RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000196264.4

Lmo4-207, Transcript of LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Lmo4, Length 1,263 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4-207ENSMUST00000196264 NgefQ8CHT1 710 aa21.91■■□□□ 1.1
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Mia2Q91ZV0 1396 aa21.9■■□□□ 1.1
Lmo4-207ENSMUST00000196264 ZgpatQ8VDM1 511 aa21.89■■□□□ 1.09
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Cep170bQ80U49 1574 aa21.89■■□□□ 1.09
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Col16a1Q8BLX7 1580 aa21.88■■□□□ 1.09
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Pm20d1Q8C165 503 aa21.86■■□□□ 1.09
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Kat6bQ8BRB7 1872 aa21.83■■□□□ 1.09
Lmo4-207ENSMUST00000196264 HdgfP51859 237 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
Lmo4-207ENSMUST00000196264 GalcP54818 684 aa21.83■■□□□ 1.09
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Slc35g1Q8BY79 368 aa21.83■■□□□ 1.09
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Ap3b2Q9JME5 1082 aa21.83■■□□□ 1.09
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Ncapd2Q8K2Z4 1392 aa21.83■■□□□ 1.08
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Vars2Q3U2A8 1060 aa21.81■■□□□ 1.08
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Polr3aB2RXC6 1390 aa21.81■■□□□ 1.08
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Sgip1Q8VD37 806 aa21.8■■□□□ 1.08
Lmo4-207ENSMUST00000196264 PaskQ8CEE6 1383 aa21.79■■□□□ 1.08
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Snapc4Q8BP86 1333 aa21.79■■□□□ 1.08
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Fyb1O35601 819 aa21.78■■□□□ 1.08
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Mdc1Q5PSV9 1707 aa21.77■■□□□ 1.08
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Pard3Q99NH2 1333 aa21.77■■□□□ 1.07
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Egfem1Q8C088 590 aa21.76■■□□□ 1.07
Lmo4-207ENSMUST00000196264 GakQ99KY4 1305 aa21.76■■□□□ 1.07
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Fam122aQ9DB52 284 aa21.75■■□□□ 1.07
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa21.75■■□□□ 1.07
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Lrit1Q8K099 624 aa21.74■■□□□ 1.07
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Bcl9lQ67FY2 1494 aa21.74■■□□□ 1.07
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Slc52a2Q9D8F3 450 aa21.73■■□□□ 1.07
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Nckap5lQ6GQX2 1323 aa21.73■■□□□ 1.07
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa21.72■■□□□ 1.07
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Zcrb1Q9CZ96 217 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Erbb3Q61526 1339 aa21.72■■□□□ 1.07
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Rad23bP54728 416 aa21.7■■□□□ 1.06
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Hirip3Q8BLH7 601 aa21.7■■□□□ 1.06
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Dzip1Q8BMD2 852 aa21.7■■□□□ 1.06
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Mug2P28666 1451 aa21.7■■□□□ 1.06
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Nwd2Q6P5U7 1742 aa21.69■■□□□ 1.06
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Trpc5Q9QX29 975 aa21.68■■□□□ 1.06
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Mphosph9A6H5Y1 991 aa21.67■■□□□ 1.06
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Zeb2Q9R0G7 1215 aa21.67■■□□□ 1.06
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Nid2O88322 1403 aa21.66■■□□□ 1.06
Lmo4-207ENSMUST00000196264 AtrnQ9WU60 1428 aa21.66■■□□□ 1.06
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Akap11E9Q777 1895 aa21.66■■□□□ 1.06
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Pim2Q62070 370 aa21.65■■□□□ 1.06
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Tet3Q8BG87 1668 aa21.64■■□□□ 1.05
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Ppfibp2O35711 882 aa21.64■■□□□ 1.05
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Kif23E9Q5G3 953 aa21.61■■□□□ 1.05
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Znf316Q6PGE4 1016 aa21.61■■□□□ 1.05
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Tulp4Q9JIL5 1547 aa21.6■■□□□ 1.05
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Zswim8Q3UHH1 1832 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
Lmo4-207ENSMUST00000196264 TimelessQ9R1X4 1197 aa21.6■■□□□ 1.05
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Abca14E9Q8F8 1683 aa21.6■■□□□ 1.05
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Fan1Q69ZT1 1020 aa21.59■■□□□ 1.05
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa21.59■■□□□ 1.05
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Cdk5rap2Q8K389 1822 aa21.59■■□□□ 1.05
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Gm21698A0A087WQP8 267 aa21.58■■□□□ 1.05
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Gm21671G3UY31 267 aa21.58■■□□□ 1.05
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Slx1bQ8BX32 270 aa21.58■■□□□ 1.05
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Fchsd2Q3USJ8 740 aa21.56■■□□□ 1.04
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Gpr162Q3UN16 588 aa21.55■■□□□ 1.04
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa21.55■■□□□ 1.04
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Card11Q8CIS0 1159 aa21.55■■□□□ 1.04
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Uhrf1bp1lA2RSJ4 1457 aa21.55■■□□□ 1.04
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Lrrc7Q80TE7 1490 aa21.54■■□□□ 1.04
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Kdm2aP59997 1161 aa21.54■■□□□ 1.04
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Sbno1Q689Z5 1390 aa21.53■■□□□ 1.04
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Mink1Q9JM52 1308 aa21.53■■□□□ 1.04
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Tnrc6bQ8BKI2 1810 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Pkd2O35245 966 aa21.52■■□□□ 1.04
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Akt1s1Q9D1F4 257 aa21.52■■□□□ 1.04
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Mon2Q80TL7 1715 aa21.52■■□□□ 1.03
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Ankrd23Q812A3 306 aa21.51■■□□□ 1.03
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Os9Q8K2C7 672 aa21.51■■□□□ 1.03
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Vps33bP59016 617 aa21.5■■□□□ 1.03
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Ddb1Q3U1J4 1140 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Adgre1Q61549 931 aa21.49■■□□□ 1.03
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Emilin1Q99K41 1017 aa21.49■■□□□ 1.03
Lmo4-207ENSMUST00000196264 IncenpQ9WU62 880 aa21.48■■□□□ 1.03
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Dot1lQ6XZL8 1540 aa21.47■■□□□ 1.03
Lmo4-207ENSMUST00000196264 UtrnE9Q6R7 3430 aa21.47■■□□□ 1.03
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Podxl2Q8CAE9 603 aa21.46■■□□□ 1.03
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Arhgap33Q80YF9 1305 aa21.46■■□□□ 1.03
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Fam184bQ0KK56 942 aa21.45■■□□□ 1.02
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Ppm1fQ8CGA0 452 aa21.45■■□□□ 1.02
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Washc2Q6PGL7 1334 aa21.45■■□□□ 1.02
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Ptpn23Q6PB44 1692 aa21.44■■□□□ 1.02
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Magea6O89010 325 aa21.44■■□□□ 1.02
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Magea3Q6T340 320 aa21.44■■□□□ 1.02
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Bsdc1Q80Y55 427 aa21.44■■□□□ 1.02
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Itgb4A2A863 1818 aa21.43■■□□□ 1.02
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Q8BT18 775 aa21.43■■□□□ 1.02
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa21.41■■□□□ 1.02
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Ccer2J3QPU5 274 aa21.41■■□□□ 1.02
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Ciz1Q8VEH2 845 aa21.41■■□□□ 1.02
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Usp21Q9QZL6 566 aa21.41■■□□□ 1.02
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Stag3O70576 1240 aa21.4■■□□□ 1.02
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Nsd3Q6P2L6 1439 aa21.39■■□□□ 1.02
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Fam198bQ3UPI1 517 aa21.38■■□□□ 1.01
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Mtfr1lQ9CWE0 289 aa21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 8.5 ms