RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000120539.7

Lmo4-201, Transcript of LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Lmo4, Length 1,669 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4-201ENSMUST00000120539 TimelessQ9R1X4 1197 aa32.38■■■□□ 2.77
Lmo4-201ENSMUST00000120539 CemipQ8BI06 1361 aa32.36■■■□□ 2.77
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa32.36■■■□□ 2.77
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Scn7aB1AYL1 1681 aa32.36■■■□□ 2.77
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa32.36■■■□□ 2.77
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Tom1O88746 492 aa32.35■■■□□ 2.77
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Atp7bQ64446 1462 aa32.34■■■□□ 2.77
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa32.34■■■□□ 2.77
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Exoc6Q8R313 802 aa32.34■■■□□ 2.77
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Abca15E9PWH4 1668 aa32.33■■■□□ 2.77
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Pcgf6Q99NA9 353 aa32.33■■■□□ 2.77
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Dennd6aQ8BH65 605 aa32.32■■■□□ 2.76
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Zfp142G5E869 1843 aa32.32■■■□□ 2.76
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP32.31■■■□□ 2.76
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Marf1Q8BJ34 1730 aaKnown RBP32.31■■■□□ 2.76
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Map2P20357 1828 aa32.31■■■□□ 2.76
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Nlgn1Q99K10 843 aa32.31■■■□□ 2.76
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Tet3Q8BG87 1668 aa32.3■■■□□ 2.76
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Tex14Q7M6U3 1450 aa32.3■■■□□ 2.76
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Gimap6Q8K349 305 aa32.3■■■□□ 2.76
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP32.29■■■□□ 2.76
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Atp10bB1AWN4 1474 aa32.29■■■□□ 2.76
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ncapd2Q8K2Z4 1392 aa32.28■■■□□ 2.76
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Gm21190A0A0G2JGJ6 266 aa32.28■■■□□ 2.76
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ncoa4Q5U4H9 625 aa32.28■■■□□ 2.76
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Dixdc1Q80Y83 711 aa32.27■■■□□ 2.76
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Siglec1Q62230 1695 aa32.26■■■□□ 2.76
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Hoxb7P09024 217 aa32.26■■■□□ 2.75
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Birc3O08863 600 aa32.24■■■□□ 2.75
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa32.22■■■□□ 2.75
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Nckap5lQ6GQX2 1323 aa32.21■■■□□ 2.75
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Zmym3Q9JLM4 1370 aa32.21■■■□□ 2.75
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Nfat5Q9WV30 1534 aa32.2■■■□□ 2.75
Lmo4-201ENSMUST00000120539 FancaQ9JL70 1439 aa32.2■■■□□ 2.75
Lmo4-201ENSMUST00000120539 PaskQ8CEE6 1383 aa32.2■■■□□ 2.75
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Dzip1Q8BMD2 852 aa32.2■■■□□ 2.74
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Cadps2Q8BYR5 1297 aa32.2■■■□□ 2.74
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Bcl9lQ67FY2 1494 aa32.2■■■□□ 2.74
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Scaf1Q5U4C3 1256 aaKnown RBP32.18■■■□□ 2.74
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Cabp4Q8VHC5 271 aa32.18■■■□□ 2.74
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ybx3Q9JKB3 361 aaKnown RBP32.18■■■□□ 2.74
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Fam135bQ9DAI6 1403 aa32.17■■■□□ 2.74
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Robo1O89026 1612 aa32.17■■■□□ 2.74
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Qtrt2B8ZXI1 415 aa32.17■■■□□ 2.74
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Q7TT23 1179 aa32.17■■■□□ 2.74
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Mrs2Q5NCE8 434 aa32.16■■■□□ 2.74
Lmo4-201ENSMUST00000120539 PtprvP70289 1705 aa32.15■■■□□ 2.74
Lmo4-201ENSMUST00000120539 PnisrA2AJT4 805 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ano8Q6PB70 1060 aa32.15■■■□□ 2.74
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Znf526Q8BI66 675 aa32.15■■■□□ 2.74
