RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000218686.1

Trappc6b-207, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc6b, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ism1A2ATD1 454 aa22.83■■□□□ 1.25
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ugt1a10E9PXN7 530 aa22.83■■□□□ 1.25
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm10378F6XQQ1 160 aa22.83■■□□□ 1.25
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 4933406M09RikG3XA12 479 aa22.83■■□□□ 1.25
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Hes2O54792 157 aa22.83■■□□□ 1.25
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cd160O88875 185 aa22.83■■□□□ 1.25
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Abcb1bP06795 1276 aa22.83■■□□□ 1.25
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Hoxb4P10284 250 aa22.83■■□□□ 1.25
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 AgtP11859 477 aa22.83■■□□□ 1.25
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gnat1P20612 350 aa22.83■■□□□ 1.25
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sox18P43680 377 aa22.83■■□□□ 1.25
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ddx6P54823 483 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Trim72Q1XH17 477 aa22.83■■□□□ 1.25
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Upf3bQ3ULL6 472 aa22.83■■□□□ 1.25
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ppp1r15bQ8BFW3 697 aa22.83■■□□□ 1.25
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Wipf1Q8K1I7 493 aa22.83■■□□□ 1.25
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pcolce2Q8R4W6 414 aa22.83■■□□□ 1.25
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Elmod3Q91YP6 381 aa22.83■■□□□ 1.25
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tgs1Q923W1 853 aa22.83■■□□□ 1.25
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm3854A0A1B0GSS6 495 aa22.82■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 SlkO54988 1233 aa22.82■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gja4P28235 333 aa22.82■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Stat4P42228 749 aa22.82■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ptgs2Q05769 604 aa22.82■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tcerg1lQ3B807 590 aa22.82■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gpr174Q3U507 335 aa22.82■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rhox12Q4TU81 186 aa22.82■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Dsg1aQ61495 1057 aa22.82■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zcchc2Q69ZB8 1166 aa22.82■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cct8l1Q80YT3 562 aa22.82■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Lig4Q8BTF7 911 aa22.82■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Nt5dc1Q8C5P5 467 aa22.82■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Q8CC96 669 aa22.82■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 AdigQ8R400 80 aa22.82■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Slc39a5Q9D856 535 aa22.82■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rwdd2aQ9D9S3 292 aa22.82■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Akip1Q9JJR5 212 aa22.82■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Hmgn5Q9JL35 406 aa22.82■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pdzd4Q9QY39 772 aa22.82■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 PtprdQ64487 1912 aa22.82■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 A0A286YCQ6 122 aa22.81■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm5483B2RV77 97 aa22.81■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Abcb5B5X0E4 1255 aa22.81■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ebf1Q07802 591 aa22.81■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gnl3Q8CI11 538 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 D8Ertd738eQ8R1F0 94 aa22.81■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Lrrc3bQ8VCH9 259 aa22.81■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Klhl10Q9D5V2 608 aa22.81■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 1700123K08RikQ9D991 295 aa22.81■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Smarcb1Q9Z0H3 385 aa22.81■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 2210011C24RikA0A087WQ89 206 aa22.8■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Olfr391-psA0A0U1RNJ4 312 aa22.8■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mindy4b-psA0A1W2P7H6 457 aa22.8■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 1700016G14RikA0A286YCZ6 238 aa22.8■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm1661E9Q963 441 aa22.8■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Chmp6P0C0A3 200 aa22.8■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Flt3lgP49772 232 aa22.8■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tbc1d12Q6A039 696 aa22.8■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 C1qtnf6Q6IR41 264 aa22.8■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Snx19Q6P4T1 997 aa22.8■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 EmsyQ8BMB0 1264 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Kcnk13Q8R1P5 405 aa22.8■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Vps36Q91XD6 386 aa22.8■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 MlklQ9D2Y4 472 aa22.8■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 4931423N10RikQ9D4J9 382 aa22.8■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rnf103Q9R1W3 683 aa22.8■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Kcnd2Q9Z0V2 630 aa22.8■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tex13aA2AFS9 377 aa22.79■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm4846B2RWH8 538 aa22.79■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 9330159F19RikD3Z623 648 aa22.79■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Colca2F8VPY8 239 aa22.79■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cavin1O54724 392 aa22.79■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 SrgnP13609 152 aa22.79■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 YwhaeP62259 255 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 CtrcQ3SYP2 268 aa22.79■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tmem35bQ3U0Y2 150 aa22.79■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Hepacam2Q4VAH7 463 aa22.79■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Slc20a1Q61609 681 aa22.79■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Six2Q62232 296 aa22.79■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Vtcn1Q7TSP5 283 aa22.79■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Dnajc16Q80TN4 772 aa22.79■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Kxd1Q80XH1 177 aa22.79■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Haus4Q8BFT2 363 aa22.79■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cdh7Q8BM92 785 aa22.79■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Slc7a14Q8BXR1 771 aa22.79■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 MtapQ9CQ65 283 aa22.79■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pcyox1Q9CQF9 505 aa22.79■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 SelenooQ9DBC0 667 aa22.79■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Xpo4Q9ESJ0 1151 aa22.79■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cdc7Q9Z0H0 564 aa22.79■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 FrylF8VQ05 3007 aa22.79■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Frem2Q6NVD0 3160 aa22.79■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 NbasE9Q411 2356 aa22.78■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sox5P35710 763 aa22.78■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rnf10Q3UIW5 804 aa22.78■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Bbof1Q3V079 533 aa22.78■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Nab2Q61127 525 aa22.78■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Spon2Q8BMS2 330 aa22.78■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Nipal1Q8BMW7 416 aa22.78■■□□□ 1.24
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tmem87aQ8BXN9 555 aa22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.5 ms