Protein–RNA interactions for Protein: P11859

Agt, Angiotensinogen, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgtP11859 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38,66■■■■□ 3,78
AgtP11859 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,79■■■■□ 3,64
AgtP11859 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,61■■■■□ 3,45
AgtP11859 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,52■■■■□ 3,44
AgtP11859 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,24
AgtP11859 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35,3■■■■□ 3,24
AgtP11859 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,94■■■■□ 3,18
AgtP11859 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,89■■■■□ 3,18
AgtP11859 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34,62■■■■□ 3,13
AgtP11859 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,45■■■■□ 3,11
AgtP11859 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
AgtP11859 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
AgtP11859 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34,05■■■■□ 3,04
AgtP11859 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34■■■■□ 3,03
AgtP11859 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
AgtP11859 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3
AgtP11859 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
AgtP11859 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
AgtP11859 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
AgtP11859 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,23■■■□□ 2,91
AgtP11859 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,21■■■□□ 2,91
AgtP11859 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
AgtP11859 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33,15■■■□□ 2,9
AgtP11859 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,1■■■□□ 2,89
AgtP11859 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,06■■■□□ 2,88
AgtP11859 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,06■■■□□ 2,88
AgtP11859 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33,05■■■□□ 2,88
AgtP11859 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
AgtP11859 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
AgtP11859 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32,79■■■□□ 2,84
AgtP11859 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
AgtP11859 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
AgtP11859 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,68■■■□□ 2,82
AgtP11859 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,64■■■□□ 2,82
AgtP11859 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
AgtP11859 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
AgtP11859 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32,39■■■□□ 2,78
AgtP11859 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32,36■■■□□ 2,77
AgtP11859 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32,35■■■□□ 2,77
AgtP11859 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,76
AgtP11859 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,24■■■□□ 2,75
AgtP11859 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32,21■■■□□ 2,75
AgtP11859 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,19■■■□□ 2,74
AgtP11859 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32,15■■■□□ 2,74
AgtP11859 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
AgtP11859 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,06■■■□□ 2,72
AgtP11859 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32,05■■■□□ 2,72
AgtP11859 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31,96■■■□□ 2,71
AgtP11859 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31,8■■■□□ 2,68
AgtP11859 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31,79■■■□□ 2,68
AgtP11859 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
AgtP11859 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
AgtP11859 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31,51■■■□□ 2,64
AgtP11859 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
AgtP11859 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
AgtP11859 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
AgtP11859 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31,32■■■□□ 2,6
AgtP11859 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
AgtP11859 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31,23■■■□□ 2,59
AgtP11859 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,2■■■□□ 2,58
AgtP11859 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,15■■■□□ 2,58
AgtP11859 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
AgtP11859 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
AgtP11859 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
AgtP11859 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
AgtP11859 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
AgtP11859 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
AgtP11859 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31,01■■■□□ 2,55
AgtP11859 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,98■■■□□ 2,55
AgtP11859 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
AgtP11859 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,95■■■□□ 2,55
AgtP11859 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
AgtP11859 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
AgtP11859 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
AgtP11859 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
AgtP11859 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30,65■■■□□ 2,5
AgtP11859 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
AgtP11859 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
AgtP11859 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30,54■■■□□ 2,48
AgtP11859 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30,54■■■□□ 2,48
AgtP11859 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
AgtP11859 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
AgtP11859 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
AgtP11859 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
AgtP11859 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
AgtP11859 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
AgtP11859 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
AgtP11859 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
AgtP11859 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
AgtP11859 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
AgtP11859 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
AgtP11859 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,29■■■□□ 2,44
AgtP11859 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
AgtP11859 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
AgtP11859 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30,26■■■□□ 2,43
AgtP11859 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
AgtP11859 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
AgtP11859 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,41
AgtP11859 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30,13■■■□□ 2,41
AgtP11859 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,5 ms