RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000171737.2

Odc1-201, Transcript of Ornithine decarboxylase, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Odc1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odc1-201ENSMUST00000171737 Astn2Q80Z10 1352 aa32,4■■■□□ 2,78
Odc1-201ENSMUST00000171737 Zfp444Q3TDV8 331 aaKnown RBP32,39■■■□□ 2,78
Odc1-201ENSMUST00000171737 Col16a1Q8BLX7 1580 aa32,39■■■□□ 2,78
Odc1-201ENSMUST00000171737 Birc3O08863 600 aa32,38■■■□□ 2,77
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tmem2Q5FWI3 1383 aa32,38■■■□□ 2,77
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ubr1O70481 1757 aa32,37■■■□□ 2,77
Odc1-201ENSMUST00000171737 Mdc1Q5PSV9 1707 aa32,35■■■□□ 2,77
Odc1-201ENSMUST00000171737 Trim28Q62318 834 aa32,34■■■□□ 2,77
Odc1-201ENSMUST00000171737 CrbnQ8C7D2 445 aa32,34■■■□□ 2,77
Odc1-201ENSMUST00000171737 Evi5lH3BKQ3 813 aa32,33■■■□□ 2,77
Odc1-201ENSMUST00000171737 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP32,32■■■□□ 2,77
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tsen2Q6P7W5 460 aa32,32■■■□□ 2,76
Odc1-201ENSMUST00000171737 Golga2Q921M4 999 aa32,32■■■□□ 2,76
Odc1-201ENSMUST00000171737 Scn7aB1AYL1 1681 aa32,31■■■□□ 2,76
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cdk12Q14AX6 1484 aaKnown RBP32,31■■■□□ 2,76
Odc1-201ENSMUST00000171737 Slc35g1Q8BY79 368 aa32,3■■■□□ 2,76
Odc1-201ENSMUST00000171737 Map2P20357 1828 aa32,3■■■□□ 2,76
Odc1-201ENSMUST00000171737 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP32,3■■■□□ 2,76
Odc1-201ENSMUST00000171737 Frmpd2A0A140LI67 1392 aa32,3■■■□□ 2,76
Odc1-201ENSMUST00000171737 Camta1A2A891 1682 aa32,3■■■□□ 2,76
Odc1-201ENSMUST00000171737 Wnk3Q80XP9 1757 aa32,3■■■□□ 2,76
Odc1-201ENSMUST00000171737 CemipQ8BI06 1361 aa32,29■■■□□ 2,76
Odc1-201ENSMUST00000171737 Amigo3Q8C2S7 508 aa32,28■■■□□ 2,76
Odc1-201ENSMUST00000171737 Uhrf1bp1lA2RSJ4 1457 aa32,28■■■□□ 2,76
Odc1-201ENSMUST00000171737 Hoxb7P09024 217 aa32,27■■■□□ 2,76
Odc1-201ENSMUST00000171737 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP32,27■■■□□ 2,76
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tnnt3Q9QZ47 272 aa32,27■■■□□ 2,76
Odc1-201ENSMUST00000171737 Map4k4P97820 1233 aaKnown RBP32,26■■■□□ 2,75
Odc1-201ENSMUST00000171737 Slc12a5Q91V14 1138 aa32,24■■■□□ 2,75
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP32,24■■■□□ 2,75
Odc1-201ENSMUST00000171737 Uspl1Q3ULM6 1089 aa32,23■■■□□ 2,75
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gli3Q61602 1583 aa32,23■■■□□ 2,75
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ppp1r15aP17564 657 aa32,2■■■□□ 2,75
Odc1-201ENSMUST00000171737 Nlgn1Q99K10 843 aa32,19■■■□□ 2,74
Odc1-201ENSMUST00000171737 Dennd6aQ8BH65 605 aa32,19■■■□□ 2,74
Odc1-201ENSMUST00000171737 L3mbtl2P59178 703 aa32,18■■■□□ 2,74
Odc1-201ENSMUST00000171737 FancaQ9JL70 1439 aa32,17■■■□□ 2,74
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cyb5rlB1AS42 316 aa32,16■■■□□ 2,74
Odc1-201ENSMUST00000171737 Apaf1O88879 1249 aa32,16■■■□□ 2,74
Odc1-201ENSMUST00000171737 Wdr17E9Q271 1322 aa32,16■■■□□ 2,74
Odc1-201ENSMUST00000171737 Nckap5lQ6GQX2 1323 aa32,16■■■□□ 2,74
Odc1-201ENSMUST00000171737 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa32,15■■■□□ 2,74
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm21190A0A0G2JGJ6 266 aa32,14■■■□□ 2,74
Odc1-201ENSMUST00000171737 PalmQ9Z0P4 383 aa32,14■■■□□ 2,73
Odc1-201ENSMUST00000171737 PtprvP70289 1705 aa32,13■■■□□ 2,73
Odc1-201ENSMUST00000171737 Rsph6aQ8CDR2 708 aa32,12■■■□□ 2,73
Odc1-201ENSMUST00000171737 Erbb3Q61526 1339 aa32,11■■■□□ 2,73
Odc1-201ENSMUST00000171737 Kcna6Q61923 529 aa32,11■■■□□ 2,73
Odc1-201ENSMUST00000171737 Spef2Q8C9J3 1734 aa32,1■■■□□ 2,73
