Protein–RNA interactions for Protein: D3Z623

9330159F19Rik, MCG7194, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9330159F19RikD3Z623 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
9330159F19RikD3Z623 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
9330159F19RikD3Z623 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
9330159F19RikD3Z623 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
9330159F19RikD3Z623 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
9330159F19RikD3Z623 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
9330159F19RikD3Z623 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
9330159F19RikD3Z623 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
9330159F19RikD3Z623 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
9330159F19RikD3Z623 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
9330159F19RikD3Z623 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
9330159F19RikD3Z623 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
9330159F19RikD3Z623 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
9330159F19RikD3Z623 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
9330159F19RikD3Z623 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
9330159F19RikD3Z623 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
9330159F19RikD3Z623 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
9330159F19RikD3Z623 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
9330159F19RikD3Z623 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
9330159F19RikD3Z623 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
9330159F19RikD3Z623 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
9330159F19RikD3Z623 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
9330159F19RikD3Z623 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
9330159F19RikD3Z623 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
9330159F19RikD3Z623 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
9330159F19RikD3Z623 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
9330159F19RikD3Z623 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
9330159F19RikD3Z623 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
9330159F19RikD3Z623 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
9330159F19RikD3Z623 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
9330159F19RikD3Z623 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
9330159F19RikD3Z623 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
9330159F19RikD3Z623 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
9330159F19RikD3Z623 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
9330159F19RikD3Z623 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
9330159F19RikD3Z623 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
9330159F19RikD3Z623 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
9330159F19RikD3Z623 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
9330159F19RikD3Z623 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
9330159F19RikD3Z623 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
9330159F19RikD3Z623 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
9330159F19RikD3Z623 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
9330159F19RikD3Z623 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
9330159F19RikD3Z623 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
9330159F19RikD3Z623 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
9330159F19RikD3Z623 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
9330159F19RikD3Z623 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
9330159F19RikD3Z623 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
9330159F19RikD3Z623 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
9330159F19RikD3Z623 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
9330159F19RikD3Z623 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
9330159F19RikD3Z623 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
9330159F19RikD3Z623 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
9330159F19RikD3Z623 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
9330159F19RikD3Z623 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
9330159F19RikD3Z623 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
9330159F19RikD3Z623 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
9330159F19RikD3Z623 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
9330159F19RikD3Z623 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
9330159F19RikD3Z623 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
9330159F19RikD3Z623 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
9330159F19RikD3Z623 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
9330159F19RikD3Z623 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
9330159F19RikD3Z623 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
9330159F19RikD3Z623 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
9330159F19RikD3Z623 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
9330159F19RikD3Z623 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
9330159F19RikD3Z623 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
9330159F19RikD3Z623 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
9330159F19RikD3Z623 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
9330159F19RikD3Z623 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
9330159F19RikD3Z623 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
9330159F19RikD3Z623 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
9330159F19RikD3Z623 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
9330159F19RikD3Z623 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
9330159F19RikD3Z623 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
9330159F19RikD3Z623 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
9330159F19RikD3Z623 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
9330159F19RikD3Z623 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
9330159F19RikD3Z623 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
9330159F19RikD3Z623 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
9330159F19RikD3Z623 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
9330159F19RikD3Z623 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
9330159F19RikD3Z623 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
9330159F19RikD3Z623 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
9330159F19RikD3Z623 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
9330159F19RikD3Z623 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
9330159F19RikD3Z623 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
9330159F19RikD3Z623 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
9330159F19RikD3Z623 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
9330159F19RikD3Z623 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
9330159F19RikD3Z623 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
9330159F19RikD3Z623 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
9330159F19RikD3Z623 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
9330159F19RikD3Z623 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
9330159F19RikD3Z623 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
9330159F19RikD3Z623 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
9330159F19RikD3Z623 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
9330159F19RikD3Z623 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
9330159F19RikD3Z623 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms