RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000120539.7

Lmo4-201, Transcript of LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Lmo4, Length 1,669 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa52,42■■■■■ 5,98
Lmo4-201ENSMUST00000120539 NischQ80TM9 1593 aa52,02■■■■■ 5,92
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Abcc9P70170 1546 aa50,47■■■■■ 5,67
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Abcc8B2RUS7 1588 aa50,06■■■■■ 5,6
Lmo4-201ENSMUST00000120539 ScribQ80U72 1612 aa47,83■■■■■ 5,25
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Kdm5dQ62240 1548 aa46,41■■■■■ 5,02
Lmo4-201ENSMUST00000120539 NacadQ5SWP3 1504 aa46,34■■■■■ 5,01
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Dcaf1Q80TR8 1506 aa46,33■■■■■ 5,01
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Rhox8Q6VSS7 320 aa45,65■■■■■ 4,9
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa45,43■■■■■ 4,86
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Sycp2Q9CUU3 1500 aa45,42■■■■■ 4,86
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ccdc180J3QNE4 1664 aa44,99■■■■■ 4,79
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Baz1aO88379 1555 aa44,85■■■■■ 4,77
Lmo4-201ENSMUST00000120539 BicraF8VPZ9 1578 aa44,69■■■■■ 4,74
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Crybg2B7ZCC2 1516 aa44,52■■■■■ 4,72
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP43,99■■■■■ 4,63
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Rtl1Q7M732 1744 aa43,73■■■■■ 4,59
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Smarca2Q6DIC0 1577 aa43,65■■■■■ 4,58
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP43,17■■■■■ 4,5
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa43,12■■■■■ 4,49
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP42,98■■■■■ 4,47
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP42,96■■■■■ 4,47
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa42,64■■■■■ 4,42
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa42,6■■■■■ 4,41
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP42,57■■■■■ 4,41
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP42,39■■■■■ 4,38
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Synj1Q8CHC4 1574 aa42,33■■■■■ 4,37
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ercc6F8VPZ5 1481 aa42,3■■■■■ 4,36
Lmo4-201ENSMUST00000120539 CftrP26361 1476 aa42,3■■■■■ 4,36
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa42,27■■■■■ 4,36
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Wdr62Q3U3T8 1523 aa42,14■■■■■ 4,34
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa42,1■■■■■ 4,33
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Frmpd1A2AKB4 1549 aa42,07■■■■■ 4,32
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Trim41Q5NCC3 630 aa41,98■■■■■ 4,31
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa41,91■■■■■ 4,3
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Fam135aQ6NS59 1506 aa41,77■■■■■ 4,28
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Unc13aQ4KUS2 1712 aa41,63■■■■■ 4,25
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP41,57■■■■■ 4,24
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP41,47■■■■■ 4,23
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Baz1bQ9Z277 1479 aa41,24■■■■■ 4,19
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Golga3P55937 1487 aa41,23■■■■■ 4,19
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Top2bQ64511 1612 aa41,16■■■■■ 4,18
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ubl4bQ9CQ84 188 aa41,09■■■■■ 4,17
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Cngb1E1AZ71 1325 aa40,96■■■■■ 4,15
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP40,94■■■■■ 4,14
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Lamc3Q9R0B6 1581 aa40,89■■■■■ 4,14
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Kif15Q6P9L6 1387 aa40,79■■■■■ 4,12
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Mrc2Q64449 1479 aa40,76■■■■■ 4,11
Lmo4-201ENSMUST00000120539 TnnQ80Z71 1560 aa40,72■■■■■ 4,11
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Fmn1Q05860 1466 aa40,6■■■■■ 4,09
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Cux2P70298 1426 aa40,58■■■■■ 4,09
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa40,36■■■■■ 4,05
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Camsap1A2AHC3 1581 aa40,26■■■■■ 4,03
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ccdc18Q640L5 1455 aa40,21■■■■■ 4,03
Lmo4-201ENSMUST00000120539 HrcG5E8J6 738 aa40,18■■■■■ 4,02
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Kif21aQ9QXL2 1672 aa40,17■■■■■ 4,02
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP40,14■■■■■ 4,02
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Chic1Q8CBW7 227 aa40,12■■■■■ 4,01
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Cep164Q5DU05 1446 aa40,12■■■■■ 4,01
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP40,04■■■■■ 4
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Il27Q8K3I6 234 aa40,01■■■■■ 4
Lmo4-201ENSMUST00000120539 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP39,87■■■■□ 3,97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa39,86■■■■□ 3,97
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP39,79■■■■□ 3,96
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Grin2bQ01097 1482 aa39,76■■■■□ 3,96
Lmo4-201ENSMUST00000120539 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP39,73■■■■□ 3,95
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Crocc2F6XLV1 1638 aa39,67■■■■□ 3,94
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Duox2A2AQ99 1517 aa39,57■■■■□ 3,93
Lmo4-201ENSMUST00000120539 NrkQ9R0G8 1455 aa39,54■■■■□ 3,92
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP39,53■■■■□ 3,92
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Plb1Q3TTY0 1478 aa39,51■■■■□ 3,91
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Efcab5A0JP43 1406 aa39,42■■■■□ 3,9
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Shroom4Q1W617 1475 aa39,41■■■■□ 3,9
Lmo4-201ENSMUST00000120539 PtprkP35822 1457 aa39,39■■■■□ 3,9
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Samd9lQ69Z37 1561 aa39,33■■■■□ 3,89
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP39,3■■■■□ 3,88
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Gab3Q8BSM5 595 aa39,23■■■■□ 3,87
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Ift140E9PY46 1464 aa39,21■■■■□ 3,87
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa39,15■■■■□ 3,86
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Disp1Q3TDN0 1521 aa39,08■■■■□ 3,85
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Npm2Q80W85 207 aa39,01■■■■□ 3,84
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Rad54l2Q99NG0 1466 aa38,99■■■■□ 3,83
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP38,99■■■■□ 3,83
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Setd1bQ8CFT2 1985 aa38,96■■■■□ 3,83
Lmo4-201ENSMUST00000120539 SynmQ70IV5 1561 aa38,96■■■■□ 3,83
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Rusc2Q80U22 1514 aa38,92■■■■□ 3,82
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP38,92■■■■□ 3,82
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa38,91■■■■□ 3,82
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Magi3Q9EQJ9 1476 aa38,9■■■■□ 3,82
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP38,9■■■■□ 3,82
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Arhgap35Q91YM2 1499 aa38,85■■■■□ 3,81
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Cep162Q6ZQ06 1403 aa38,85■■■■□ 3,81
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Grin2aP35436 1464 aa38,85■■■■□ 3,81
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Zeb1Q64318 1117 aa38,79■■■■□ 3,8
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Map3k1P53349 1493 aa38,78■■■■□ 3,8
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Pla2r1Q62028 1487 aa38,77■■■■□ 3,8
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Gpatch8A2A6A1 1505 aa38,76■■■■□ 3,8
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa38,74■■■■□ 3,79
Lmo4-201ENSMUST00000120539 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP38,63■■■■□ 3,77
Lmo4-201ENSMUST00000120539 Carmil1Q6EDY6 1374 aa38,56■■■■□ 3,76
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