Odc1-201ENSMUST00000171737 Atf3Q60765 181 aa32,1■■■□□ 2,73
Odc1-201ENSMUST00000171737 Fam135bQ9DAI6 1403 aa32,1■■■□□ 2,73
Odc1-201ENSMUST00000171737 Farp2Q91VS8 1065 aa32,09■■■□□ 2,73
Odc1-201ENSMUST00000171737 Kank1E9Q238 1360 aa32,08■■■□□ 2,73
Odc1-201ENSMUST00000171737 Fyb1O35601 819 aa32,07■■■□□ 2,72
Odc1-201ENSMUST00000171737 GnpatP98192 678 aa32,07■■■□□ 2,72
Odc1-201ENSMUST00000171737 Neurod2Q62414 383 aa32,07■■■□□ 2,72
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cabp4Q8VHC5 271 aa32,07■■■□□ 2,72
Odc1-201ENSMUST00000171737 Znf541Q0GGX2 1363 aa32,06■■■□□ 2,72
Odc1-201ENSMUST00000171737 Eif4a2P10630 407 aa32,05■■■□□ 2,72
Odc1-201ENSMUST00000171737 Parp14Q2EMV9 1817 aa32,05■■■□□ 2,72
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ncapd2Q8K2Z4 1392 aa32,05■■■□□ 2,72
Odc1-201ENSMUST00000171737 Robo1O89026 1612 aa32,04■■■□□ 2,72
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ccdc30Q8BVF4 654 aa32,03■■■□□ 2,72
Odc1-201ENSMUST00000171737 Nfat5Q9WV30 1534 aa32,03■■■□□ 2,72
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ddx17Q501J6 650 aaKnown RBP32,03■■■□□ 2,72
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ecm2Q5FW85 670 aa32,02■■■□□ 2,72
Odc1-201ENSMUST00000171737 TimelessQ9R1X4 1197 aa32,02■■■□□ 2,72
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ralbp1Q62172 648 aa32,02■■■□□ 2,72
Odc1-201ENSMUST00000171737 Brinp3Q499E0 766 aa32■■■□□ 2,71
Odc1-201ENSMUST00000171737 Atxn3Q9CVD2 355 aa32■■■□□ 2,71
Odc1-201ENSMUST00000171737 Q4VA45 678 aa32■■■□□ 2,71
Odc1-201ENSMUST00000171737 Siglec1Q62230 1695 aa31,99■■■□□ 2,71
Odc1-201ENSMUST00000171737 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa31,99■■■□□ 2,71
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ncoa4Q5U4H9 625 aa31,99■■■□□ 2,71
Odc1-201ENSMUST00000171737 Fchsd2Q3USJ8 740 aa31,98■■■□□ 2,71
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ano8Q6PB70 1060 aa31,97■■■□□ 2,71
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gimap6Q8K349 305 aa31,95■■■□□ 2,71
Odc1-201ENSMUST00000171737 Uhrf1bp1B2KF50 1429 aa31,95■■■□□ 2,7
Odc1-201ENSMUST00000171737 Mcm10Q0VBD2 885 aa31,95■■■□□ 2,7
Odc1-201ENSMUST00000171737 Dusp27Q148W8 1138 aa31,95■■■□□ 2,7
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tet3Q8BG87 1668 aa31,95■■■□□ 2,7
Odc1-201ENSMUST00000171737 Csrnp3P59055 597 aa31,94■■■□□ 2,7
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gas2l2Q5SSG4 860 aa31,93■■■□□ 2,7
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ttc41Q692V3 1318 aa31,93■■■□□ 2,7
Odc1-201ENSMUST00000171737 MpripP97434 1024 aa31,92■■■□□ 2,7
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cavin4A2AMM0 362 aa31,91■■■□□ 2,7
Odc1-201ENSMUST00000171737 Hoxc9P09633 260 aa31,91■■■□□ 2,7
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ncbp3Q8BZR9 615 aaKnown RBP31,91■■■□□ 2,7
Odc1-201ENSMUST00000171737 DccP70211 1447 aa31,89■■■□□ 2,7
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ptpn23Q6PB44 1692 aa31,89■■■□□ 2,7
Odc1-201ENSMUST00000171737 Plekhh1Q80TI1 1356 aa31,89■■■□□ 2,7
Odc1-201ENSMUST00000171737 Scaf1Q5U4C3 1256 aaKnown RBP31,88■■■□□ 2,69
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tmem132eQ6IEE6 982 aa31,88■■■□□ 2,69
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ccne1Q61457 408 aa31,87■■■□□ 2,69
Odc1-201ENSMUST00000171737 PaskQ8CEE6 1383 aa31,85■■■□□ 2,69
Odc1-201ENSMUST00000171737 Calr4Q3TQS0 420 aa31,85■■■□□ 2,69
Odc1-201ENSMUST00000171737 Dzip1Q8BMD2 852 aa31,85■■■□□ 2,69
Odc1-201ENSMUST00000171737 Rad17Q6NXW6 688 aa31,84■■■□□ 2,69
Odc1-201ENSMUST00000171737 Dixdc1Q80Y83 711 aa31,84■■■□□ 2,69
Odc1-201ENSMUST00000171737 Plin1Q8CGN5 517 aa31,84■■■□□ 2,69
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 11,2 ms