RNA–Protein interactions for RNA: YOR329C

SCD5, Transcript of Protein required for normal actin organization and endocytosis, yeast

Gene SCD5, Length 2,619 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SCD5	YOR329C	SRF1	Q12516	437 aa		2.79	□□□□□ -1.96
SCD5	YOR329C	SPO22	P40511	975 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SCD5	YOR329C	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
SCD5	YOR329C	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
SCD5	YOR329C	FAR11	P53917	953 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SCD5	YOR329C	YPR148C	Q06523	435 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SCD5	YOR329C	SIS2	P36024	562 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SCD5	YOR329C	PES4	P39684	611 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SCD5	YOR329C	TEA1	P47988	759 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SCD5	YOR329C	ITC1	P53125	1264 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SCD5	YOR329C	GCR2	Q01722	534 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SCD5	YOR329C	YPR204W	Q08995	1032 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SCD5	YOR329C	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
SCD5	YOR329C	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	OPI1	P21957	404 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	RAD24	P32641	659 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	YPL062W	Q02781	134 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	PKH1	Q03407	766 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	PSH1	Q12161	406 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	YBR287W	P38355	427 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	YDR344C	Q05510	147 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	NKP2	Q06162	153 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	GYP5	Q12344	894 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	ADR1	P07248	1323 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	YLR278C	Q05854	1341 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	UTP10	P42945	1769 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	CYB2	P00175	591 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	ARG8	P18544	423 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	YGL242C	P53066	181 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	HPC2	Q01448	625 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	COG8	Q04632	607 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	PSK2	Q08217	1101 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	FIG2	P25653	1609 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	SIT4	P20604	311 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	TTI1	P36097	1038 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	PFF1	P38244	976 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	OPY1	P38271	328 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	BDP1	P46678	594 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	CWH41	P53008	833 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	VPS64	Q03944	604 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	ATG20	Q07528	640 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	TYW1	Q08960	810 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	SHC1	P39000	512 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	DPH6	Q12429	685 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	KTR1	P27810	393 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	ASF1	P32447	279 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	IOC3	P43596	787 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	BBC1	P47068	1157 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	OXP1	P28273	1286 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	DLD1	P32891	587 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	SLI15	P38283	698 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	BDF2	Q07442	638 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	AIM44	Q99299	758 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	SEC20	P28791	383 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.74	□□□□□ -1.97	not detected
SCD5	YOR329C	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	ERO1	Q03103	563 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	IRC3	Q06683	689 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	GRX6	Q12438	231 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	TAF13	P11747	167 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	SRS2	P12954	1174 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	PCT1	P13259	424 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	IME2	P32581	645 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	YHL017W	P38745	532 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	YIL089W	P40500	205 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	YGL082W	P53155	381 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	ZDS2	P54786	942 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	MPH3	P0CE00	602 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	MET1	P36150	593 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	PBY1	P38254	753 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	BDH2	P39713	417 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	ALG2	P43636	503 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	NCS6	P53088	359 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	PEX14	P53112	341 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	HST1	P53685	503 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SCD5	YOR329C	JIP4	Q03361	876 aa		2.73	□□□□□ -1.97

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 9.5 ms