RNA–Protein interactions for RNA: YKL049C

CSE4, Transcript of Centromere protein that resembles histone H3, yeastyeast

Gene CSE4, Length 690 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSE4YKL049C MIX14Q04341 121 aa1.41□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C YMR103CQ04436 120 aa1.41□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C UPS1Q05776 175 aa1.41□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C RAF1Q06891 181 aa1.41□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C RRS1Q08746 203 aaKnown RBP1.41□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C PRM3Q08931 133 aa1.41□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C NIP7Q08962 181 aaKnown RBP1.41□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C YPL261CQ08976 102 aa1.41□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C YGL258W-AQ3E740 77 aa1.41□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C FLO9P39712 1322 aa1.4□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C RPL27AP0C2H6 136 aaKnown RBP1.4□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YHR214C-DP0CX93 97 aa1.4□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C HMRA2P0CY13 119 aa1.4□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C MRPL31P14063 131 aaPredicted RBP1.4□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C ROX3P25046 220 aa1.4□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YCR085WP25650 117 aa1.4□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C RPA12P32529 125 aaKnown RBP1.4□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C VMA11P32842 164 aa1.4□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C RPS27AP35997 82 aaKnown RBP1.4□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YKR041WP36134 250 aa1.4□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YBL071CP38185 102 aa1.4□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C RPS27BP38711 82 aa1.4□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C DSE2P38844 325 aa1.4□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C SNF11P38956 169 aa1.4□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YER085CP40058 173 aa1.4□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C LST8P41318 303 aa1.4□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C CIS3P47001 227 aa1.4□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YIP3P53633 176 aa1.4□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C HSK3P69852 69 aa1.4□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YIL014C-AQ02598 104 aa1.4□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YLR296WQ05898 108 aa1.4□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C LSM6Q06406 86 aaKnown RBP1.4□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YOL118CQ08259 102 aa1.4□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C DGA1Q08650 418 aa1.4□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C FIT2Q08906 153 aa1.4□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YRA1Q12159 226 aaKnown RBP1.4□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YKL023C-AQ2V2P3 75 aa1.4□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YLR361C-AQ3E795 98 aa1.4□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C CYR1P08678 2026 aaKnown RBP1.39□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C ECM12O13529 151 aa1.39□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YMR31P19955 123 aa1.39□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C FZF1P32805 299 aa1.39□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YHR140WP38842 239 aa1.39□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YER076CP40049 302 aa1.39□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YNL217WP40152 326 aa1.39□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C KNH1P50112 268 aa1.39□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C BRP1P53194 125 aa1.39□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C AIM11P87275 137 aa1.39□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C GRE1Q08969 168 aa1.39□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YDR029WQ12111 104 aa1.39□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C FCY1Q12178 158 aa1.39□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YOR097CQ12274 175 aaPredicted RBP1.39□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C IGO2Q9P305 131 aa1.39□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C SRX1P36077 127 aa1.38□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C RRT1P38192 103 aa1.38□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C CSH1P38287 376 aa1.38□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YER121WP40076 114 aa1.38□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C FIP1P45976 327 aa1.38□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C SKI6P46948 246 aaPredicted RBP1.38□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YGR219WP53307 113 aa1.38□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YDR042CQ03205 200 aa1.38□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C GPI19Q04082 140 aa1.38□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YLR194CQ05777 254 aa1.38□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YFL041W-AQ3E817 63 aa1.38□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C ENV10Q99382 181 aa1.38□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YPL229WQ99395 206 aa1.38□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YHR139C-AO13536 103 aa1.37□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C RPL28P02406 149 aaKnown RBP1.37□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C PFY1P07274 126 aa1.37□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YBR121C-AP0C5L4 52 aa1.37□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C PBI2P0CT04 75 aaKnown RBP1.37□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C PHO85P17157 305 aa1.37□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C FPR1P20081 114 aaKnown RBP1.37□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C FPR2P32472 135 aa1.37□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data1.37□□□□□ -2.19not detected
CSE4YKL049C MIC12P38341 106 aa1.37□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YHL042WP38729 150 aa1.37□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C GLE2P40066 365 aa1.37□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YMR141CP40211 102 aa1.37□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YFL051CP43552 160 aa1.37□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YNL046WP53956 172 aa1.37□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C AIM34Q03673 198 aa1.37□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C MSA1Q08471 629 aa1.37□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YLR342W-AQ3E810 57 aa1.37□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C CDC39P25655 2108 aaKnown RBP1.36□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C TOM6P33448 61 aa1.36□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YHR022CP38763 256 aa1.36□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C VTC1P40046 129 aaRIP-Chip data1.36□□□□□ -2.19not detected
CSE4YKL049C AIM19P40502 157 aa1.36□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YIL086CP40503 102 aa1.36□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C HUR1P45820 110 aa1.36□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YLR042CQ07990 161 aa1.36□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YOR029WQ12243 111 aa1.36□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YOR008C-AQ3E7B9 74 aa1.36□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YER039C-AP0CD97 72 aa1.35□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C ATP15P21306 62 aa1.35□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C BET1P22804 142 aa1.35□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YCR050CP25630 102 aa1.35□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YBR209WP38311 105 aa1.35□□□□□ -2.19
CSE4YKL049C YSY6P38374 65 aa1.35□□□□□ -2.19
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