Lmo4-201ENSMUST00000120539 P2rx7Q9Z1M0 595 aa32.15■■■□□ 2.74
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Nlrp6Q91WS2 869 aa32.12■■■□□ 2.73
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Trim28Q62318 834 aa32.11■■■□□ 2.73
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Kcnh5Q920E3 988 aa32.11■■■□□ 2.73
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Nid2O88322 1403 aa32.1■■■□□ 2.73
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Bcl2l12Q9D3J3 255 aa32.08■■■□□ 2.73
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Smim5Q8BT42 78 aa32.05■■■□□ 2.72
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Slc5a4bQ91ZP4 660 aa32.05■■■□□ 2.72
Lmo4-201ENSMUST00000120539 TnrQ8BYI9 1358 aa32.04■■■□□ 2.72
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Fbxo41Q6NS60 873 aa32.04■■■□□ 2.72
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Acsbg1Q99PU5 721 aa32.04■■■□□ 2.72
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Atf7ipQ7TT18 1306 aa32.04■■■□□ 2.72
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Uhrf1bp1lA2RSJ4 1457 aa32.03■■■□□ 2.72
Lmo4-201ENSMUST00000120539 TatQ8QZR1 454 aa32.02■■■□□ 2.72
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Dnajc10Q9DC23 793 aa32.02■■■□□ 2.72
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Slc4a2P13808 1237 aaKnown RBP32.02■■■□□ 2.72
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ppp1r15aP17564 657 aa32.02■■■□□ 2.72
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Fmnl2A2APV2 1086 aa32■■■□□ 2.71
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Rad17Q6NXW6 688 aa32■■■□□ 2.71
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Gm21698A0A087WQP8 267 aa31.99■■■□□ 2.71
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Gm21671G3UY31 267 aa31.99■■■□□ 2.71
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa31.99■■■□□ 2.71
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Cdhr2E9Q7P9 1308 aa31.98■■■□□ 2.71
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Zscan21Q07231 555 aa31.98■■■□□ 2.71
Lmo4-201ENSMUST00000120539 ZgpatQ8VDM1 511 aa31.98■■■□□ 2.71
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Hoxc9P09633 260 aa31.97■■■□□ 2.71
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ecm2Q5FW85 670 aa31.95■■■□□ 2.71
Lmo4-201ENSMUST00000120539 GsdmaQ9EST1 446 aa31.95■■■□□ 2.71
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Txnrd1Q9JMH6 613 aa31.95■■■□□ 2.71
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ptpn23Q6PB44 1692 aa31.95■■■□□ 2.71
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Tmem132eQ6IEE6 982 aa31.95■■■□□ 2.7
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Parp14Q2EMV9 1817 aa31.94■■■□□ 2.7
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Slc12a5Q91V14 1138 aa31.94■■■□□ 2.7
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Card10P58660 1021 aa31.93■■■□□ 2.7
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Arhgef1Q61210 920 aaKnown RBP31.92■■■□□ 2.7
Lmo4-201ENSMUST00000120539 NrdcQ8BHG1 1161 aa31.92■■■□□ 2.7
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Rsph6aQ8CDR2 708 aa31.92■■■□□ 2.7
Lmo4-201ENSMUST00000120539 HdgfP51859 237 aaKnown RBP31.92■■■□□ 2.7
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Eif4a2P10630 407 aa31.91■■■□□ 2.7
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Slit2Q9R1B9 1521 aa31.9■■■□□ 2.7
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Tsen2Q6P7W5 460 aa31.89■■■□□ 2.7
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Lrrc59Q922Q8 307 aaKnown RBP31.89■■■□□ 2.7
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Amotl2Q8K371 772 aa31.87■■■□□ 2.69
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ddx54Q8K4L0 874 aaKnown RBP31.87■■■□□ 2.69
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Nhsl1Q8CAF4 1587 aa31.86■■■□□ 2.69
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Nol11Q8BJW5 723 aaKnown RBP31.86■■■□□ 2.69
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ccne1Q61457 408 aa31.86■■■□□ 2.69
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Nyap1Q6PFX7 833 aa31.85■■■□□ 2.69
Lmo4-201ENSMUST00000120539 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP31.83■■■□□ 2.69
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Spef2Q8C9J3 1734 aa31.82■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39.9 ms