Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39,19■■■■□ 3,86
PtprdQ64487 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36,39■■■■□ 3,42
PtprdQ64487 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,52■■■■□ 3,28
PtprdQ64487 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34,39■■■■□ 3,1
PtprdQ64487 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,37■■■■□ 3,09
PtprdQ64487 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34,14■■■■□ 3,06
PtprdQ64487 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33,92■■■■□ 3,02
PtprdQ64487 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
PtprdQ64487 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,27■■■□□ 2,92
PtprdQ64487 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,17■■■□□ 2,9
PtprdQ64487 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
PtprdQ64487 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,78■■■□□ 2,84
PtprdQ64487 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
PtprdQ64487 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32,67■■■□□ 2,82
PtprdQ64487 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
PtprdQ64487 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32,16■■■□□ 2,74
PtprdQ64487 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
PtprdQ64487 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31,85■■■□□ 2,69
PtprdQ64487 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,83■■■□□ 2,69
PtprdQ64487 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,77■■■□□ 2,68
PtprdQ64487 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,71■■■□□ 2,67
PtprdQ64487 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,68■■■□□ 2,66
PtprdQ64487 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,66
PtprdQ64487 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,61■■■□□ 2,65
PtprdQ64487 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31,57■■■□□ 2,64
PtprdQ64487 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,55■■■□□ 2,64
PtprdQ64487 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31,51■■■□□ 2,64
PtprdQ64487 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31,49■■■□□ 2,63
PtprdQ64487 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
PtprdQ64487 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
PtprdQ64487 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,36■■■□□ 2,61
PtprdQ64487 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
PtprdQ64487 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
PtprdQ64487 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
PtprdQ64487 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
PtprdQ64487 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30,96■■■□□ 2,55
PtprdQ64487 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30,92■■■□□ 2,54
PtprdQ64487 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30,88■■■□□ 2,53
PtprdQ64487 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
PtprdQ64487 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
PtprdQ64487 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
PtprdQ64487 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
PtprdQ64487 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30,39■■■□□ 2,46
PtprdQ64487 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
PtprdQ64487 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30,33■■■□□ 2,45
PtprdQ64487 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
PtprdQ64487 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30,22■■■□□ 2,43
PtprdQ64487 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30,2■■■□□ 2,42
PtprdQ64487 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,42
PtprdQ64487 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
PtprdQ64487 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
PtprdQ64487 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
PtprdQ64487 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30,07■■■□□ 2,4
PtprdQ64487 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
PtprdQ64487 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29,94■■■□□ 2,38
PtprdQ64487 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,93■■■□□ 2,38
PtprdQ64487 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29,86■■■□□ 2,37
PtprdQ64487 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29,79■■■□□ 2,36
PtprdQ64487 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
PtprdQ64487 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,68■■■□□ 2,34
PtprdQ64487 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
PtprdQ64487 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
PtprdQ64487 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
PtprdQ64487 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
PtprdQ64487 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
PtprdQ64487 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29,55■■■□□ 2,32
PtprdQ64487 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29,54■■■□□ 2,32
PtprdQ64487 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
PtprdQ64487 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
PtprdQ64487 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29,47■■■□□ 2,31
PtprdQ64487 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
PtprdQ64487 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,4■■■□□ 2,3
PtprdQ64487 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
PtprdQ64487 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
PtprdQ64487 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
PtprdQ64487 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29,33■■■□□ 2,29
PtprdQ64487 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29,32■■■□□ 2,28
PtprdQ64487 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
PtprdQ64487 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,29■■■□□ 2,28
PtprdQ64487 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
PtprdQ64487 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
PtprdQ64487 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29,24■■■□□ 2,27
PtprdQ64487 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
PtprdQ64487 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29,22■■■□□ 2,27
PtprdQ64487 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29,17■■■□□ 2,26
PtprdQ64487 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,15■■■□□ 2,26
PtprdQ64487 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,25
PtprdQ64487 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,09■■■□□ 2,25
PtprdQ64487 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
PtprdQ64487 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29,05■■■□□ 2,24
PtprdQ64487 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
PtprdQ64487 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
PtprdQ64487 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29,02■■■□□ 2,24
PtprdQ64487 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
PtprdQ64487 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29■■■□□ 2,23
PtprdQ64487 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28,95■■■□□ 2,23
PtprdQ64487 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28,87■■■□□ 2,21
PtprdQ64487 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
PtprdQ64487 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,84■■■□□ 2,21
PtprdQ64487 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
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