RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000196264.4

Lmo4-207, Transcript of LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Lmo4, Length 1,263 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa36.01■■■■□ 3.36
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Abcc9P70170 1546 aa35.16■■■■□ 3.22
Lmo4-207ENSMUST00000196264 NischQ80TM9 1593 aa34.93■■■■□ 3.18
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Abcc8B2RUS7 1588 aa34.19■■■■□ 3.06
Lmo4-207ENSMUST00000196264 ScribQ80U72 1612 aa33.9■■■■□ 3.02
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa33.28■■■□□ 2.92
Lmo4-207ENSMUST00000196264 NacadQ5SWP3 1504 aa32.55■■■□□ 2.8
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Kdm5dQ62240 1548 aa32.4■■■□□ 2.78
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Sycp2Q9CUU3 1500 aa32■■■□□ 2.71
Lmo4-207ENSMUST00000196264 BicraF8VPZ9 1578 aa31.87■■■□□ 2.69
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP31.53■■■□□ 2.64
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Dnajc5P60904 198 aa31.49■■■□□ 2.63
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Dcaf1Q80TR8 1506 aa31.14■■■□□ 2.57
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa31■■■□□ 2.55
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Trim41Q5NCC3 630 aa30.6■■■□□ 2.49
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Ercc6F8VPZ5 1481 aa30.49■■■□□ 2.47
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Fam135aQ6NS59 1506 aa30.48■■■□□ 2.47
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa30.32■■■□□ 2.45
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Smarca2Q6DIC0 1577 aa30.11■■■□□ 2.41
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Baz1bQ9Z277 1479 aa29.96■■■□□ 2.39
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa29.86■■■□□ 2.37
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Wdr62Q3U3T8 1523 aa29.83■■■□□ 2.37
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Ubl4bQ9CQ84 188 aa29.81■■■□□ 2.36
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Frmpd1A2AKB4 1549 aa29.81■■■□□ 2.36
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Crybg2B7ZCC2 1516 aa29.8■■■□□ 2.36
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Mrc2Q64449 1479 aa29.77■■■□□ 2.36
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Baz1aO88379 1555 aa29.75■■■□□ 2.35
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Ccdc180J3QNE4 1664 aa29.48■■■□□ 2.31
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Unc13aQ4KUS2 1712 aa29.44■■■□□ 2.3
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa29.34■■■□□ 2.29
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa29.31■■■□□ 2.28
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Shroom2A2ALU4 1481 aa29.29■■■□□ 2.28
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Col17a1Q07563 1470 aa29.23■■■□□ 2.27
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Rhox8Q6VSS7 320 aa28.78■■■□□ 2.2
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Top2bQ64511 1612 aa28.73■■■□□ 2.19
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Kif21aQ9QXL2 1672 aa28.73■■■□□ 2.19
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa28.68■■■□□ 2.18
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Cux2P70298 1426 aa28.57■■■□□ 2.16
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
Lmo4-207ENSMUST00000196264 CftrP26361 1476 aa28.34■■■□□ 2.13
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa28.33■■■□□ 2.13
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa28.28■■■□□ 2.12
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Kif15Q6P9L6 1387 aa28.25■■■□□ 2.11
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Plb1Q3TTY0 1478 aa28.2■■■□□ 2.1
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Synj1Q8CHC4 1574 aa28.16■■■□□ 2.1
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa28.03■■■□□ 2.08
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Adgrl3Q80TS3 1537 aa27.95■■■□□ 2.06
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Cep164Q5DU05 1446 aa27.92■■■□□ 2.06
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Rusc2Q80U22 1514 aa27.91■■■□□ 2.06
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Lamc3Q9R0B6 1581 aa27.84■■■□□ 2.05
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
Lmo4-207ENSMUST00000196264 PtprtQ99M80 1454 aa27.76■■■□□ 2.03
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Crocc2F6XLV1 1638 aa27.7■■■□□ 2.03
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Gm156Q58A37 223 aa27.69■■■□□ 2.02
Lmo4-207ENSMUST00000196264 PtprkP35822 1457 aa27.68■■■□□ 2.02
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Ift140E9PY46 1464 aa27.66■■■□□ 2.02
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Cep170Q6A065 1588 aa27.64■■■□□ 2.01
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa27.63■■■□□ 2.01
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Il27Q8K3I6 234 aa27.56■■■□□ 2
Lmo4-207ENSMUST00000196264 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa27.51■■□□□ 1.99
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Pprc1Q6NZN1 1644 aa27.43■■□□□ 1.98
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Ccdc18Q640L5 1455 aa27.42■■□□□ 1.98
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Setd1bQ8CFT2 1985 aa27.36■■□□□ 1.97
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Disp1Q3TDN0 1521 aa27.31■■□□□ 1.96
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa27.26■■□□□ 1.95
Lmo4-207ENSMUST00000196264 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
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Lmo4-207ENSMUST00000196264 Camsap1A2AHC3 1581 aa27.19■■□□□ 1.94
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Fgd6Q69ZL1 1399 aa27.19■■□□□ 1.94
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa27.16■■□□□ 1.94
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Golga3P55937 1487 aa27.15■■□□□ 1.94
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Chic1Q8CBW7 227 aa27.14■■□□□ 1.94
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa27.11■■□□□ 1.93
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Duox2A2AQ99 1517 aa27.11■■□□□ 1.93
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
Lmo4-207ENSMUST00000196264 TnnQ80Z71 1560 aa27.08■■□□□ 1.93
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Cypt1Q8CH20 168 aa27.06■■□□□ 1.92
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Abcc1O35379 1528 aa27.05■■□□□ 1.92
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Rtl1Q7M732 1744 aa27.04■■□□□ 1.92
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Setbp1Q9Z180 1582 aa27.04■■□□□ 1.92
Lmo4-207ENSMUST00000196264 AknaQ80VW7 1404 aa27■■□□□ 1.91
Lmo4-207ENSMUST00000196264 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
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Lmo4-207ENSMUST00000196264 Alpk3Q924C5 1678 aa26.92■■□□□ 1.9
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