RNA–Protein interactions for RNA: YER128W

VFA1, Transcript of Protein that interacts with Vps4p and has a role in vacuolar sorting, yeastyeast

Gene VFA1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1YER128W PEP12P32854 288 aa5.49□□□□□ -1.53
VFA1YER128W SCD5P34758 872 aa5.49□□□□□ -1.53
VFA1YER128W CUS1Q02554 436 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
VFA1YER128W HGH1P48362 394 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
VFA1YER128W ACS2P52910 683 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
VFA1YER128W AI3P03877 415 aa5.47□□□□□ -1.53
VFA1YER128W PHO87P25360 923 aa5.47□□□□□ -1.53
VFA1YER128W KAP122P32767 1081 aa5.47□□□□□ -1.53
VFA1YER128W APM2P38700 605 aa5.47□□□□□ -1.53
VFA1YER128W KTR7P40504 517 aa5.47□□□□□ -1.53
VFA1YER128W HAP4P14064 554 aa5.46□□□□□ -1.54
VFA1YER128W UBP1P25037 809 aa5.46□□□□□ -1.54
VFA1YER128W RRM3P38766 723 aa5.46□□□□□ -1.54
VFA1YER128W INP52P50942 1183 aa5.46□□□□□ -1.54
VFA1YER128W GAS4Q08271 471 aa5.46□□□□□ -1.54
VFA1YER128W SAC7P17121 654 aa5.45□□□□□ -1.54
VFA1YER128W GAS5Q08193 484 aa5.45□□□□□ -1.54
VFA1YER128W HXT5P38695 592 aa5.44□□□□□ -1.54
VFA1YER128W YNR040WP53736 256 aa5.44□□□□□ -1.54
VFA1YER128W NGR1P32831 672 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
VFA1YER128W ARI1P53111 347 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
VFA1YER128W RPC31P17890 251 aa5.42□□□□□ -1.54
VFA1YER128W PGM1P33401 570 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
VFA1YER128W IRC24P40580 263 aa5.42□□□□□ -1.54
VFA1YER128W COQ2P32378 372 aa5.41□□□□□ -1.54
VFA1YER128W SFA1P32771 386 aa5.41□□□□□ -1.54
VFA1YER128W QDR2P40474 542 aa5.41□□□□□ -1.54
VFA1YER128W IDI1P15496 288 aa5.39□□□□□ -1.55
VFA1YER128W SIS2P36024 562 aa5.39□□□□□ -1.55
VFA1YER128W SLP1Q12232 587 aa5.39□□□□□ -1.55
VFA1YER128W MRP10O75012 95 aa5.38□□□□□ -1.55
VFA1YER128W KAE1P36132 386 aa5.38□□□□□ -1.55
VFA1YER128W ROM1P53046 1155 aa5.38□□□□□ -1.55
VFA1YER128W GAL2P13181 574 aa5.37□□□□□ -1.55
VFA1YER128W VAN1P23642 535 aa5.37□□□□□ -1.55
VFA1YER128W RSC6P25632 483 aa5.37□□□□□ -1.55
VFA1YER128W CWH41P53008 833 aa5.37□□□□□ -1.55
VFA1YER128W MED7Q08278 222 aa5.37□□□□□ -1.55
VFA1YER128W YER156CP40093 338 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
VFA1YER128W ITC1P53125 1264 aa5.36□□□□□ -1.55
VFA1YER128W AVT1P47082 602 aa5.35□□□□□ -1.55
VFA1YER128W TRP3P00937 484 aa5.34□□□□□ -1.55
VFA1YER128W YKR073CP36153 106 aa5.34□□□□□ -1.55
VFA1YER128W YOR296WQ08748 1289 aa5.34□□□□□ -1.55
VFA1YER128W YLR122CQ12312 125 aa5.34□□□□□ -1.55
VFA1YER128W TRS33Q99394 268 aa5.34□□□□□ -1.55
VFA1YER128W TY4B-PA0A0B7P3V8 1104 aa5.33□□□□□ -1.56
VFA1YER128W LIP5P32875 414 aa5.33□□□□□ -1.56
VFA1YER128W DYS1P38791 387 aa5.33□□□□□ -1.56
VFA1YER128W TED1P40533 473 aa5.33□□□□□ -1.56
VFA1YER128W CAB1Q04430 367 aa5.33□□□□□ -1.56
VFA1YER128W TY4A-HQ6Q5P6 413 aa5.33□□□□□ -1.56
VFA1YER128W VMA3P25515 160 aa5.32□□□□□ -1.56
VFA1YER128W GIP2P40036 548 aa5.32□□□□□ -1.56
VFA1YER128W MRPL33P20084 86 aa5.31□□□□□ -1.56
VFA1YER128W GIP1P38229 639 aa5.31□□□□□ -1.56
VFA1YER128W TOS1P38288 455 aa5.31□□□□□ -1.56
VFA1YER128W SAF1P38352 637 aa5.31□□□□□ -1.56
VFA1YER128W SOK2P53438 785 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
VFA1YER128W FOX2Q02207 900 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
VFA1YER128W RSC2Q06488 889 aa5.31□□□□□ -1.56
VFA1YER128W TY1A-NL1Q12391 440 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
VFA1YER128W CHS2P14180 963 aa5.3□□□□□ -1.56
VFA1YER128W BSD2P38356 321 aa5.3□□□□□ -1.56
VFA1YER128W DSE4P53753 1117 aa5.3□□□□□ -1.56
VFA1YER128W SUV3P32580 737 aa5.29□□□□□ -1.56
VFA1YER128W TGL4P36165 910 aa5.29□□□□□ -1.56
VFA1YER128W LDH1P38139 375 aa5.29□□□□□ -1.56
VFA1YER128W YJL181WP46987 611 aa5.29□□□□□ -1.56
VFA1YER128W YGR130CP53278 816 aa5.29□□□□□ -1.56
VFA1YER128W ECM23Q02710 187 aa5.29□□□□□ -1.56
VFA1YER128W PUB1P32588 453 aaKnown RBP RIP-Chip data5.28□□□□□ -1.56not detected
VFA1YER128W AKR1P39010 764 aa5.28□□□□□ -1.56
VFA1YER128W ISW1P38144 1129 aa5.27□□□□□ -1.57
VFA1YER128W PPT1P53043 513 aa5.27□□□□□ -1.57
VFA1YER128W NAM7P30771 971 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
VFA1YER128W UBX7P38349 436 aa5.26□□□□□ -1.57
VFA1YER128W CTH1P47976 325 aa5.26□□□□□ -1.57
VFA1YER128W BRE4Q07660 1125 aa5.26□□□□□ -1.57
VFA1YER128W PUF3Q07807 879 aaKnown RBP RIP-Chip data5.26□□□□□ -1.57not detected
VFA1YER128W YBR197CP38306 217 aa5.25□□□□□ -1.57
VFA1YER128W YIL165CP40446 119 aa5.25□□□□□ -1.57
VFA1YER128W AOS1Q06624 347 aa5.25□□□□□ -1.57
VFA1YER128W REC8Q12188 680 aa5.25□□□□□ -1.57
VFA1YER128W CYC7P00045 113 aa5.23□□□□□ -1.57
VFA1YER128W TTI1P36097 1038 aa5.23□□□□□ -1.57
VFA1YER128W SPO74P45819 413 aa5.23□□□□□ -1.57
VFA1YER128W ISC10P32645 267 aa5.22□□□□□ -1.57
VFA1YER128W PAN5P38787 379 aa5.22□□□□□ -1.57
VFA1YER128W INP51P40559 946 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
VFA1YER128W ALD4P46367 519 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
VFA1YER128W MAG2Q06436 670 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
VFA1YER128W MSN1P22148 382 aa5.21□□□□□ -1.58
VFA1YER128W ELM1P32801 640 aa5.21□□□□□ -1.58
VFA1YER128W YBR287WP38355 427 aa5.21□□□□□ -1.58
VFA1YER128W LEM3P42838 414 aa5.21□□□□□ -1.58
VFA1YER128W GUP1P53154 560 aa5.21□□□□□ -1.58
VFA1YER128W FIR1P40020 876 aa5.19□□□□□ -1.58
VFA1YER128W MSB1P21339 1137 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
VFA1YER128W MAE1P36013 669 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
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