RNA–Protein interactions for RNA: YHR184W

SSP1, Transcript of Protein involved in the control of meiotic nuclear division, yeast

Gene SSP1, Length 1,716 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SSP1	YHR184W	YJR115W	P47152	169 aa		4.3	□□□□□ -1.72
SSP1	YHR184W	MSN5	P52918	1224 aa		4.3	□□□□□ -1.72
SSP1	YHR184W	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	4.29	□□□□□ -1.72
SSP1	YHR184W	STB3	Q12427	513 aa		4.29	□□□□□ -1.72
SSP1	YHR184W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.29	□□□□□ -1.72
SSP1	YHR184W	IRE1	P32361	1115 aa		4.29	□□□□□ -1.72
SSP1	YHR184W	SMC1	P32908	1225 aa		4.29	□□□□□ -1.72
SSP1	YHR184W	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	4.29	□□□□□ -1.72
SSP1	YHR184W	YTA6	P40328	754 aa		4.29	□□□□□ -1.72
SSP1	YHR184W	YJR107W	P47145	328 aa		4.29	□□□□□ -1.72
SSP1	YHR184W	YNL011C	P53980	444 aa		4.29	□□□□□ -1.72
SSP1	YHR184W	DYS1	P38791	387 aa		4.28	□□□□□ -1.72
SSP1	YHR184W	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		4.28	□□□□□ -1.72
SSP1	YHR184W	MSN1	P22148	382 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	DAL1	P32375	460 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	KAP122	P32767	1081 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	SLA1	P32790	1244 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	MET1	P36150	593 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	FIR1	P40020	876 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	DAK2	P43550	591 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	NUP85	P46673	744 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	YJR098C	P47139	656 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	MTO1	P53070	669 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	CDC55	Q00362	526 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	RAD55	P38953	406 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	RGD2	P43556	714 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	LSC2	P53312	427 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	PSH1	Q12161	406 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	MCM2	P29469	868 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	MET22	P32179	357 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	FYV10	P40492	516 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	SAM37	P50110	327 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.25	□□□□□ -1.73	not detected
SSP1	YHR184W	BSD2	P38356	321 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	NTA1	P40354	457 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	VTC4	P47075	721 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	RSC4	Q02206	625 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	TCB1	Q12466	1186 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	VPS35	P34110	944 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	SPR28	Q04921	423 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	BSC2	Q05611	235 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	RPC31	P17890	251 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	ISW1	P38144	1129 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	GIP1	P38229	639 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	PSY2	P40164	858 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	SVF1	Q05515	481 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	YOR296W	Q08748	1289 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	TOS4	Q06266	489 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	OXR1	Q08952	273 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	YBR287W	P38355	427 aa		4.21	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	UBP15	P50101	1230 aa		4.21	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.73
SSP1	YHR184W	RGP1	P16664	663 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SSP1	YHR184W	PEP7	P32609	515 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SSP1	YHR184W	YHL008C	P38750	627 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SSP1	YHR184W	AIM46	P38885	310 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SSP1	YHR184W	UBP2	Q01476	1272 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SSP1	YHR184W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SSP1	YHR184W	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SSP1	YHR184W	SKP1	P52286	194 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SSP1	YHR184W	YGR122W	P53272	402 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SSP1	YHR184W	OPT2	Q06593	877 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SSP1	YHR184W	FLP1	P03870	423 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SSP1	YHR184W	ITC1	P53125	1264 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SSP1	YHR184W	YNR040W	P53736	256 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SSP1	YHR184W	DAL4	Q04895	635 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SSP1	YHR184W	YLR346C	Q06139	101 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SSP1	YHR184W	CYC8	P14922	966 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SSP1	YHR184W	MRPL16	P38064	232 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SSP1	YHR184W	APM2	P38700	605 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SSP1	YHR184W	OSH7	P38755	437 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SSP1	YHR184W	FAA3	P39002	694 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SSP1	YHR184W	YIL165C	P40446	119 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SSP1	YHR184W	CTR9	P89105	1077 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SSP1	YHR184W	YCS4	Q06156	1176 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SSP1	YHR184W	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SSP1	YHR184W	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SSP1	YHR184W	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SSP1	YHR184W	RMD1	Q03441	430 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SSP1	YHR184W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SSP1	YHR184W	COB	P00163	385 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SSP1	YHR184W	RAD2	P07276	1031 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SSP1	YHR184W	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SSP1	YHR184W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SSP1	YHR184W	MON1	P53129	644 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SSP1	YHR184W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SSP1	YHR184W	YDL176W	Q12027	708 aa		4.17	□□□□□ -1.74

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