR228W	YGR228W	GIP2	P40036	548 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YGR228W	YGR228W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YGR228W	YGR228W	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YGR228W	YGR228W	SLD2	P34252	453 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	TED1	P40533	473 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	GUP1	P53154	560 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	YMR187C	Q03236	431 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	GLO4	Q12320	285 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	WHI5	Q12416	295 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	FLP1	P03870	423 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	HVG1	P0CE11	249 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	MET4	P32389	672 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	YHL008C	P38750	627 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	YJR124C	P47159	448 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	YDR215C	Q12240	137 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		5	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	DUR3	P33413	735 aa		5	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	RRM3	P38766	723 aa		5	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	LEM3	P42838	414 aa		5	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	THI12	P42883	340 aa		5	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	THI5	P43534	340 aa		5	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	THI11	P47183	340 aa		5	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	SAM37	P50110	327 aa		5	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	MSH6	Q03834	1242 aa		5	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	THI13	Q07748	340 aa		5	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		5	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	RIM11	P38615	370 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	PAN5	P38787	379 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	SKN7	P38889	622 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	LSB6	P42951	607 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	BUD9	P53226	547 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	YNR065C	P53751	1116 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	NEO1	P40527	1151 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	FET4	P40988	552 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	PRY1	P47032	299 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	MTC5	Q03897	1148 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	NPR1	P22211	790 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	SAP155	P43612	1002 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	NUT1	P53114	1132 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	SPO71	Q03868	1245 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	GAS5	Q08193	484 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YGR228W	YGR228W	SAC7	P17121	654 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YGR228W	YGR228W	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YGR228W	YGR228W	VPS35	P34110	944 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YGR228W	YGR228W	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YGR228W	YGR228W	DSE4	P53753	1117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YGR228W	YGR228W	AI3	P03877	415 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YGR228W	YGR228W	SFA1	P32771	386 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YGR228W	YGR228W	TAT1	P38085	619 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YGR228W	YGR228W	DAK2	P43550	591 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YGR228W	YGR228W	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YGR228W	YGR228W	MON1	P53129	644 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YGR228W	YGR228W	YCS4	Q06156	1176 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YGR228W	YGR228W	PMT7	Q06644	662 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YGR228W	YGR228W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YGR228W	YGR228W	YAF9	P53930	226 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YGR228W	YGR228W	MCA1	Q08601	432 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YGR228W	YGR228W	ELG1	Q12050	791 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YGR228W	YGR228W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YGR228W	YGR228W	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YGR228W	YGR228W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YGR228W	YGR228W	HEM3	P28789	327 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YGR228W	YGR228W	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YGR228W	YGR228W	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YGR228W	YGR228W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YGR228W	YGR228W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YGR228W	YGR228W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YGR228W	YGR228W	TOS4	Q06266	489 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YGR228W	YGR228W	YIG1	Q08956	461 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YGR228W	YGR228W	ERS1	P17261	260 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YGR228W	YGR228W	RSC6	P25632	483 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YGR228W	YGR228W	POL32	P47110	350 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YGR228W	YGR228W	DAL4	Q04895	635 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YGR228W	YGR228W	OXR1	Q08952	273 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YGR228W	YGR228W	ATE1	P16639	503 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YGR228W	YGR228W	UGA4	P32837	571 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YGR228W	YGR228W	GCV1	P48015	400 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YGR228W	YGR228W	FAR11	P53917	953 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YGR228W	YGR228W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63

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