RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF606Q8WXB4 792 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 OSBPL10Q9BXB5 764 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 THAP1Q9NVV9 213 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 DSEQ9UL01 958 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 C21orf59P57076 290 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 PRKAA1Q13131 559 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 OOSP2Q86WS3 158 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 GANQ9H2C0 597 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
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PTPRM-211ENST00000580170 DDHD2O94830 711 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 RHOAP61586 193 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 KRT78Q8N1N4 520 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 ATG16L2Q8NAA4 619 aa21.85■■□□□ 1.09
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PTPRM-211ENST00000580170 SLC2A4P14672 509 aa21.85■■□□□ 1.09
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PTPRM-211ENST00000580170 CD151P48509 253 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM48Q8IWZ4 208 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 SEPHS2Q99611 448 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
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PTPRM-211ENST00000580170 SPANXN3Q5MJ09 141 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 ADGRE3Q9BY15 652 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 INTS13Q9NVM9 706 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 ZSCAN32Q9NX65 697 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 VTI1BQ9UEU0 232 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 HALP42357 657 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 FIG4Q92562 907 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 CPNE1Q99829 537 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 FAM192AQ9GZU8 254 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 IL17RBQ9NRM6 502 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 VPS28Q9UK41 221 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 SALL3Q9BXA9 1300 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 HSMCR30P0CW71 290 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 NDST1P52848 882 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 NR6A1Q15406 480 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 IRGCQ6NXR0 463 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 CHMP1BQ7LBR1 199 aa21.85■■□□□ 1.09
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PTPRM-211ENST00000580170 RNF180Q86T96 592 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 C19orf60Q96EN9 201 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP21.85■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 OLFML1Q6UWY5 402 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
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PTPRM-211ENST00000580170 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa21.84■■□□□ 1.09
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PTPRM-211ENST00000580170 GP5P40197 560 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 CDH17Q12864 832 aa21.84■■□□□ 1.09
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PTPRM-211ENST00000580170 ARMC4Q5T2S8 1044 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 ELOVL6Q9H5J4 265 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 SNTG2Q9NY99 539 aa21.84■■□□□ 1.09
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PTPRM-211ENST00000580170 ST3GAL1Q11201 340 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 FGD2Q7Z6J4 655 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 HTR3CQ8WXA8 447 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 VTA1Q9NP79 307 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 CROTQ9UKG9 612 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 VIL1P09327 827 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 FBXO47Q5MNV8 452 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 SLITRK3O94933 977 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 ILDR2Q71H61 639 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 DHFR2Q86XF0 187 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 RSPH1Q8WYR4 309 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 PDCD2LQ9BRP1 358 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
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PTPRM-211ENST00000580170 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
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PTPRM-211ENST00000580170 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP21.83■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 MAP3K13O43283 966 aa21.83■■□□□ 1.09
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PTPRM-211ENST00000580170 PRMT9Q6P2P2 845 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 MFSD7Q6UXD7 560 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 FBXL16Q8N461 479 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRM-211ENST00000580170 SEMA4DQ92854 862 aa21.83■■□□□ 1.09
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