RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W PDR18P53756 1333 aa10.66□□□□□ -0.7
DDI1YER143W ERT1P38140 529 aa10.66□□□□□ -0.7
DDI1YER143W POM152P39685 1337 aa10.65□□□□□ -0.7
DDI1YER143W CAF20P12962 161 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
DDI1YER143W SIT4P20604 311 aa10.65□□□□□ -0.7
DDI1YER143W SMY1P32364 656 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
DDI1YER143W YIR014WP40570 242 aa10.65□□□□□ -0.7
DDI1YER143W YJL171CP46992 396 aa10.65□□□□□ -0.7
DDI1YER143W MLC1P53141 149 aa10.65□□□□□ -0.7
DDI1YER143W MRPS35P53292 345 aa10.65□□□□□ -0.7
DDI1YER143W HKR1P41809 1802 aa10.65□□□□□ -0.71
DDI1YER143W NGR1P32831 672 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
DDI1YER143W BRN1P38170 754 aa10.64□□□□□ -0.71
DDI1YER143W ICP55P40051 511 aa10.64□□□□□ -0.71
DDI1YER143W YNL193WP53870 558 aa10.64□□□□□ -0.71
DDI1YER143W GCR2Q01722 534 aa10.64□□□□□ -0.71
DDI1YER143W RPN7Q06103 429 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
DDI1YER143W THI3Q07471 609 aa10.64□□□□□ -0.71
DDI1YER143W DPH6Q12429 685 aa10.64□□□□□ -0.71
DDI1YER143W MGM1P32266 881 aa10.63□□□□□ -0.71
DDI1YER143W FRD1P32614 470 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
DDI1YER143W SPL2P38839 148 aa10.63□□□□□ -0.71
DDI1YER143W ULI1P43604 169 aa10.63□□□□□ -0.71
DDI1YER143W ERO1Q03103 563 aa10.63□□□□□ -0.71
DDI1YER143W IRC3Q06683 689 aa10.63□□□□□ -0.71
DDI1YER143W FAS2P19097 1887 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
DDI1YER143W VMA1P17255 1071 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
DDI1YER143W GLO3P38682 493 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
DDI1YER143W HAL5P38970 855 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
DDI1YER143W EAF6P47128 113 aa10.62□□□□□ -0.71
DDI1YER143W MSN5P52918 1224 aa10.61□□□□□ -0.71
DDI1YER143W PIB2P53191 635 aa10.61□□□□□ -0.71
DDI1YER143W RMD1Q03441 430 aa10.61□□□□□ -0.71
DDI1YER143W BRE1Q07457 700 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
DDI1YER143W IOC2Q12072 812 aa10.61□□□□□ -0.71
DDI1YER143W KRE2P27809 442 aa10.6□□□□□ -0.71
DDI1YER143W DLD1P32891 587 aa10.6□□□□□ -0.71
DDI1YER143W RPN1P38764 993 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
DDI1YER143W KIN4Q01919 800 aa10.6□□□□□ -0.71
DDI1YER143W YOL036WQ08206 761 aa10.6□□□□□ -0.71
DDI1YER143W AIR2Q12476 344 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
DDI1YER143W VAS1P07806 1104 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
DDI1YER143W YKL222CP35995 705 aa10.59□□□□□ -0.71
DDI1YER143W EAP1P36041 632 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
DDI1YER143W HXT13P39924 564 aa10.59□□□□□ -0.71
DDI1YER143W HXT17P53631 564 aa10.59□□□□□ -0.71
DDI1YER143W SRC1Q03707 834 aa10.59□□□□□ -0.71
DDI1YER143W SAM3Q08986 587 aa10.59□□□□□ -0.71
DDI1YER143W RIM20Q12033 661 aa10.59□□□□□ -0.71
DDI1YER143W AAP1P37898 856 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
DDI1YER143W OPY1P38271 328 aa10.58□□□□□ -0.72
DDI1YER143W CWH41P53008 833 aa10.58□□□□□ -0.72
DDI1YER143W SAS4Q04003 481 aa10.58□□□□□ -0.72
DDI1YER143W KTR1P27810 393 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
DDI1YER143W NUG1P40010 520 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
DDI1YER143W RPT4P53549 437 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
DDI1YER143W CTT1P06115 562 aa10.56□□□□□ -0.72
DDI1YER143W PIF1P07271 859 aa10.56□□□□□ -0.72
DDI1YER143W LCB1P25045 558 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
DDI1YER143W SET4P42948 560 aa10.56□□□□□ -0.72
DDI1YER143W LDB19Q12502 818 aa10.56□□□□□ -0.72
DDI1YER143W RET1P22276 1149 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
DDI1YER143W IRC4Q03036 179 aa10.54□□□□□ -0.72
DDI1YER143W RRI2Q12348 645 aa10.54□□□□□ -0.72
DDI1YER143W OSH3P38713 996 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
DDI1YER143W LAM4P38800 1345 aa10.53□□□□□ -0.72
DDI1YER143W PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
DDI1YER143W UBX2Q04228 584 aa10.52□□□□□ -0.73
DDI1YER143W TRL1P09880 827 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
DDI1YER143W PBY1P38254 753 aa10.51□□□□□ -0.73
DDI1YER143W YER156CP40093 338 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
DDI1YER143W YMR147WP40218 223 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
DDI1YER143W YIR042CP40586 236 aa10.51□□□□□ -0.73
DDI1YER143W KAR5Q04746 504 aa10.51□□□□□ -0.73
DDI1YER143W FPR4Q06205 392 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
DDI1YER143W GRX6Q12438 231 aa10.51□□□□□ -0.73
DDI1YER143W OPI1P21957 404 aa10.5□□□□□ -0.73
DDI1YER143W INM2Q05533 292 aa10.5□□□□□ -0.73
DDI1YER143W TOS4Q06266 489 aa10.5□□□□□ -0.73
DDI1YER143W FLO1P32768 1537 aa10.49□□□□□ -0.73
DDI1YER143W PCT1P13259 424 aa10.49□□□□□ -0.73
DDI1YER143W ICL1P28240 557 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
DDI1YER143W GRX7P38068 203 aa10.49□□□□□ -0.73
DDI1YER143W STM1P39015 273 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
DDI1YER143W RPT3P33298 428 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
DDI1YER143W GAS5Q08193 484 aa10.48□□□□□ -0.73
DDI1YER143W CYB2P00175 591 aa10.47□□□□□ -0.73
DDI1YER143W YKU70P32807 602 aa10.47□□□□□ -0.73
DDI1YER143W NPL4P33755 580 aa10.47□□□□□ -0.73
DDI1YER143W AIM9P40053 627 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
DDI1YER143W WRS1Q12109 432 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
DDI1YER143W SNF3P10870 884 aa10.46□□□□□ -0.73
DDI1YER143W YFH7P43591 353 aa10.46□□□□□ -0.73
DDI1YER143W RLF2Q12495 606 aa10.46□□□□□ -0.73
DDI1YER143W FLO11P08640 1367 aa10.46□□□□□ -0.74
DDI1YER143W IME2P32581 645 aa10.45□□□□□ -0.74
DDI1YER143W PTK1P36002 662 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
DDI1YER143W DPL1Q05567 589 aa10.45□□□□□ -0.74
DDI1YER143W PSF3Q12146 194 aa10.45□□□□□ -0.74
DDI1YER143W TAH18Q12181 623 aa10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 66.6 ms