Protein–RNA interactions for Protein: P40211

YMR141C, Uncharacterized protein YMR141C, yeastyeast

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR141CP40211 NSR1YGR159C 1245 nt15.65■□□□□ 0.1
YMR141CP40211 YML009W-BYML009W-B 477 nt15.43■□□□□ 0.06
YMR141CP40211 NOP1YDL014W 984 nt14.85□□□□□ -0.03
YMR141CP40211 MDJ1YFL016C 1536 nt14.25□□□□□ -0.13
YMR141CP40211 YKL036CYKL036C 393 nt13.39□□□□□ -0.27
YMR141CP40211 YJL027CYJL027C 417 nt13.07□□□□□ -0.32
YMR141CP40211 SRX1YKL086W 384 nt13□□□□□ -0.33
YMR141CP40211 Q0297Q0297 156 nt12.93□□□□□ -0.34
YMR141CP40211 DBP2YNL112W 1641 nt12.51□□□□□ -0.41
YMR141CP40211 YCR051WYCR051W 669 nt12.26□□□□□ -0.45
YMR141CP40211 YBR190WYBR190W 312 nt12.23□□□□□ -0.45
YMR141CP40211 SCS3YGL126W 1143 nt12.04□□□□□ -0.48
YMR141CP40211 TRN1tP(UGG)A 72 nt11.99□□□□□ -0.49
YMR141CP40211 SUF9tP(UGG)F 72 nt11.99□□□□□ -0.49
YMR141CP40211 SUF8tP(UGG)H 72 nt11.99□□□□□ -0.49
YMR141CP40211 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt11.99□□□□□ -0.49
YMR141CP40211 SUF7tP(UGG)M 72 nt11.99□□□□□ -0.49
YMR141CP40211 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt11.99□□□□□ -0.49
YMR141CP40211 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt11.99□□□□□ -0.49
YMR141CP40211 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt11.99□□□□□ -0.49
YMR141CP40211 SUF11tP(UGG)O2 72 nt11.99□□□□□ -0.49
YMR141CP40211 RTC3YHR087W 336 nt11.89□□□□□ -0.51
YMR141CP40211 CCC1YLR220W 969 nt11.79□□□□□ -0.52
YMR141CP40211 YOL085CYOL085C 342 nt11.63□□□□□ -0.55
YMR141CP40211 RPP1BYDL130W 321 nt11.59□□□□□ -0.55
YMR141CP40211 RVS167YDR388W 1449 nt11.59□□□□□ -0.55
YMR141CP40211 SCJ1YMR214W 1134 nt11.55□□□□□ -0.56
YMR141CP40211 SSA3YBL075C 1950 nt11.52□□□□□ -0.57
YMR141CP40211 PKP1YIL042C 1185 nt11.48□□□□□ -0.57
YMR141CP40211 PUT4YOR348C 1884 nt11.42□□□□□ -0.58
YMR141CP40211 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.2□□□□□ -0.62
YMR141CP40211 SHR5YOL110W 714 nt11.15□□□□□ -0.62
YMR141CP40211 PET122YER153C 765 nt11.12□□□□□ -0.63
YMR141CP40211 ARE1YCR048W 1833 nt11.1□□□□□ -0.63
YMR141CP40211 URN1YPR152C 1398 nt11.03□□□□□ -0.64
YMR141CP40211 POA1YBR022W 534 nt10.98□□□□□ -0.65
YMR141CP40211 SAH1YER043C 1350 nt10.98□□□□□ -0.65
YMR141CP40211 OPI9YLR338W 858 nt10.96□□□□□ -0.65
YMR141CP40211 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt10.93□□□□□ -0.66
YMR141CP40211 DEP1YAL013W 1218 nt10.92□□□□□ -0.66
YMR141CP40211 SCR1SCR1 522 nt10.86□□□□□ -0.67
YMR141CP40211 YDJ1YNL064C 1230 nt10.85□□□□□ -0.67
YMR141CP40211 BSC6YOL137W 1494 nt10.83□□□□□ -0.68
YMR141CP40211 RPN10YHR200W 807 nt10.76□□□□□ -0.69
YMR141CP40211 RRN5YLR141W 1092 nt10.74□□□□□ -0.69
YMR141CP40211 YNL208WYNL208W 600 nt10.72□□□□□ -0.69
YMR141CP40211 SPT5YML010W 3192 nt10.7□□□□□ -0.7
YMR141CP40211 ATS1YAL020C 1002 nt10.66□□□□□ -0.7
YMR141CP40211 GAR1YHR089C 618 nt10.63□□□□□ -0.71
YMR141CP40211 PUN1YLR414C 792 nt10.62□□□□□ -0.71
YMR141CP40211 BUD23YCR047C 828 nt10.59□□□□□ -0.71
YMR141CP40211 PTC2YER089C 1395 nt10.55□□□□□ -0.72
YMR141CP40211 YER088W-BYER088W-B 147 nt10.55□□□□□ -0.72
YMR141CP40211 YJR018WYJR018W 363 nt10.5□□□□□ -0.73
YMR141CP40211 NAB2YGL122C 1578 nt10.47□□□□□ -0.73
YMR141CP40211 SSA4YER103W 1929 nt10.41□□□□□ -0.74
YMR141CP40211 RSB1YOR049C 1065 nt10.39□□□□□ -0.75
YMR141CP40211 FIS1YIL065C 468 nt10.35□□□□□ -0.75
YMR141CP40211 YJR120WYJR120W 351 nt10.35□□□□□ -0.75
YMR141CP40211 TIR1YER011W 765 nt10.3□□□□□ -0.76
YMR141CP40211 SSA1YAL005C 1929 nt10.29□□□□□ -0.76
YMR141CP40211 DAL1YIR027C 1383 nt10.27□□□□□ -0.76
YMR141CP40211 MEP2YNL142W 1500 nt10.21□□□□□ -0.78
YMR141CP40211 PHO4YFR034C 939 nt10.19□□□□□ -0.78
YMR141CP40211 FPR4YLR449W 1179 nt10.18□□□□□ -0.78
YMR141CP40211 RPP2BYDR382W 333 nt10.16□□□□□ -0.78
YMR141CP40211 INM2YDR287W 879 nt10.15□□□□□ -0.78
YMR141CP40211 YPS1YLR120C 1710 nt10.13□□□□□ -0.79
YMR141CP40211 SRB2YHR041C 633 nt10.09□□□□□ -0.79
YMR141CP40211 BDF1YLR399C 2061 nt10.08□□□□□ -0.8
YMR141CP40211 DCW1YKL046C 1350 nt10.05□□□□□ -0.8
YMR141CP40211 YBL100CYBL100C 315 nt10.03□□□□□ -0.8
YMR141CP40211 YDR095CYDR095C 411 nt10.01□□□□□ -0.81
YMR141CP40211 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt9.98□□□□□ -0.81
YMR141CP40211 PST2YDR032C 597 nt9.95□□□□□ -0.82
YMR141CP40211 BDH2YAL061W 1254 nt9.94□□□□□ -0.82
YMR141CP40211 TAT1YBR069C 1860 nt9.93□□□□□ -0.82
YMR141CP40211 FUN26YAL022C 1554 nt9.9□□□□□ -0.82
YMR141CP40211 EMI2YDR516C 1503 nt9.89□□□□□ -0.83
YMR141CP40211 YBR220CYBR220C 1683 nt9.86□□□□□ -0.83
YMR141CP40211 PTP1YDL230W 1008 nt9.85□□□□□ -0.83
YMR141CP40211 YDL221WYDL221W 552 nt9.81□□□□□ -0.84
YMR141CP40211 CAC2YML102W 1407 nt9.81□□□□□ -0.84
YMR141CP40211 WWM1YFL010C 636 nt9.8□□□□□ -0.84
YMR141CP40211 YMR090WYMR090W 684 nt9.79□□□□□ -0.84
YMR141CP40211 RPP2AYOL039W 321 nt9.79□□□□□ -0.84
YMR141CP40211 TRM9YML014W 840 nt9.77□□□□□ -0.85
YMR141CP40211 ALF1YNL148C 765 nt9.77□□□□□ -0.85
YMR141CP40211 CCT6YDR188W 1641 nt9.75□□□□□ -0.85
YMR141CP40211 LSM3YLR438C-A 270 nt9.75□□□□□ -0.85
YMR141CP40211 SDH1YKL148C 1923 nt9.75□□□□□ -0.85
YMR141CP40211 SIS1YNL007C 1059 nt9.71□□□□□ -0.86
YMR141CP40211 IRC15YPL017C 1500 nt9.68□□□□□ -0.86
YMR141CP40211 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt9.65□□□□□ -0.86
YMR141CP40211 SUF2tP(AGG)C 72 nt9.64□□□□□ -0.87
YMR141CP40211 SUF10tP(AGG)N 72 nt9.64□□□□□ -0.87
YMR141CP40211 SCC4YER147C 1875 nt9.64□□□□□ -0.87
YMR141CP40211 YGR021WYGR021W 873 nt9.63□□□□□ -0.87
YMR141CP40211 SHU1YHL006C 453 nt9.62□□□□□ -0.87
YMR141CP40211 HOM6YJR139C 1080 nt9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 38.4 ms