Protein–RNA interactions for Protein: P35710

Sox5, Transcription factor SOX-5, mousemouse

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox5P35710 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38,48■■■■□ 3,75
Sox5P35710 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,12■■■■□ 3,69
Sox5P35710 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,83■■■■□ 3,49
Sox5P35710 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,77■■■■□ 3,48
Sox5P35710 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35,65■■■■□ 3,3
Sox5P35710 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35,14■■■■□ 3,22
Sox5P35710 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
Sox5P35710 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,83■■■■□ 3,17
Sox5P35710 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,74■■■■□ 3,15
Sox5P35710 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,69■■■■□ 3,14
Sox5P35710 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34,52■■■■□ 3,12
Sox5P35710 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Sox5P35710 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,32■■■■□ 3,08
Sox5P35710 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34,1■■■■□ 3,05
Sox5P35710 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Sox5P35710 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Sox5P35710 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Sox5P35710 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33,97■■■■□ 3,03
Sox5P35710 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,61■■■□□ 2,97
Sox5P35710 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,53■■■□□ 2,96
Sox5P35710 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Sox5P35710 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,24■■■□□ 2,91
Sox5P35710 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,24■■■□□ 2,91
Sox5P35710 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Sox5P35710 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,1■■■□□ 2,89
Sox5P35710 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33,09■■■□□ 2,89
Sox5P35710 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Sox5P35710 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
Sox5P35710 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,06■■■□□ 2,88
Sox5P35710 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32,97■■■□□ 2,87
Sox5P35710 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,96■■■□□ 2,87
Sox5P35710 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
Sox5P35710 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32,86■■■□□ 2,85
Sox5P35710 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32,83■■■□□ 2,85
Sox5P35710 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Sox5P35710 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,68■■■□□ 2,82
Sox5P35710 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
Sox5P35710 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32,6■■■□□ 2,81
Sox5P35710 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Sox5P35710 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32,32■■■□□ 2,76
Sox5P35710 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Sox5P35710 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,76
Sox5P35710 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32,26■■■□□ 2,75
Sox5P35710 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32,23■■■□□ 2,75
Sox5P35710 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
Sox5P35710 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32,11■■■□□ 2,73
Sox5P35710 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
Sox5P35710 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,96■■■□□ 2,71
Sox5P35710 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31,96■■■□□ 2,71
Sox5P35710 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,86■■■□□ 2,69
Sox5P35710 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31,85■■■□□ 2,69
Sox5P35710 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31,72■■■□□ 2,67
Sox5P35710 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,69■■■□□ 2,66
Sox5P35710 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31,67■■■□□ 2,66
Sox5P35710 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31,63■■■□□ 2,65
Sox5P35710 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Sox5P35710 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,59■■■□□ 2,65
Sox5P35710 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Sox5P35710 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,64
Sox5P35710 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,63
Sox5P35710 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,47■■■□□ 2,63
Sox5P35710 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31,46■■■□□ 2,63
Sox5P35710 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,46■■■□□ 2,63
Sox5P35710 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31,42■■■□□ 2,62
Sox5P35710 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
Sox5P35710 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Sox5P35710 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Sox5P35710 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,27■■■□□ 2,6
Sox5P35710 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Sox5P35710 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Sox5P35710 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Sox5P35710 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Sox5P35710 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31,06■■■□□ 2,56
Sox5P35710 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,99■■■□□ 2,55
Sox5P35710 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Sox5P35710 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Sox5P35710 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Sox5P35710 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Sox5P35710 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Sox5P35710 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,5
Sox5P35710 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Sox5P35710 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Sox5P35710 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30,64■■■□□ 2,5
Sox5P35710 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Sox5P35710 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Sox5P35710 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
Sox5P35710 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Sox5P35710 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,48■■■□□ 2,47
Sox5P35710 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Sox5P35710 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,47
Sox5P35710 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30,45■■■□□ 2,47
Sox5P35710 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,47
Sox5P35710 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Sox5P35710 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Sox5P35710 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30,39■■■□□ 2,46
Sox5P35710 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
Sox5P35710 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Sox5P35710 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30,33■■■□□ 2,45
Sox5P35710 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Sox5P35710 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30,23■■■□□ 2,43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms