Protein–RNA interactions for Protein: P13609

Srgn, Serglycin, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrgnP13609 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40,07■■■■■ 4,01
SrgnP13609 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37,03■■■■□ 3,52
SrgnP13609 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,49■■■■□ 3,43
SrgnP13609 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35,05■■■■□ 3,2
SrgnP13609 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34,73■■■■□ 3,15
SrgnP13609 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,67■■■■□ 3,14
SrgnP13609 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34,33■■■■□ 3,09
SrgnP13609 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
SrgnP13609 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,02
SrgnP13609 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3
SrgnP13609 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,54■■■□□ 2,96
SrgnP13609 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33,52■■■□□ 2,96
SrgnP13609 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33,43■■■□□ 2,94
SrgnP13609 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
SrgnP13609 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,77■■■□□ 2,84
SrgnP13609 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,71■■■□□ 2,83
SrgnP13609 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32,55■■■□□ 2,8
SrgnP13609 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
SrgnP13609 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32,34■■■□□ 2,77
SrgnP13609 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32,34■■■□□ 2,77
SrgnP13609 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,31■■■□□ 2,76
SrgnP13609 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32,16■■■□□ 2,74
SrgnP13609 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,09■■■□□ 2,73
SrgnP13609 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,03■■■□□ 2,72
SrgnP13609 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,03■■■□□ 2,72
SrgnP13609 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,03■■■□□ 2,72
SrgnP13609 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,96■■■□□ 2,71
SrgnP13609 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,94■■■□□ 2,7
SrgnP13609 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,92■■■□□ 2,7
SrgnP13609 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31,87■■■□□ 2,69
SrgnP13609 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,82■■■□□ 2,68
SrgnP13609 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,75■■■□□ 2,67
SrgnP13609 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
SrgnP13609 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,66
SrgnP13609 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31,64■■■□□ 2,66
SrgnP13609 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31,53■■■□□ 2,64
SrgnP13609 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,42■■■□□ 2,62
SrgnP13609 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31,28■■■□□ 2,6
SrgnP13609 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
SrgnP13609 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
SrgnP13609 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
SrgnP13609 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30,97■■■□□ 2,55
SrgnP13609 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
SrgnP13609 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30,86■■■□□ 2,53
SrgnP13609 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,52
SrgnP13609 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30,74■■■□□ 2,51
SrgnP13609 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
SrgnP13609 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
SrgnP13609 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30,68■■■□□ 2,5
SrgnP13609 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30,62■■■□□ 2,49
SrgnP13609 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
SrgnP13609 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,55■■■□□ 2,48
SrgnP13609 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30,5■■■□□ 2,47
SrgnP13609 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30,46■■■□□ 2,47
SrgnP13609 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
SrgnP13609 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30,32■■■□□ 2,44
SrgnP13609 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
SrgnP13609 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30,21■■■□□ 2,43
SrgnP13609 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
SrgnP13609 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
SrgnP13609 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
SrgnP13609 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
SrgnP13609 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30,12■■■□□ 2,41
SrgnP13609 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,11■■■□□ 2,41
SrgnP13609 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
SrgnP13609 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30,02■■■□□ 2,4
SrgnP13609 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
SrgnP13609 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
SrgnP13609 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29,89■■■□□ 2,37
SrgnP13609 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29,88■■■□□ 2,37
SrgnP13609 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
SrgnP13609 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
SrgnP13609 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,85■■■□□ 2,37
SrgnP13609 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29,84■■■□□ 2,37
SrgnP13609 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
SrgnP13609 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
SrgnP13609 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
SrgnP13609 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29,79■■■□□ 2,36
SrgnP13609 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
SrgnP13609 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
SrgnP13609 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
SrgnP13609 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29,72■■■□□ 2,35
SrgnP13609 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,7■■■□□ 2,34
SrgnP13609 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,33
SrgnP13609 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29,61■■■□□ 2,33
SrgnP13609 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,57■■■□□ 2,32
SrgnP13609 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,56■■■□□ 2,32
SrgnP13609 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
SrgnP13609 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29,54■■■□□ 2,32
SrgnP13609 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
SrgnP13609 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
SrgnP13609 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
SrgnP13609 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29,43■■■□□ 2,3
SrgnP13609 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
SrgnP13609 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
SrgnP13609 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
SrgnP13609 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
SrgnP13609 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
SrgnP13609 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29,31■■■□□ 2,28
SrgnP13609 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40,2 ms