RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)P

tW(CCA)P, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)P, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)PtW(CCA)P UBX2Q04228 584 aa3.25□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P CSI1Q04368 295 aa3.25□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P TYW1Q08960 810 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P SRF1Q12516 437 aa3.25□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P LYS2P07702 1392 aa3.25□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P PFK2P16862 959 aaKnown RBP RIP-Chip data3.24□□□□□ -1.89not detected
tW(CCA)PtW(CCA)P SEC18P18759 758 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P ASH1P34233 588 aa3.24□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P TFA1P36100 482 aa3.24□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P RSC30P38781 883 aa3.24□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P NUG1P40010 520 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P UTP7P40055 554 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P YFH7P43591 353 aa3.24□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P CST9Q06032 482 aa3.24□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P SGD1Q06132 899 aa3.24□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P WRS1Q12109 432 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P RRI2Q12348 645 aa3.24□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P TOM1Q03280 3268 aa3.24□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P POM152P39685 1337 aa3.23□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P AI2P03876 854 aa3.23□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P GAL2P13181 574 aa3.23□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P DAL5P15365 543 aa3.23□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P FAS2P19097 1887 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P MDL2P33311 773 aa3.23□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P MOT2P34909 587 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P PTK1P36002 662 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P YBL028CP38202 106 aa3.23□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P TPS3P38426 1054 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P KEL1P38853 1164 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P MTC5Q03897 1148 aa3.23□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P RBA50Q04418 439 aa3.23□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P INM2Q05533 292 aa3.23□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P ACK1Q07622 623 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P PMA1P05030 918 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P ADP1P25371 1049 aa3.22□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P IXR1P33417 597 aa3.22□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P FUN12P39730 1002 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P BOI2P39969 1040 aa3.22□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P YPP1P46951 817 aa3.22□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P YJL171CP46992 396 aa3.22□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P YNL193WP53870 558 aa3.22□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P GIN4Q12263 1142 aa3.22□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P RVB2Q12464 471 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P SAC3P46674 1301 aa3.21□□□□□ -1.89
tW(CCA)PtW(CCA)P RAD53P22216 821 aa3.21□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P HAL5P38970 855 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P ACA1P39970 489 aa3.21□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P NSG2P53898 299 aa3.21□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P RPN7Q06103 429 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P PSF3Q12146 194 aa3.21□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P GYP5Q12344 894 aa3.21□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P ADR1P07248 1323 aa3.2□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P FBP1P09201 348 aa3.2□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P KRS1P15180 591 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P YDJ1P25491 409 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P GLO3P38682 493 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P YNG2P38806 282 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P VPS27P40343 622 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P PSF2P40359 213 aa3.2□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P SPR3P41901 512 aa3.2□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P APL6P46682 809 aa3.2□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P ULP1Q02724 621 aa3.2□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P YLR225CQ05948 407 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P PPM2Q08282 695 aa3.2□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P UTP10P42945 1769 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P TUB2P02557 457 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P RPS19AP07280 144 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P RPS19BP07281 144 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P PAH1P32567 862 aa3.19□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P MCD4P36051 919 aa3.19□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P BOI1P38041 980 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P GRX7P38068 203 aa3.19□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P PIP2P52960 996 aa3.19□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P ATG1P53104 897 aa3.19□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P SPO1P53541 631 aa3.19□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P RMD1Q03441 430 aa3.19□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P YDL124WQ07551 312 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P CDC45Q08032 650 aa3.19□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P SNF3P10870 884 aa3.18□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P SRS2P12954 1174 aa3.18□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P OCT1P35999 772 aa3.18□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P YKR023WP36119 530 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P ERG7P38604 731 aa3.18□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P YIL092WP40497 633 aa3.18□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P BDP1P46678 594 aa3.18□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P YJL007CP47080 104 aa3.18□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P AAD16Q02895 342 aa3.18□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P PUF6Q04373 656 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P KEL3Q08979 651 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P LAP2Q10740 671 aa3.18□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P CFT2Q12102 859 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P RPP0P05317 312 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P RAD2P07276 1031 aa3.17□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P ACE2P21192 770 aa3.17□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P KTR3P38130 404 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P MAL31P38156 614 aa3.17□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P SSF1P38789 453 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P ILV3P39522 585 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
tW(CCA)PtW(CCA)P LYS14P40971 790 aa3.17□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 29.5 ms