RNA–Protein interactions for RNA: YHR069C

RRP4, Transcript of Exosome non-catalytic core component, yeastyeast

Gene RRP4, Length 1,080 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP4YHR069C UBP16Q02863 499 aa7.04□□□□□ -1.28
RRP4YHR069C YDR090CQ03193 310 aa7.04□□□□□ -1.28
RRP4YHR069C JIP4Q03361 876 aa7.04□□□□□ -1.28
RRP4YHR069C PKH1Q03407 766 aa7.04□□□□□ -1.28
RRP4YHR069C PUF6Q04373 656 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
RRP4YHR069C BDF2Q07442 638 aa7.04□□□□□ -1.28
RRP4YHR069C AI4P03878 556 aa7.03□□□□□ -1.28
RRP4YHR069C SMY1P32364 656 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
RRP4YHR069C GCD7P32502 381 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
RRP4YHR069C PFF1P38244 976 aa7.03□□□□□ -1.28
RRP4YHR069C MSN5P52918 1224 aa7.03□□□□□ -1.28
RRP4YHR069C SPO1P53541 631 aa7.03□□□□□ -1.28
RRP4YHR069C KIN4Q01919 800 aa7.03□□□□□ -1.28
RRP4YHR069C DIB1Q06819 143 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
RRP4YHR069C PSH1Q12161 406 aa7.03□□□□□ -1.28
RRP4YHR069C SAC3P46674 1301 aa7.02□□□□□ -1.28
RRP4YHR069C DUR1,2P32528 1835 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
RRP4YHR069C CAF20P12962 161 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
RRP4YHR069C SIS1P25294 352 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
RRP4YHR069C MTC5Q03897 1148 aa7.02□□□□□ -1.29
RRP4YHR069C SIT4P20604 311 aa7.01□□□□□ -1.29
RRP4YHR069C DSF2P38213 736 aa7.01□□□□□ -1.29
RRP4YHR069C CWH41P53008 833 aa7.01□□□□□ -1.29
RRP4YHR069C SYF1Q04048 859 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
RRP4YHR069C HKR1P41809 1802 aa7□□□□□ -1.29
RRP4YHR069C COX6P00427 148 aa7□□□□□ -1.29
RRP4YHR069C CTT1P06115 562 aa7□□□□□ -1.29
RRP4YHR069C YKL222CP35995 705 aa7□□□□□ -1.29
RRP4YHR069C PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data7□□□□□ -1.29not detected
RRP4YHR069C ERO1Q03103 563 aa7□□□□□ -1.29
RRP4YHR069C FRD1P32614 470 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RRP4YHR069C HGH1P48362 394 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RRP4YHR069C RAD54P32863 898 aa6.98□□□□□ -1.29
RRP4YHR069C SEC61P32915 480 aa6.98□□□□□ -1.29
RRP4YHR069C ICP55P40051 511 aa6.98□□□□□ -1.29
RRP4YHR069C IRC3Q06683 689 aa6.98□□□□□ -1.29
RRP4YHR069C FIG2P25653 1609 aa6.98□□□□□ -1.29
RRP4YHR069C FAS2P19097 1887 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RRP4YHR069C SPL2P38839 148 aa6.97□□□□□ -1.29
RRP4YHR069C NCR1Q12200 1170 aa6.97□□□□□ -1.29
RRP4YHR069C ADR1P07248 1323 aa6.97□□□□□ -1.29
RRP4YHR069C SLA1P32790 1244 aa6.96□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C RPN1P38764 993 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C YER156CP40093 338 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C PML39Q03760 334 aa6.96□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C MAM3Q12296 706 aa6.96□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C DPH6Q12429 685 aa6.96□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C AIR2Q12476 344 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C SUP35P05453 685 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C KRE2P27809 442 aa6.95□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C MGM1P32266 881 aa6.95□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C NGR1P32831 672 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C KTR3P38130 404 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C SLI15P38283 698 aa6.95□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C KIC1P38692 1080 aa6.95□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C MID1P41821 548 aa6.95□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C THI3Q07471 609 aa6.95□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C SNU66Q12420 587 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C SSA1P10591 642 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C SEC18P18759 758 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C RET1P22276 1149 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C SSF1P38789 453 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C NMD2P38798 1089 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C FPR3P38911 411 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C SAS4Q04003 481 aa6.94□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C ICL1P28240 557 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C RPT4P53549 437 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C POM152P39685 1337 aa6.93□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C CDC16P09798 840 aa6.92□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C YKU70P32807 602 aa6.92□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C GLO3P38682 493 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C YGL242CP53066 181 aa6.92□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C RPN7Q06103 429 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C GRX6Q12438 231 aa6.92□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C NOT3P06102 836 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C LCB1P25045 558 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C HAL5P38970 855 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C TFG1P41895 735 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C NUP42P49686 430 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C YNL193WP53870 558 aa6.91□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C SRC1Q03707 834 aa6.91□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C NKP2Q06162 153 aa6.91□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C ECM21P38167 1117 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C RFC1P38630 861 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C NUG1P40010 520 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C ALO1P54783 526 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C IRC4Q03036 179 aa6.9□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C DPL1Q05567 589 aa6.9□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C YDL129WQ07555 291 aa6.9□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C GAS5Q08193 484 aa6.9□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C NCB2Q92317 146 aa6.9□□□□□ -1.3
RRP4YHR069C DIT2P21595 489 aa6.89□□□□□ -1.31
RRP4YHR069C SHC1P39000 512 aa6.89□□□□□ -1.31
RRP4YHR069C BDP1P46678 594 aa6.89□□□□□ -1.31
RRP4YHR069C TOS4Q06266 489 aa6.89□□□□□ -1.31
RRP4YHR069C TOP1P04786 769 aa6.88□□□□□ -1.31
RRP4YHR069C MLC1P53141 149 aa6.88□□□□□ -1.31
RRP4YHR069C PIB2P53191 635 aa6.88□□□□□ -1.31
RRP4YHR069C CDC73Q06697 393 aa6.88□□□□□ -1.31
RRP4YHR069C ATG20Q07528 640 aa6.88□□□□□ -1.31
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