Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC51,94■■■■■ 5,91
Ppfibp2O35711 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC48,36■■■■■ 5,33
Ppfibp2O35711 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,57■■■■■ 5,21
Ppfibp2O35711 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC45,36■■■■■ 4,85
Ppfibp2O35711 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC44,71■■■■■ 4,75
Ppfibp2O35711 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,89■■■■■ 4,62
Ppfibp2O35711 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC43,83■■■■■ 4,61
Ppfibp2O35711 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,63■■■■■ 4,57
Ppfibp2O35711 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC43,6■■■■■ 4,57
Ppfibp2O35711 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,36■■■■■ 4,53
Ppfibp2O35711 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC43,27■■■■■ 4,52
Ppfibp2O35711 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC42,56■■■■■ 4,4
Ppfibp2O35711 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42,17■■■■■ 4,34
Ppfibp2O35711 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,11■■■■■ 4,33
Ppfibp2O35711 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC42,1■■■■■ 4,33
Ppfibp2O35711 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,93■■■■■ 4,3
Ppfibp2O35711 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,79■■■■■ 4,28
Ppfibp2O35711 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC41,41■■■■■ 4,22
Ppfibp2O35711 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,4■■■■■ 4,22
Ppfibp2O35711 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC41,27■■■■■ 4,2
Ppfibp2O35711 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC41,22■■■■■ 4,19
Ppfibp2O35711 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,22■■■■■ 4,19
Ppfibp2O35711 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,75■■■■■ 4,11
Ppfibp2O35711 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,52■■■■■ 4,08
Ppfibp2O35711 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40,36■■■■■ 4,05
Ppfibp2O35711 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,36■■■■■ 4,05
Ppfibp2O35711 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC40,25■■■■■ 4,03
Ppfibp2O35711 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,06■■■■■ 4
Ppfibp2O35711 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,04■■■■■ 4
Ppfibp2O35711 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,86■■■■□ 3,97
Ppfibp2O35711 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC39,82■■■■□ 3,97
Ppfibp2O35711 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC39,78■■■■□ 3,96
Ppfibp2O35711 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC39,74■■■■□ 3,95
Ppfibp2O35711 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC39,73■■■■□ 3,95
Ppfibp2O35711 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39,54■■■■□ 3,92
Ppfibp2O35711 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,51■■■■□ 3,92
Ppfibp2O35711 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,46■■■■□ 3,91
Ppfibp2O35711 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,42■■■■□ 3,9
Ppfibp2O35711 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,34■■■■□ 3,89
Ppfibp2O35711 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC39,33■■■■□ 3,89
Ppfibp2O35711 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC39,26■■■■□ 3,88
Ppfibp2O35711 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC39,19■■■■□ 3,86
Ppfibp2O35711 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC39,13■■■■□ 3,86
Ppfibp2O35711 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC39,12■■■■□ 3,85
Ppfibp2O35711 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39,12■■■■□ 3,85
Ppfibp2O35711 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,07■■■■□ 3,84
Ppfibp2O35711 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC39,04■■■■□ 3,84
Ppfibp2O35711 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,03■■■■□ 3,84
Ppfibp2O35711 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC38,83■■■■□ 3,81
Ppfibp2O35711 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC38,82■■■■□ 3,8
Ppfibp2O35711 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC38,79■■■■□ 3,8
Ppfibp2O35711 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC38,77■■■■□ 3,8
Ppfibp2O35711 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,7■■■■□ 3,79
Ppfibp2O35711 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC38,59■■■■□ 3,77
Ppfibp2O35711 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,52■■■■□ 3,76
Ppfibp2O35711 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38,46■■■■□ 3,75
Ppfibp2O35711 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,43■■■■□ 3,74
Ppfibp2O35711 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,36■■■■□ 3,73
Ppfibp2O35711 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC38,32■■■■□ 3,72
Ppfibp2O35711 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC38,26■■■■□ 3,72
Ppfibp2O35711 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,22■■■■□ 3,71
Ppfibp2O35711 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,16■■■■□ 3,7
Ppfibp2O35711 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC38,11■■■■□ 3,69
Ppfibp2O35711 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC38,09■■■■□ 3,69
Ppfibp2O35711 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3,67
Ppfibp2O35711 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,99■■■■□ 3,67
Ppfibp2O35711 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC37,91■■■■□ 3,66
Ppfibp2O35711 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,8■■■■□ 3,64
Ppfibp2O35711 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37,76■■■■□ 3,64
Ppfibp2O35711 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,74■■■■□ 3,63
Ppfibp2O35711 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,66■■■■□ 3,62
Ppfibp2O35711 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,64■■■■□ 3,62
Ppfibp2O35711 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC37,63■■■■□ 3,61
Ppfibp2O35711 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,6■■■■□ 3,61
Ppfibp2O35711 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC37,59■■■■□ 3,61
Ppfibp2O35711 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,58■■■■□ 3,61
Ppfibp2O35711 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,51■■■■□ 3,6
Ppfibp2O35711 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC37,5■■■■□ 3,59
Ppfibp2O35711 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,45■■■■□ 3,59
Ppfibp2O35711 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC37,35■■■■□ 3,57
Ppfibp2O35711 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC37,24■■■■□ 3,55
Ppfibp2O35711 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,23■■■■□ 3,55
Ppfibp2O35711 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37,23■■■■□ 3,55
Ppfibp2O35711 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37,19■■■■□ 3,54
Ppfibp2O35711 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC37,16■■■■□ 3,54
Ppfibp2O35711 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC37,13■■■■□ 3,53
Ppfibp2O35711 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC37,13■■■■□ 3,53
Ppfibp2O35711 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,13■■■■□ 3,53
Ppfibp2O35711 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC37,1■■■■□ 3,53
Ppfibp2O35711 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37,05■■■■□ 3,52
Ppfibp2O35711 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC37,01■■■■□ 3,52
Ppfibp2O35711 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,98■■■■□ 3,51
Ppfibp2O35711 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC36,98■■■■□ 3,51
Ppfibp2O35711 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC36,95■■■■□ 3,51
Ppfibp2O35711 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,92■■■■□ 3,5
Ppfibp2O35711 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,89■■■■□ 3,5
Ppfibp2O35711 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,85■■■■□ 3,49
Ppfibp2O35711 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,84■■■■□ 3,49
Ppfibp2O35711 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC36,82■■■■□ 3,48
Ppfibp2O35711 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,78■■■■□ 3,48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms