RNA–Protein interactions for RNA: YHR119W

SET1, Transcript of Histone methyltransferase, subunit of the COMPASS (Set1C) complex, yeast

Gene SET1, Length 3,243 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SET1	YHR119W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	MSH2	P25847	964 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	TIM23	P32897	222 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	BBC1	P47068	1157 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	ACF4	P47129	309 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	IES5	P40060	125 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	SEC9	P40357	651 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	VTC2	P43585	828 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	MDM38	Q08179	573 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	ACE2	P21192	770 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	YGR016W	P53209	190 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	PSR1	Q07800	427 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	TMA17	Q12513	150 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	HAP4	P14064	554 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	MEF1	P25039	761 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	AAD3	P25612	363 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	MCM2	P29469	868 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	SFP1	P32432	683 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	RRN3	P36070	627 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	RTG3	P38165	486 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	SAP185	P40856	1058 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	MRX10	Q05648	414 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	REC8	Q12188	680 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	PXA2	P34230	853 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	HOL1	P53389	586 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	NUT2	Q06213	157 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	INO80	P53115	1489 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	TBS1	P38114	1094 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	HXT5	P38695	592 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	UBX4	P54730	416 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.8	□□□□□ -1.8	not detected
SET1	YHR119W	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	SPR28	Q04921	423 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	RAD59	Q12223	238 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	PTH2	P34222	208 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	YKL050C	P35736	922 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	MTO1	P53070	669 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	PKH3	Q03306	898 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	CDC45	Q08032	650 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	POP2	P39008	433 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	FRT1	Q99332	602 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	YKL100C	P34248	587 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	MIF2	P35201	549 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	UBA2	P52488	636 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	RMD1	Q03441	430 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	YRM1	Q12340	786 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	PIF1	P07271	859 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	MIP1	P15801	1254 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	MET4	P32389	672 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	YNL011C	P53980	444 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	CIT1	P00890	479 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	UGA3	P26370	528 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	YJR120W	P47157	116 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	RIM21	P48565	533 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	SPO71	Q03868	1245 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	ENV9	Q08651	330 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	PCL8	Q08966	492 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	PIM1	P36775	1133 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	MAM1	P40065	302 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	SPC105	P53148	917 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
SET1	YHR119W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	CMP2	P14747	604 aa		3.78	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	NSR1	P27476	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.78	□□□□□ -1.81	not detected
SET1	YHR119W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	KIC1	P38692	1080 aa		3.78	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	HLJ1	P48353	224 aa		3.78	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	YGR237C	P50089	785 aa		3.78	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	PPM2	Q08282	695 aa		3.78	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	GAL2	P13181	574 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	IME2	P32581	645 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	PET112	P33893	541 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	MNT3	P40549	630 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SET1	YHR119W	NUP145	P49687	1317 aa		3.77	□□□□□ -1.81

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