RNA–Protein interactions for RNA: YJL110C

GZF3, Transcript of GATA zinc finger protein, yeast

Gene GZF3, Length 1,656 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GZF3	YJL110C	FIR1	P40020	876 aa		5.85	□□□□□ -1.47
GZF3	YJL110C	HXT8	P40886	569 aa		5.85	□□□□□ -1.47
GZF3	YJL110C	NUP85	P46673	744 aa		5.85	□□□□□ -1.47
GZF3	YJL110C	VTC4	P47075	721 aa		5.85	□□□□□ -1.47
GZF3	YJL110C	LSC2	P53312	427 aa		5.85	□□□□□ -1.47
GZF3	YJL110C	YNL165W	P53891	406 aa		5.85	□□□□□ -1.47
GZF3	YJL110C	YTA7	P40340	1379 aa		5.85	□□□□□ -1.47
GZF3	YJL110C	MET4	P32389	672 aa		5.85	□□□□□ -1.47
GZF3	YJL110C	YBR287W	P38355	427 aa		5.85	□□□□□ -1.47
GZF3	YJL110C	QDR2	P40474	542 aa		5.85	□□□□□ -1.47
GZF3	YJL110C	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
GZF3	YJL110C	ATE1	P16639	503 aa		5.84	□□□□□ -1.47
GZF3	YJL110C	IRE1	P32361	1115 aa		5.84	□□□□□ -1.47
GZF3	YJL110C	DAL1	P32375	460 aa		5.84	□□□□□ -1.47
GZF3	YJL110C	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
GZF3	YJL110C	OPT2	Q06593	877 aa		5.83	□□□□□ -1.48
GZF3	YJL110C	KAP122	P32767	1081 aa		5.82	□□□□□ -1.48
GZF3	YJL110C	YJR098C	P47139	656 aa		5.82	□□□□□ -1.48
GZF3	YJL110C	YNL011C	P53980	444 aa		5.82	□□□□□ -1.48
GZF3	YJL110C	YDL176W	Q12027	708 aa		5.82	□□□□□ -1.48
GZF3	YJL110C	KTR2	P33550	425 aa		5.82	□□□□□ -1.48
GZF3	YJL110C	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
GZF3	YJL110C	SAM37	P50110	327 aa		5.82	□□□□□ -1.48
GZF3	YJL110C	MTO1	P53070	669 aa		5.82	□□□□□ -1.48
GZF3	YJL110C	CDC55	Q00362	526 aa		5.82	□□□□□ -1.48
GZF3	YJL110C	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.81	□□□□□ -1.48	not detected
GZF3	YJL110C	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
GZF3	YJL110C	OCA5	P38738	679 aa		5.81	□□□□□ -1.48
GZF3	YJL110C	RAD55	P38953	406 aa		5.81	□□□□□ -1.48
GZF3	YJL110C	NNF1	P47149	201 aa		5.81	□□□□□ -1.48
GZF3	YJL110C	YLR346C	Q06139	101 aa		5.81	□□□□□ -1.48
GZF3	YJL110C	GPI13	Q07830	1017 aa		5.81	□□□□□ -1.48
GZF3	YJL110C	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
GZF3	YJL110C	SLA1	P32790	1244 aa		5.8	□□□□□ -1.48
GZF3	YJL110C	ISW1	P38144	1129 aa		5.8	□□□□□ -1.48
GZF3	YJL110C	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
GZF3	YJL110C	MNL2	Q12205	849 aa		5.8	□□□□□ -1.48
GZF3	YJL110C	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
GZF3	YJL110C	MSN1	P22148	382 aa		5.79	□□□□□ -1.48
GZF3	YJL110C	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
GZF3	YJL110C	SEC8	P32855	1065 aa		5.79	□□□□□ -1.48
GZF3	YJL110C	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
GZF3	YJL110C	NTA1	P40354	457 aa		5.79	□□□□□ -1.48
GZF3	YJL110C	YJR107W	P47145	328 aa		5.79	□□□□□ -1.48
GZF3	YJL110C	UBP15	P50101	1230 aa		5.79	□□□□□ -1.48
GZF3	YJL110C	UBP2	Q01476	1272 aa		5.79	□□□□□ -1.48
GZF3	YJL110C	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		5.79	□□□□□ -1.48
GZF3	YJL110C	TCB1	Q12466	1186 aa		5.79	□□□□□ -1.48
GZF3	YJL110C	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
GZF3	YJL110C	GIP1	P38229	639 aa		5.79	□□□□□ -1.48
GZF3	YJL110C	ACO2	P39533	789 aa		5.79	□□□□□ -1.48
GZF3	YJL110C	BSC2	Q05611	235 aa		5.79	□□□□□ -1.48
GZF3	YJL110C	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
GZF3	YJL110C	PSH1	Q12161	406 aa		5.79	□□□□□ -1.48
GZF3	YJL110C	VPS35	P34110	944 aa		5.78	□□□□□ -1.48
GZF3	YJL110C	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
GZF3	YJL110C	BRN1	P38170	754 aa		5.78	□□□□□ -1.48
GZF3	YJL110C	RSC4	Q02206	625 aa		5.78	□□□□□ -1.48
GZF3	YJL110C	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
GZF3	YJL110C	YOR296W	Q08748	1289 aa		5.78	□□□□□ -1.48
GZF3	YJL110C	OXR1	Q08952	273 aa		5.78	□□□□□ -1.48
GZF3	YJL110C	STB3	Q12427	513 aa		5.78	□□□□□ -1.48
GZF3	YJL110C	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
GZF3	YJL110C	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
GZF3	YJL110C	RPC31	P17890	251 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GZF3	YJL110C	MET1	P36150	593 aa		5.76	□□□□□ -1.49
GZF3	YJL110C	PSY2	P40164	858 aa		5.76	□□□□□ -1.49
GZF3	YJL110C	DAK2	P43550	591 aa		5.76	□□□□□ -1.49
GZF3	YJL110C	RGD2	P43556	714 aa		5.76	□□□□□ -1.49
GZF3	YJL110C	TY1A-BL	Q12266	440 aa		5.76	□□□□□ -1.49
GZF3	YJL110C	SCW11	P53189	542 aa		5.75	□□□□□ -1.49
GZF3	YJL110C	DOS2	P54858	310 aa		5.75	□□□□□ -1.49
GZF3	YJL110C	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
GZF3	YJL110C	BSD2	P38356	321 aa		5.75	□□□□□ -1.49
GZF3	YJL110C	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
GZF3	YJL110C	RGP1	P16664	663 aa		5.74	□□□□□ -1.49
GZF3	YJL110C	AIM46	P38885	310 aa		5.74	□□□□□ -1.49
GZF3	YJL110C	SKP1	P52286	194 aa		5.74	□□□□□ -1.49
GZF3	YJL110C	CAF120	P53836	1060 aa		5.74	□□□□□ -1.49
GZF3	YJL110C	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
GZF3	YJL110C	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
GZF3	YJL110C	YHL008C	P38750	627 aa		5.73	□□□□□ -1.49
GZF3	YJL110C	FYV10	P40492	516 aa		5.72	□□□□□ -1.49
GZF3	YJL110C	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
GZF3	YJL110C	APM2	P38700	605 aa		5.72	□□□□□ -1.49
GZF3	YJL110C	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
GZF3	YJL110C	RMD1	Q03441	430 aa		5.72	□□□□□ -1.49
GZF3	YJL110C	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
GZF3	YJL110C	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
GZF3	YJL110C	OSH7	P38755	437 aa		5.71	□□□□□ -1.5
GZF3	YJL110C	YIR007W	P40566	764 aa		5.71	□□□□□ -1.5
GZF3	YJL110C	MRPL16	P38064	232 aa		5.7	□□□□□ -1.5
GZF3	YJL110C	YGR122W	P53272	402 aa		5.7	□□□□□ -1.5
GZF3	YJL110C	YAF9	P53930	226 aa		5.7	□□□□□ -1.5
GZF3	YJL110C	MCM2	P29469	868 aa		5.69	□□□□□ -1.5
GZF3	YJL110C	PEP7	P32609	515 aa		5.69	□□□□□ -1.5
GZF3	YJL110C	SPC42	P36094	363 aa		5.69	□□□□□ -1.5
GZF3	YJL110C	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
GZF3	YJL110C	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
GZF3	YJL110C	YIL165C	P40446	119 aa		5.69	□□□□□ -1.5

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