RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000105041.9

H2-Q1-202, Transcript of Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene H2-Q1, Length 1,954 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Znf335A2A5K6 1337 aa15.62■□□□□ 0.09
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Birc3O08863 600 aa15.62■□□□□ 0.09
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Evi5lH3BKQ3 813 aa15.61■□□□□ 0.09
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Esx1O88933 382 aa15.61■□□□□ 0.09
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Cyb5rlB1AS42 316 aa15.6■□□□□ 0.09
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Slain2Q8CI08 581 aa15.6■□□□□ 0.09
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 GsdmaQ9EST1 446 aa15.6■□□□□ 0.09
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ltbp4Q8K4G1 1666 aa15.6■□□□□ 0.09
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Astn2Q80Z10 1352 aa15.59■□□□□ 0.09
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Sipa1l2Q80TE4 1722 aa15.58■□□□□ 0.08
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Chd4Q6PDQ2 1915 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Golga2Q921M4 999 aa15.56■□□□□ 0.08
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 P2rx7Q9Z1M0 595 aa15.56■□□□□ 0.08
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa15.56■□□□□ 0.08
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Anp32aO35381 247 aa15.56■□□□□ 0.08
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Tsen2Q6P7W5 460 aa15.56■□□□□ 0.08
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Col18a1P39061 1774 aa15.56■□□□□ 0.08
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Tmem2Q5FWI3 1383 aa15.55■□□□□ 0.08
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Frmpd2A0A140LI67 1392 aa15.55■□□□□ 0.08
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Pik3c2aQ61194 1686 aa15.54■□□□□ 0.08
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Hoxb7P09024 217 aa15.54■□□□□ 0.08
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Calr4Q3TQS0 420 aa15.54■□□□□ 0.08
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Atf3Q60765 181 aa15.54■□□□□ 0.08
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 CrbnQ8C7D2 445 aa15.53■□□□□ 0.08
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Col16a1Q8BLX7 1580 aa15.52■□□□□ 0.08
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Dennd6aQ8BH65 605 aa15.52■□□□□ 0.07
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Cdk12Q14AX6 1484 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gm21190A0A0G2JGJ6 266 aa15.51■□□□□ 0.07
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Fyb1O35601 819 aa15.5■□□□□ 0.07
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ppp1r15aP17564 657 aa15.5■□□□□ 0.07
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Zfp444Q3TDV8 331 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Trim28Q62318 834 aa15.5■□□□□ 0.07
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Map4k4P97820 1233 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 CemipQ8BI06 1361 aa15.49■□□□□ 0.07
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Usp19Q3UJD6 1360 aa15.49■□□□□ 0.07
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Kcna6Q61923 529 aa15.48■□□□□ 0.07
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Cabp4Q8VHC5 271 aa15.48■□□□□ 0.07
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Farp2Q91VS8 1065 aa15.48■□□□□ 0.07
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ubr1O70481 1757 aa15.48■□□□□ 0.07
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Wnk3Q80XP9 1757 aa15.48■□□□□ 0.07
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Wdr17E9Q271 1322 aa15.47■□□□□ 0.07
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Slc35g1Q8BY79 368 aa15.47■□□□□ 0.07
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Slc12a5Q91V14 1138 aa15.47■□□□□ 0.07
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa15.47■□□□□ 0.07
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Uhrf1bp1lA2RSJ4 1457 aa15.46■□□□□ 0.07
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa15.46■□□□□ 0.07
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Nlgn1Q99K10 843 aa15.46■□□□□ 0.07
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Mdc1Q5PSV9 1707 aa15.46■□□□□ 0.07
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Scn7aB1AYL1 1681 aa15.46■□□□□ 0.07
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gli3Q61602 1583 aa15.46■□□□□ 0.07
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 GnpatP98192 678 aa15.45■□□□□ 0.06
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Bcl11aQ9QYE3 773 aa15.45■□□□□ 0.06
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Camta1A2A891 1682 aa15.45■□□□□ 0.06
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Map2P20357 1828 aa15.45■□□□□ 0.06
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gimap6Q8K349 305 aa15.45■□□□□ 0.06
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 FancaQ9JL70 1439 aa15.45■□□□□ 0.06
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Rtl5Q5DTT4 599 aa15.44■□□□□ 0.06
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Neurod2Q62414 383 aa15.44■□□□□ 0.06
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 PalmQ9Z0P4 383 aa15.44■□□□□ 0.06
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 L3mbtl2P59178 703 aa15.44■□□□□ 0.06
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Uspl1Q3ULM6 1089 aa15.44■□□□□ 0.06
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 TimelessQ9R1X4 1197 aa15.44■□□□□ 0.06
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Apaf1O88879 1249 aa15.43■□□□□ 0.06
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Amigo3Q8C2S7 508 aa15.42■□□□□ 0.06
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Nckap5lQ6GQX2 1323 aa15.42■□□□□ 0.06
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Rsph6aQ8CDR2 708 aa15.42■□□□□ 0.06
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Kank1E9Q238 1360 aa15.41■□□□□ 0.06
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Fchsd2Q3USJ8 740 aa15.4■□□□□ 0.06
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Brinp3Q499E0 766 aa15.4■□□□□ 0.06
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ralbp1Q62172 648 aa15.4■□□□□ 0.06
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ncapd2Q8K2Z4 1392 aa15.4■□□□□ 0.06
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Fam135bQ9DAI6 1403 aa15.39■□□□□ 0.05
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Eif4a2P10630 407 aa15.39■□□□□ 0.05
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Scaf1Q5U4C3 1256 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ncoa4Q5U4H9 625 aa15.38■□□□□ 0.05
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Spef2Q8C9J3 1734 aa15.38■□□□□ 0.05
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Zfp777B9EKF4 885 aa15.38■□□□□ 0.05
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ccdc30Q8BVF4 654 aa15.38■□□□□ 0.05
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Nolc1E9Q5C9 702 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ddx17Q501J6 650 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Kcnh5Q920E3 988 aa15.37■□□□□ 0.05
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Parp14Q2EMV9 1817 aa15.37■□□□□ 0.05
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ecm2Q5FW85 670 aa15.36■□□□□ 0.05
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 TatQ8QZR1 454 aa15.36■□□□□ 0.05
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ciz1Q8VEH2 845 aa15.36■□□□□ 0.05
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Cavin4A2AMM0 362 aa15.36■□□□□ 0.05
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 MpripP97434 1024 aa15.36■□□□□ 0.05
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Rad17Q6NXW6 688 aa15.36■□□□□ 0.05
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ano8Q6PB70 1060 aa15.36■□□□□ 0.05
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Erbb3Q61526 1339 aa15.36■□□□□ 0.05
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 DccP70211 1447 aa15.35■□□□□ 0.05
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 PtprvP70289 1705 aa15.35■□□□□ 0.05
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Hoxc9P09633 260 aa15.35■□□□□ 0.05
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Dixdc1Q80Y83 711 aa15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.5 ms