RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000018810.9

Cbx1-201, Transcript of Chromobox protein homolog 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Cbx1, Length 1,824 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Astn2Q80Z10 1352 aa24.38■■□□□ 1.49
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Cbx1-201ENSMUST00000018810 Nlrp6Q91WS2 869 aa24.38■■□□□ 1.49
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Col16a1Q8BLX7 1580 aa24.38■■□□□ 1.49
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Scn7aB1AYL1 1681 aa24.36■■□□□ 1.49
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ubr1O70481 1757 aa24.34■■□□□ 1.49
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Cbx1-201ENSMUST00000018810 Frmpd2A0A140LI67 1392 aa24.29■■□□□ 1.48
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Cbx1-201ENSMUST00000018810 P2rx7Q9Z1M0 595 aa24.26■■□□□ 1.47
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa24.26■■□□□ 1.47
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Cbx1-201ENSMUST00000018810 Wdr17E9Q271 1322 aa24.24■■□□□ 1.47
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Birc3O08863 600 aa24.23■■□□□ 1.47
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Cbx1-201ENSMUST00000018810 Slc35g1Q8BY79 368 aa24.19■■□□□ 1.46
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Brinp3Q499E0 766 aa24.19■■□□□ 1.46
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fam135bQ9DAI6 1403 aa24.18■■□□□ 1.46
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Cbx1-201ENSMUST00000018810 FancaQ9JL70 1439 aa24.14■■□□□ 1.46
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tet3Q8BG87 1668 aa24.14■■□□□ 1.45
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm21190A0A0G2JGJ6 266 aa24.14■■□□□ 1.45
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Nlgn1Q99K10 843 aa24.14■■□□□ 1.45
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Robo1O89026 1612 aa24.14■■□□□ 1.45
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ppp1r15aP17564 657 aa24.13■■□□□ 1.45
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Scaf1Q5U4C3 1256 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Usp19Q3UJD6 1360 aa24.12■■□□□ 1.45
Cbx1-201ENSMUST00000018810 GnpatP98192 678 aa24.12■■□□□ 1.45
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tsen2Q6P7W5 460 aa24.12■■□□□ 1.45
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ncapd2Q8K2Z4 1392 aa24.12■■□□□ 1.45
Cbx1-201ENSMUST00000018810 TimelessQ9R1X4 1197 aa24.12■■□□□ 1.45
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Spef2Q8C9J3 1734 aa24.11■■□□□ 1.45
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gimap6Q8K349 305 aa24.11■■□□□ 1.45
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Nfat5Q9WV30 1534 aa24.1■■□□□ 1.45
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Golga2Q921M4 999 aa24.1■■□□□ 1.45
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ofd1Q80Z25 1017 aa24.09■■□□□ 1.45
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Map4k4P97820 1233 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ncoa4Q5U4H9 625 aa24.08■■□□□ 1.45
Cbx1-201ENSMUST00000018810 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Abca15E9PWH4 1668 aa24.07■■□□□ 1.44
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Hspa1lP16627 641 aa24.07■■□□□ 1.44
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cabp4Q8VHC5 271 aa24.06■■□□□ 1.44
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Slc12a5Q91V14 1138 aa24.06■■□□□ 1.44
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Parp14Q2EMV9 1817 aa24.05■■□□□ 1.44
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Znf541Q0GGX2 1363 aa24.04■■□□□ 1.44
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Nckap5lQ6GQX2 1323 aa24.04■■□□□ 1.44
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ano8Q6PB70 1060 aa24.04■■□□□ 1.44
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rsph6aQ8CDR2 708 aa24.03■■□□□ 1.44
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Atp7bQ64446 1462 aa24.03■■□□□ 1.44
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rad17Q6NXW6 688 aa24.03■■□□□ 1.44
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Kif24Q6NWW5 1356 aa24.02■■□□□ 1.44
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ddx17Q501J6 650 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ptpn23Q6PB44 1692 aa24■■□□□ 1.43
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Zfp444Q3TDV8 331 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
Cbx1-201ENSMUST00000018810 PalmQ9Z0P4 383 aa24■■□□□ 1.43
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Aplp2Q06335 707 aa23.99■■□□□ 1.43
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Uspl1Q3ULM6 1089 aa23.99■■□□□ 1.43
Cbx1-201ENSMUST00000018810 CrbnQ8C7D2 445 aa23.99■■□□□ 1.43
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Kcnh5Q920E3 988 aa23.99■■□□□ 1.43
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Marf1Q8BJ34 1730 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Zmym3Q9JLM4 1370 aa23.98■■□□□ 1.43
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Bcl9lQ67FY2 1494 aa23.98■■□□□ 1.43
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Eif4a2P10630 407 aa23.98■■□□□ 1.43
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Dixdc1Q80Y83 711 aa23.97■■□□□ 1.43
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Atp10bB1AWN4 1474 aa23.97■■□□□ 1.43
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Dzip1Q8BMD2 852 aa23.96■■□□□ 1.43
Cbx1-201ENSMUST00000018810 PaskQ8CEE6 1383 aa23.96■■□□□ 1.43
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fchsd2Q3USJ8 740 aa23.96■■□□□ 1.43
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa23.95■■□□□ 1.42
Cbx1-201ENSMUST00000018810 TnrQ8BYI9 1358 aa23.94■■□□□ 1.42
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Hoxc9P09633 260 aa23.94■■□□□ 1.42
Cbx1-201ENSMUST00000018810 TatQ8QZR1 454 aa23.93■■□□□ 1.42
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Bcl11bQ99PV8 884 aa23.93■■□□□ 1.42
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Slit2Q9R1B9 1521 aa23.92■■□□□ 1.42
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Zfp777B9EKF4 885 aa23.91■■□□□ 1.42
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Apaf1O88879 1249 aa23.91■■□□□ 1.42
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Nid2O88322 1403 aa23.91■■□□□ 1.42
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fmnl2A2APV2 1086 aa23.91■■□□□ 1.42
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa23.91■■□□□ 1.42
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Uhrf1bp1B2KF50 1429 aa23.9■■□□□ 1.42
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Zfp142G5E869 1843 aa23.9■■□□□ 1.42
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ncbp3Q8BZR9 615 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
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