RNA–Protein interactions for RNA: YHR139C

SPS100, Transcript of Protein required for spore wall maturation, yeast

Gene SPS100, Length 981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPS100	YHR139C	PIF1	P07271	859 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPS100	YHR139C	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SPS100	YHR139C	GAS5	Q08193	484 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SPS100	YHR139C	GSM1	P42950	618 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPS100	YHR139C	RMD1	Q03441	430 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPS100	YHR139C	TOS4	Q06266	489 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SPS100	YHR139C	JJJ2	P46997	583 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SPS100	YHR139C	PSF3	Q12146	194 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SPS100	YHR139C	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
SPS100	YHR139C	RAD50	P12753	1312 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SPS100	YHR139C	MSM1	P22438	575 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SPS100	YHR139C	SLI15	P38283	698 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SPS100	YHR139C	YIR042C	P40586	236 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SPS100	YHR139C	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
SPS100	YHR139C	INM2	Q05533	292 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SPS100	YHR139C	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
SPS100	YHR139C	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
SPS100	YHR139C	YFH7	P43591	353 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SPS100	YHR139C	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
SPS100	YHR139C	AFG2	P32794	780 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SPS100	YHR139C	EPS1	P40557	701 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SPS100	YHR139C	MRPS35	P53292	345 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SPS100	YHR139C	ARG82	P07250	355 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SPS100	YHR139C	PIB2	P53191	635 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SPS100	YHR139C	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
SPS100	YHR139C	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
SPS100	YHR139C	PBY1	P38254	753 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SPS100	YHR139C	RPC31	P17890	251 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPS100	YHR139C	KTR1	P27810	393 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
SPS100	YHR139C	CRF1	Q04930	467 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SPS100	YHR139C	CYB2	P00175	591 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SPS100	YHR139C	GAP1	P19145	602 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
SPS100	YHR139C	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
SPS100	YHR139C	GLC3	P32775	704 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SPS100	YHR139C	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
SPS100	YHR139C	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
SPS100	YHR139C	FLO11	P08640	1367 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SPS100	YHR139C	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
SPS100	YHR139C	MDL2	P33311	773 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SPS100	YHR139C	GRX7	P38068	203 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SPS100	YHR139C	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
SPS100	YHR139C	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
SPS100	YHR139C	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	10.32	□□□□□ -0.76
SPS100	YHR139C	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
SPS100	YHR139C	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
SPS100	YHR139C	BRN1	P38170	754 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SPS100	YHR139C	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
SPS100	YHR139C	FET4	P40988	552 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SPS100	YHR139C	VPS4	P52917	437 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SPS100	YHR139C	PUS6	P53294	404 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SPS100	YHR139C	TIM50	Q02776	476 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SPS100	YHR139C	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
SPS100	YHR139C	RIM20	Q12033	661 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SPS100	YHR139C	SNF3	P10870	884 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPS100	YHR139C	STV1	P37296	890 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPS100	YHR139C	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
SPS100	YHR139C	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
SPS100	YHR139C	YLR278C	Q05854	1341 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPS100	YHR139C	NPL4	P33755	580 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPS100	YHR139C	GEF1	P37020	779 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPS100	YHR139C	APL6	P46682	809 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPS100	YHR139C	IRC8	P47046	822 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPS100	YHR139C	YGR117C	P53270	476 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPS100	YHR139C	GCR2	Q01722	534 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPS100	YHR139C	AIM7	Q12156	149 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPS100	YHR139C	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
SPS100	YHR139C	OPI1	P21957	404 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPS100	YHR139C	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
SPS100	YHR139C	IOC3	P43596	787 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPS100	YHR139C	BBC1	P47068	1157 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPS100	YHR139C	PKH3	Q03306	898 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
SPS100	YHR139C	KAR5	Q04746	504 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPS100	YHR139C	PUS5	Q06244	254 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPS100	YHR139C	DLD1	P32891	587 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SPS100	YHR139C	PIP2	P52960	996 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SPS100	YHR139C	TAH18	Q12181	623 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SPS100	YHR139C	YJL171C	P46992	396 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPS100	YHR139C	LAM4	P38800	1345 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPS100	YHR139C	HXT13	P39924	564 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPS100	YHR139C	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
SPS100	YHR139C	EMP47	P43555	445 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPS100	YHR139C	MTC3	P53077	123 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPS100	YHR139C	HXT17	P53631	564 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPS100	YHR139C	NSG2	P53898	299 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPS100	YHR139C	GSC2	P40989	1895 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPS100	YHR139C	FLO1	P32768	1537 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPS100	YHR139C	PEX21	P50091	288 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPS100	YHR139C	MET1	P36150	593 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPS100	YHR139C	PPM2	Q08282	695 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPS100	YHR139C	CBP1	P07252	654 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SPS100	YHR139C	COQ1	P18900	473 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SPS100	YHR139C	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
SPS100	YHR139C	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
SPS100	YHR139C	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
SPS100	YHR139C	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
SPS100	YHR139C	AAD16	Q02895	342 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SPS100	YHR139C	VHR2	P40041	505 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPS100	YHR139C	YPL260W	Q08977	551 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPS100	YHR139C	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
SPS100	YHR139C	RTS1	P38903	757 aa		10.19	□□□□□ -0.78

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