RNA–Protein interactions for RNA: YGL239C

YGL239C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YGL239C, Length 315 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YGL239C	YGL239C	KAR5	Q04746	504 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YGL239C	YGL239C	DPH6	Q12429	685 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YGL239C	YGL239C	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YGL239C	YGL239C	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
YGL239C	YGL239C	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
YGL239C	YGL239C	LDH1	P38139	375 aa		3.74	□□□□□ -1.81
YGL239C	YGL239C	DYS1	P38791	387 aa		3.74	□□□□□ -1.81
YGL239C	YGL239C	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
YGL239C	YGL239C	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
YGL239C	YGL239C	RPC31	P17890	251 aa		3.73	□□□□□ -1.81
YGL239C	YGL239C	JJJ3	P47138	172 aa		3.73	□□□□□ -1.81
YGL239C	YGL239C	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.72	□□□□□ -1.81	not detected
YGL239C	YGL239C	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
YGL239C	YGL239C	BSD2	P38356	321 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YGL239C	YGL239C	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
YGL239C	YGL239C	APM2	P38700	605 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YGL239C	YGL239C	HXT8	P40886	569 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YGL239C	YGL239C	SKP1	P52286	194 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YGL239C	YGL239C	YNR040W	P53736	256 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YGL239C	YGL239C	YOR296W	Q08748	1289 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YGL239C	YGL239C	HAT1	Q12341	374 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YGL239C	YGL239C	LSO1	Q3E827	93 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YGL239C	YGL239C	RPB10	P22139	70 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YGL239C	YGL239C	MSN1	P22148	382 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YGL239C	YGL239C	GIP1	P38229	639 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YGL239C	YGL239C	MSC7	P38694	644 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YGL239C	YGL239C	ICP55	P40051	511 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YGL239C	YGL239C	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
YGL239C	YGL239C	ISW1	P38144	1129 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YGL239C	YGL239C	FIR1	P40020	876 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YGL239C	YGL239C	QDR1	P40475	563 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YGL239C	YGL239C	HEH2	Q03281	663 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YGL239C	YGL239C	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
YGL239C	YGL239C	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
YGL239C	YGL239C	ITC1	P53125	1264 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YGL239C	YGL239C	THI72	Q08579	599 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YGL239C	YGL239C	APC11	Q12157	165 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YGL239C	YGL239C	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
YGL239C	YGL239C	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YGL239C	YGL239C	AI1	P03875	834 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YGL239C	YGL239C	KTR2	P33550	425 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YGL239C	YGL239C	MDJ1	P35191	511 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YGL239C	YGL239C	ERP5	P38819	212 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YGL239C	YGL239C	PRK1	P40494	810 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YGL239C	YGL239C	ATG1	P53104	897 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YGL239C	YGL239C	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
YGL239C	YGL239C	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
YGL239C	YGL239C	SMC1	P32908	1225 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YGL239C	YGL239C	YBR287W	P38355	427 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YGL239C	YGL239C	RAD55	P38953	406 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YGL239C	YGL239C	RGD2	P43556	714 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YGL239C	YGL239C	IDI1	P15496	288 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YGL239C	YGL239C	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
YGL239C	YGL239C	AIM46	P38885	310 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YGL239C	YGL239C	YIL165C	P40446	119 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YGL239C	YGL239C	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
YGL239C	YGL239C	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
YGL239C	YGL239C	ACF4	P47129	309 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YGL239C	YGL239C	YNR014W	P53719	212 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YGL239C	YGL239C	NSG2	P53898	299 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YGL239C	YGL239C	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
YGL239C	YGL239C	MRP10	O75012	95 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YGL239C	YGL239C	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
YGL239C	YGL239C	NTA1	P40354	457 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YGL239C	YGL239C	MDJ2	P42834	146 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YGL239C	YGL239C	YJL181W	P46987	611 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YGL239C	YGL239C	PPT1	P53043	513 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YGL239C	YGL239C	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
YGL239C	YGL239C	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
YGL239C	YGL239C	MET1	P36150	593 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YGL239C	YGL239C	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
YGL239C	YGL239C	BOI2	P39969	1040 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YGL239C	YGL239C	PSY2	P40164	858 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YGL239C	YGL239C	UFD2	P54860	961 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YGL239C	YGL239C	TRS120	Q04183	1289 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YGL239C	YGL239C	RSC2	Q06488	889 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YGL239C	YGL239C	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
YGL239C	YGL239C	ALG14	P38242	237 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YGL239C	YGL239C	YFL066C	P43538	392 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YGL239C	YGL239C	TDA6	Q06466	467 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YGL239C	YGL239C	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
YGL239C	YGL239C	YHL050C	P38721	697 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YGL239C	YGL239C	YHR219W	P38900	624 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YGL239C	YGL239C	NUT2	Q06213	157 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YGL239C	YGL239C	FRT1	Q99332	602 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YGL239C	YGL239C	YNL011C	P53980	444 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YGL239C	YGL239C	GIS4	Q04233	774 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YGL239C	YGL239C	PHM7	Q12252	991 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YGL239C	YGL239C	NHA1	Q99271	985 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YGL239C	YGL239C	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
YGL239C	YGL239C	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
YGL239C	YGL239C	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	3.6	□□□□□ -1.83
YGL239C	YGL239C	MNL2	Q12205	849 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YGL239C	YGL239C	FUS1	P11710	512 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YGL239C	YGL239C	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
YGL239C	YGL239C	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
YGL239C	YGL239C	GIP2	P40036	548 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YGL239C	YGL239C	TED1	P40533	473 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YGL239C	YGL239C	THI12	P42883	340 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YGL239C	YGL239C	THI5	P43534	340 aa		3.59	□□□□□ -1.83

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