Protein–RNA interactions for Protein: Q05769

Ptgs2, Prostaglandin G/H synthase 2, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptgs2Q05769 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
Ptgs2Q05769 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Ptgs2Q05769 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ptgs2Q05769 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Ptgs2Q05769 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Ptgs2Q05769 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Ptgs2Q05769 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
Ptgs2Q05769 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Ptgs2Q05769 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ptgs2Q05769 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Ptgs2Q05769 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Ptgs2Q05769 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ptgs2Q05769 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Ptgs2Q05769 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ptgs2Q05769 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ptgs2Q05769 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ptgs2Q05769 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Ptgs2Q05769 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ptgs2Q05769 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ptgs2Q05769 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ptgs2Q05769 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ptgs2Q05769 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ptgs2Q05769 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ptgs2Q05769 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ptgs2Q05769 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ptgs2Q05769 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Ptgs2Q05769 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ptgs2Q05769 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ptgs2Q05769 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ptgs2Q05769 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ptgs2Q05769 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ptgs2Q05769 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Ptgs2Q05769 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ptgs2Q05769 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ptgs2Q05769 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Ptgs2Q05769 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ptgs2Q05769 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ptgs2Q05769 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ptgs2Q05769 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ptgs2Q05769 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ptgs2Q05769 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ptgs2Q05769 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ptgs2Q05769 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ptgs2Q05769 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Ptgs2Q05769 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ptgs2Q05769 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ptgs2Q05769 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ptgs2Q05769 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ptgs2Q05769 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ptgs2Q05769 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ptgs2Q05769 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ptgs2Q05769 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ptgs2Q05769 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ptgs2Q05769 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Ptgs2Q05769 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ptgs2Q05769 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ptgs2Q05769 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ptgs2Q05769 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Ptgs2Q05769 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ptgs2Q05769 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ptgs2Q05769 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Ptgs2Q05769 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ptgs2Q05769 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ptgs2Q05769 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Ptgs2Q05769 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ptgs2Q05769 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ptgs2Q05769 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Ptgs2Q05769 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ptgs2Q05769 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ptgs2Q05769 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ptgs2Q05769 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Ptgs2Q05769 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ptgs2Q05769 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ptgs2Q05769 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ptgs2Q05769 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ptgs2Q05769 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ptgs2Q05769 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ptgs2Q05769 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ptgs2Q05769 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ptgs2Q05769 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ptgs2Q05769 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ptgs2Q05769 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ptgs2Q05769 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ptgs2Q05769 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ptgs2Q05769 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ptgs2Q05769 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ptgs2Q05769 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ptgs2Q05769 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ptgs2Q05769 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ptgs2Q05769 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ptgs2Q05769 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Ptgs2Q05769 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ptgs2Q05769 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ptgs2Q05769 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Ptgs2Q05769 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ptgs2Q05769 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ptgs2Q05769 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ptgs2Q05769 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ptgs2Q05769 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ptgs2Q05769 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms