Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ89

2210011C24Rik, MCG5930, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
2210011C24RikA0A087WQ89 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
2210011C24RikA0A087WQ89 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
2210011C24RikA0A087WQ89 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
2210011C24RikA0A087WQ89 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
2210011C24RikA0A087WQ89 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
2210011C24RikA0A087WQ89 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
2210011C24RikA0A087WQ89 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
2210011C24RikA0A087WQ89 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
2210011C24RikA0A087WQ89 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
2210011C24RikA0A087WQ89 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
2210011C24RikA0A087WQ89 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
2210011C24RikA0A087WQ89 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
2210011C24RikA0A087WQ89 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
2210011C24RikA0A087WQ89 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
2210011C24RikA0A087WQ89 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
2210011C24RikA0A087WQ89 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
2210011C24RikA0A087WQ89 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
2210011C24RikA0A087WQ89 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
2210011C24RikA0A087WQ89 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
2210011C24RikA0A087WQ89 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
2210011C24RikA0A087WQ89 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
2210011C24RikA0A087WQ89 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
2210011C24RikA0A087WQ89 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
2210011C24RikA0A087WQ89 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
2210011C24RikA0A087WQ89 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
2210011C24RikA0A087WQ89 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
2210011C24RikA0A087WQ89 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
2210011C24RikA0A087WQ89 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
2210011C24RikA0A087WQ89 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
2210011C24RikA0A087WQ89 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
2210011C24RikA0A087WQ89 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
2210011C24RikA0A087WQ89 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
2210011C24RikA0A087WQ89 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
2210011C24RikA0A087WQ89 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
2210011C24RikA0A087WQ89 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
2210011C24RikA0A087WQ89 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
2210011C24RikA0A087WQ89 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
2210011C24RikA0A087WQ89 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
2210011C24RikA0A087WQ89 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
2210011C24RikA0A087WQ89 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
2210011C24RikA0A087WQ89 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
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2210011C24RikA0A087WQ89 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
2210011C24RikA0A087WQ89 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
2210011C24RikA0A087WQ89 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
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2210011C24RikA0A087WQ89 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
2210011C24RikA0A087WQ89 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
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2210011C24RikA0A087WQ89 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
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2210011C24RikA0A087WQ89 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
2210011C24RikA0A087WQ89 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
2210011C24RikA0A087WQ89 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
2210011C24RikA0A087WQ89 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
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2210011C24RikA0A087WQ89 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
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2210011C24RikA0A087WQ89 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
2210011C24RikA0A087WQ89 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
2210011C24RikA0A087WQ89 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
2210011C24RikA0A087WQ89 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
2210011C24RikA0A087WQ89 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
2210011C24RikA0A087WQ89 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
2210011C24RikA0A087WQ89 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
2210011C24RikA0A087WQ89 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
2210011C24RikA0A087WQ89 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
2210011C24RikA0A087WQ89 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
2210011C24RikA0A087WQ89 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
2210011C24RikA0A087WQ89 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
2210011C24RikA0A087WQ89 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
2210011C24RikA0A087WQ89 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
2210011C24RikA0A087WQ89 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
2210011C24RikA0A087WQ89 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
2210011C24RikA0A087WQ89 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
2210011C24RikA0A087WQ89 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
2210011C24RikA0A087WQ89 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
2210011C24RikA0A087WQ89 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
2210011C24RikA0A087WQ89 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
2210011C24RikA0A087WQ89 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
2210011C24RikA0A087WQ89 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
2210011C24RikA0A087WQ89 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
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