Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.72■■■■□ 3.95
Dsg1aQ61495 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Dsg1aQ61495 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Dsg1aQ61495 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Dsg1aQ61495 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Dsg1aQ61495 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Dsg1aQ61495 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
Dsg1aQ61495 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Dsg1aQ61495 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Dsg1aQ61495 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Dsg1aQ61495 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Dsg1aQ61495 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Dsg1aQ61495 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Dsg1aQ61495 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Dsg1aQ61495 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Dsg1aQ61495 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Dsg1aQ61495 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Dsg1aQ61495 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Dsg1aQ61495 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Dsg1aQ61495 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Dsg1aQ61495 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Dsg1aQ61495 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Dsg1aQ61495 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Dsg1aQ61495 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Dsg1aQ61495 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Dsg1aQ61495 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Dsg1aQ61495 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Dsg1aQ61495 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Dsg1aQ61495 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Dsg1aQ61495 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Dsg1aQ61495 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Dsg1aQ61495 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Dsg1aQ61495 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Dsg1aQ61495 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Dsg1aQ61495 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Dsg1aQ61495 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Dsg1aQ61495 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Dsg1aQ61495 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Dsg1aQ61495 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Dsg1aQ61495 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Dsg1aQ61495 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Dsg1aQ61495 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Dsg1aQ61495 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Dsg1aQ61495 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Dsg1aQ61495 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Dsg1aQ61495 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Dsg1aQ61495 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Dsg1aQ61495 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Dsg1aQ61495 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Dsg1aQ61495 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Dsg1aQ61495 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Dsg1aQ61495 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Dsg1aQ61495 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Dsg1aQ61495 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Dsg1aQ61495 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Dsg1aQ61495 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Dsg1aQ61495 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Dsg1aQ61495 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Dsg1aQ61495 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Dsg1aQ61495 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Dsg1aQ61495 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Dsg1aQ61495 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Dsg1aQ61495 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Dsg1aQ61495 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Dsg1aQ61495 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Dsg1aQ61495 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Dsg1aQ61495 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Dsg1aQ61495 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Dsg1aQ61495 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Dsg1aQ61495 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Dsg1aQ61495 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Dsg1aQ61495 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Dsg1aQ61495 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Dsg1aQ61495 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Dsg1aQ61495 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Dsg1aQ61495 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Dsg1aQ61495 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Dsg1aQ61495 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Dsg1aQ61495 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Dsg1aQ61495 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Dsg1aQ61495 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Dsg1aQ61495 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Dsg1aQ61495 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Dsg1aQ61495 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Dsg1aQ61495 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Dsg1aQ61495 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Dsg1aQ61495 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Dsg1aQ61495 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Dsg1aQ61495 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Dsg1aQ61495 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Dsg1aQ61495 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Dsg1aQ61495 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Dsg1aQ61495 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Dsg1aQ61495 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Dsg1aQ61495 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Dsg1aQ61495 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Dsg1aQ61495 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Dsg1aQ61495 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Dsg1aQ61495 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Dsg1aQ61495 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms