RNA–Protein interactions for RNA: YER116C

SLX8, Transcript of Subunit of Slx5-Slx8 SUMO-targeted ubiquitin ligase (STUbL) complex, yeast

Gene SLX8, Length 825 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX8	YER116C	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SLX8	YER116C	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SLX8	YER116C	BUB1	P41695	1021 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.04	□□□□□ -1.6	not detected
SLX8	YER116C	RPA14	P50106	137 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SLX8	YER116C	PUS6	P53294	404 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SLX8	YER116C	TBF1	Q02457	562 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SLX8	YER116C	YDR444W	Q04093	687 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SLX8	YER116C	SPR28	Q04921	423 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SLX8	YER116C	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SLX8	YER116C	PUS5	Q06244	254 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SLX8	YER116C	BDF2	Q07442	638 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SLX8	YER116C	ALR1	Q08269	859 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SLX8	YER116C	NKP1	Q12493	238 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SLX8	YER116C	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
SLX8	YER116C	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
SLX8	YER116C	QDR1	P40475	563 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SLX8	YER116C	YPP1	P46951	817 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SLX8	YER116C	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
SLX8	YER116C	PNP1	Q05788	311 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SLX8	YER116C	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	CLN2	P20438	545 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	PEP7	P32609	515 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	EMP47	P43555	445 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	MTO1	P53070	669 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	YPR097W	Q06839	1073 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	MIP1	P15801	1254 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	NUP82	P40368	713 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	CWC24	P53769	259 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	FOL1	P53848	824 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	SRM1	P21827	482 aa		5	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	IES1	P43579	692 aa		5	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	ACF4	P47129	309 aa		5	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	HUL5	P53119	910 aa		5	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	ITC1	P53125	1264 aa		5	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	PUN1	Q06991	263 aa		5	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	RAD27	P26793	382 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	ISF1	P32488	338 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	RPN12	P32496	274 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	DAK2	P43550	591 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	YJR115W	P47152	169 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	MCM16	Q12262	181 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	YDL206W	Q12424	762 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	ERP4	Q12450	207 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	TIM23	P32897	222 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	RSC30	P38781	883 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	PHO8	P11491	566 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	PHO87	P25360	923 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	DPB3	P27344	201 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	KIP2	P28743	706 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	MTC5	Q03897	1148 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	SPO20	Q04359	397 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SLX8	YER116C	SRS2	P12954	1174 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	MRC1	P25588	1096 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	UGA3	P26370	528 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	PEX8	P53248	589 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	YLR346C	Q06139	101 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	RAD4	P14736	754 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	IXR1	P33417	597 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	PET112	P33893	541 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	BLI1	P35727	113 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	TIM54	P47045	478 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	ROM1	P53046	1155 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	RMD1	Q03441	430 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	ATG16	Q03818	150 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	PPM2	Q08282	695 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	YOR378W	Q08902	515 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	HAP4	P14064	554 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	THI4	P32318	326 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	DAS1	P47005	663 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	YDL176W	Q12027	708 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	SLX4	Q12098	748 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	YLR125W	Q12138	136 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	SRF1	Q12516	437 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SLX8	YER116C	ADR1	P07248	1323 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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