Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.62■■■■□ 3.93
Gja4P28235 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Gja4P28235 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Gja4P28235 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Gja4P28235 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Gja4P28235 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Gja4P28235 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Gja4P28235 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Gja4P28235 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Gja4P28235 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Gja4P28235 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Gja4P28235 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Gja4P28235 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Gja4P28235 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Gja4P28235 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Gja4P28235 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Gja4P28235 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Gja4P28235 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Gja4P28235 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Gja4P28235 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Gja4P28235 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Gja4P28235 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Gja4P28235 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Gja4P28235 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Gja4P28235 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Gja4P28235 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Gja4P28235 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Gja4P28235 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
Gja4P28235 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Gja4P28235 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Gja4P28235 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Gja4P28235 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Gja4P28235 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Gja4P28235 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Gja4P28235 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Gja4P28235 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Gja4P28235 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Gja4P28235 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Gja4P28235 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Gja4P28235 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Gja4P28235 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Gja4P28235 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Gja4P28235 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Gja4P28235 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Gja4P28235 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Gja4P28235 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Gja4P28235 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Gja4P28235 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Gja4P28235 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Gja4P28235 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
Gja4P28235 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Gja4P28235 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gja4P28235 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Gja4P28235 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gja4P28235 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gja4P28235 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Gja4P28235 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gja4P28235 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Gja4P28235 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Gja4P28235 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Gja4P28235 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gja4P28235 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gja4P28235 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gja4P28235 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Gja4P28235 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Gja4P28235 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gja4P28235 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gja4P28235 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Gja4P28235 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gja4P28235 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gja4P28235 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gja4P28235 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Gja4P28235 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gja4P28235 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gja4P28235 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gja4P28235 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gja4P28235 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gja4P28235 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Gja4P28235 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Gja4P28235 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gja4P28235 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gja4P28235 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gja4P28235 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gja4P28235 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gja4P28235 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gja4P28235 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Gja4P28235 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gja4P28235 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gja4P28235 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gja4P28235 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gja4P28235 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gja4P28235 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gja4P28235 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gja4P28235 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gja4P28235 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Gja4P28235 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gja4P28235 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gja4P28235 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Gja4P28235 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Gja4P28235 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms