RNA–Protein interactions for RNA: YMR001C-A

YMR001C-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR001C-A, Length 231 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR001C-AYMR001C-A CUS1Q02554 436 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
YMR001C-AYMR001C-A VAN1P23642 535 aa5.78□□□□□ -1.48
YMR001C-AYMR001C-A CPS1P27614 576 aa5.78□□□□□ -1.48
YMR001C-AYMR001C-A KAP122P32767 1081 aa5.78□□□□□ -1.48
YMR001C-AYMR001C-A YNR040WP53736 256 aa5.78□□□□□ -1.48
YMR001C-AYMR001C-A SUV3P32580 737 aa5.77□□□□□ -1.49
YMR001C-AYMR001C-A SCD5P34758 872 aa5.77□□□□□ -1.49
YMR001C-AYMR001C-A MAC1P35192 417 aa5.77□□□□□ -1.49
YMR001C-AYMR001C-A UBX7P38349 436 aa5.77□□□□□ -1.49
YMR001C-AYMR001C-A PRK1P40494 810 aa5.77□□□□□ -1.49
YMR001C-AYMR001C-A UTP4Q06679 776 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
YMR001C-AYMR001C-A RPP1AP05318 106 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
YMR001C-AYMR001C-A SKP1P52286 194 aa5.76□□□□□ -1.49
YMR001C-AYMR001C-A ALO1P54783 526 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
YMR001C-AYMR001C-A YPL034WQ03083 165 aa5.76□□□□□ -1.49
YMR001C-AYMR001C-A NCL1P38205 684 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
YMR001C-AYMR001C-A QDR2P40474 542 aa5.75□□□□□ -1.49
YMR001C-AYMR001C-A HEH2Q03281 663 aa5.75□□□□□ -1.49
YMR001C-AYMR001C-A RPC31P17890 251 aa5.74□□□□□ -1.49
YMR001C-AYMR001C-A NAB2P32505 525 aaKnown RBP RIP-Chip data5.74□□□□□ -1.49not detected
YMR001C-AYMR001C-A PGM2P37012 569 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
YMR001C-AYMR001C-A CAB1Q04430 367 aa5.74□□□□□ -1.49
YMR001C-AYMR001C-A ALG14P38242 237 aa5.73□□□□□ -1.49
YMR001C-AYMR001C-A APM2P38700 605 aa5.73□□□□□ -1.49
YMR001C-AYMR001C-A FOX2Q02207 900 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
YMR001C-AYMR001C-A MRP10O75012 95 aa5.72□□□□□ -1.49
YMR001C-AYMR001C-A PUP1P25043 261 aa5.72□□□□□ -1.49
YMR001C-AYMR001C-A CWH41P53008 833 aa5.72□□□□□ -1.49
YMR001C-AYMR001C-A TRS33Q99394 268 aa5.72□□□□□ -1.49
YMR001C-AYMR001C-A NAR1P23503 491 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
YMR001C-AYMR001C-A NHA1Q99271 985 aa5.71□□□□□ -1.5
YMR001C-AYMR001C-A VMA3P25515 160 aa5.7□□□□□ -1.5
YMR001C-AYMR001C-A INP52P50942 1183 aa5.7□□□□□ -1.5
YMR001C-AYMR001C-A MRPL33P20084 86 aa5.69□□□□□ -1.5
YMR001C-AYMR001C-A YBR197CP38306 217 aa5.69□□□□□ -1.5
YMR001C-AYMR001C-A ITC1P53125 1264 aa5.69□□□□□ -1.5
YMR001C-AYMR001C-A GIS4Q04233 774 aa5.69□□□□□ -1.5
YMR001C-AYMR001C-A TPS3P38426 1054 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
YMR001C-AYMR001C-A YML083CQ04526 418 aa5.68□□□□□ -1.5
YMR001C-AYMR001C-A OMA1P36163 345 aa5.67□□□□□ -1.5
YMR001C-AYMR001C-A BSD2P38356 321 aa5.67□□□□□ -1.5
YMR001C-AYMR001C-A ALD4P46367 519 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
YMR001C-AYMR001C-A BUD9P53226 547 aa5.67□□□□□ -1.5
YMR001C-AYMR001C-A GAS5Q08193 484 aa5.67□□□□□ -1.5
YMR001C-AYMR001C-A IDI1P15496 288 aa5.66□□□□□ -1.5
YMR001C-AYMR001C-A ISC10P32645 267 aa5.66□□□□□ -1.5
YMR001C-AYMR001C-A PUN1Q06991 263 aa5.66□□□□□ -1.5
YMR001C-AYMR001C-A IRC24P40580 263 aa5.65□□□□□ -1.5
YMR001C-AYMR001C-A YOR296WQ08748 1289 aa5.65□□□□□ -1.5
YMR001C-AYMR001C-A DYS1P38791 387 aa5.64□□□□□ -1.51
YMR001C-AYMR001C-A LDH1P38139 375 aa5.63□□□□□ -1.51
YMR001C-AYMR001C-A RRM3P38766 723 aa5.63□□□□□ -1.51
YMR001C-AYMR001C-A NOB1Q08444 459 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
YMR001C-AYMR001C-A GIP1P38229 639 aa5.62□□□□□ -1.51
YMR001C-AYMR001C-A YER156CP40093 338 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
YMR001C-AYMR001C-A YJL181WP46987 611 aa5.61□□□□□ -1.51
YMR001C-AYMR001C-A PUF6Q04373 656 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
YMR001C-AYMR001C-A MSN1P22148 382 aa5.6□□□□□ -1.51
YMR001C-AYMR001C-A AI3P03877 415 aa5.59□□□□□ -1.51
YMR001C-AYMR001C-A TED1P40533 473 aa5.59□□□□□ -1.51
YMR001C-AYMR001C-A CWC15Q03772 175 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
YMR001C-AYMR001C-A SRS2P12954 1174 aa5.58□□□□□ -1.52
YMR001C-AYMR001C-A SSA4P22202 642 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
YMR001C-AYMR001C-A PGM1P33401 570 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
YMR001C-AYMR001C-A ISW1P38144 1129 aa5.58□□□□□ -1.52
YMR001C-AYMR001C-A YIL165CP40446 119 aa5.58□□□□□ -1.52
YMR001C-AYMR001C-A SOK2P53438 785 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
YMR001C-AYMR001C-A SAC7P17121 654 aa5.57□□□□□ -1.52
YMR001C-AYMR001C-A AVT1P47082 602 aa5.57□□□□□ -1.52
YMR001C-AYMR001C-A PPT1P53043 513 aa5.57□□□□□ -1.52
YMR001C-AYMR001C-A TY4B-PA0A0B7P3V8 1104 aa5.56□□□□□ -1.52
YMR001C-AYMR001C-A GIP2P40036 548 aa5.56□□□□□ -1.52
YMR001C-AYMR001C-A TY4A-HQ6Q5P6 413 aa5.56□□□□□ -1.52
YMR001C-AYMR001C-A BOI1P38041 980 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
YMR001C-AYMR001C-A PNP1Q05788 311 aa5.55□□□□□ -1.52
YMR001C-AYMR001C-A EMG1Q06287 252 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
YMR001C-AYMR001C-A KTR2P33550 425 aa5.54□□□□□ -1.52
YMR001C-AYMR001C-A HXT8P40886 569 aa5.54□□□□□ -1.52
YMR001C-AYMR001C-A SUT1P53032 299 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
YMR001C-AYMR001C-A ARI1P53111 347 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
YMR001C-AYMR001C-A RSC2Q06488 889 aa5.54□□□□□ -1.52
YMR001C-AYMR001C-A SLP1Q12232 587 aa5.54□□□□□ -1.52
YMR001C-AYMR001C-A TRP3P00937 484 aa5.53□□□□□ -1.52
YMR001C-AYMR001C-A SFA1P32771 386 aa5.53□□□□□ -1.52
YMR001C-AYMR001C-A YKR073CP36153 106 aa5.53□□□□□ -1.52
YMR001C-AYMR001C-A FIR1P40020 876 aa5.52□□□□□ -1.53
YMR001C-AYMR001C-A INP51P40559 946 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
YMR001C-AYMR001C-A RGD2P43556 714 aa5.52□□□□□ -1.53
YMR001C-AYMR001C-A RPB10P22139 70 aa5.51□□□□□ -1.53
YMR001C-AYMR001C-A TY1A-NL1Q12391 440 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
YMR001C-AYMR001C-A RRN6P32786 894 aa5.5□□□□□ -1.53
YMR001C-AYMR001C-A TFA2P36145 328 aa5.5□□□□□ -1.53
YMR001C-AYMR001C-A AIM46P38885 310 aa5.5□□□□□ -1.53
YMR001C-AYMR001C-A RSC6P25632 483 aa5.49□□□□□ -1.53
YMR001C-AYMR001C-A COQ2P32378 372 aa5.49□□□□□ -1.53
YMR001C-AYMR001C-A BIO5P53744 561 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
YMR001C-AYMR001C-A ALD3P54114 506 aa5.49□□□□□ -1.53
YMR001C-AYMR001C-A APC11Q12157 165 aa5.49□□□□□ -1.53
YMR001C-AYMR001C-A NAM7P30771 971 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
YMR001C-AYMR001C-A PAN5P38787 379 aa5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 43.5 ms