RNA–Protein interactions for RNA: YHR149C

SKG6, Transcript of Integral membrane protein, yeast

Gene SKG6, Length 2,205 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SKG6	YHR149C	GYL1	Q04322	720 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	RTC1	Q08281	1341 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SKG6	YHR149C	KEX1	P09620	729 aa		4.84	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	RAD16	P31244	790 aa		4.84	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	YME2	P32843	850 aa		4.84	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	MVP1	P40959	511 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	MSB4	Q12317	492 aa		4.84	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	CLN1	P20437	546 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	BRF1	P29056	596 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	YIL092W	P40497	633 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	NPA3	P47122	385 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	YGL082W	P53155	381 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	TAF13	P11747	167 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	ISW1	P38144	1129 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	LAM1	P38851	1228 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	INP52	P50942	1183 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	APP1	P53933	587 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	HOT1	Q03213	719 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	APC11	Q12157	165 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	CWH41	P53008	833 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	AOS1	Q06624	347 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	AUS1	Q08409	1394 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	DID4	P36108	232 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	RFC5	P38251	354 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.81	□□□□□ -1.64	not detected
SKG6	YHR149C	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	NKP1	Q12493	238 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	VPS5	Q92331	675 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	FKS3	Q04952	1785 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	SWI6	P09959	803 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.81	□□□□□ -1.64	not detected
SKG6	YHR149C	PIM1	P36775	1133 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	BEM4	P39011	633 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	SPR3	P41901	512 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	RCF1	Q03713	159 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	VPS20	Q04272	221 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	BIK1	P11709	440 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	ALD2	P47771	506 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	SHE4	P51534	789 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	INP2	Q03824	705 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	SMC6	Q12749	1114 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	DLD1	P32891	587 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	HEL1	P36113	551 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	RGD1	P38339	666 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	VNX1	P42839	908 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	HUL5	P53119	910 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	COG4	Q06096	861 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	SAP155	P43612	1002 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	YJR142W	P47173	342 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	SSL2	Q00578	843 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	OMS1	Q06668	471 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	LSO1	Q3E827	93 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	NPR3	P38742	1146 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	PET100	P38958	111 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	YDR338C	Q05497	695 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	ENT1	Q12518	454 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	PSK1	P31374	1356 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	SCT1	P32784	759 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	SPT8	P38915	602 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	SUM1	P46676	1062 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	ENV9	Q08651	330 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SKG6	YHR149C	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	RPC37	P36121	282 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	PSR1	Q07800	427 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	YML133C	Q03099	1374 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	TRK1	P12685	1235 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	UBP1	P25037	809 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SKG6	YHR149C	KAR9	P32526	644 aa		4.77	□□□□□ -1.65

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