Protein–RNA interactions for Protein: Q3E810

YLR342W-A, Uncharacterized protein YLR342W-A, yeastyeast

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR342W-AQ3E810 NSR1YGR159C 1245 nt15.58■□□□□ 0.08
YLR342W-AQ3E810 YML009W-BYML009W-B 477 nt15.38■□□□□ 0.05
YLR342W-AQ3E810 NOP1YDL014W 984 nt14.85□□□□□ -0.03
YLR342W-AQ3E810 MDJ1YFL016C 1536 nt14.13□□□□□ -0.15
YLR342W-AQ3E810 YKL036CYKL036C 393 nt13.33□□□□□ -0.28
YLR342W-AQ3E810 YJL027CYJL027C 417 nt13.06□□□□□ -0.32
YLR342W-AQ3E810 SRX1YKL086W 384 nt12.92□□□□□ -0.34
YLR342W-AQ3E810 Q0297Q0297 156 nt12.83□□□□□ -0.36
YLR342W-AQ3E810 DBP2YNL112W 1641 nt12.31□□□□□ -0.44
YLR342W-AQ3E810 YCR051WYCR051W 669 nt12.25□□□□□ -0.45
YLR342W-AQ3E810 YBR190WYBR190W 312 nt12.18□□□□□ -0.46
YLR342W-AQ3E810 SCS3YGL126W 1143 nt11.91□□□□□ -0.5
YLR342W-AQ3E810 RTC3YHR087W 336 nt11.91□□□□□ -0.5
YLR342W-AQ3E810 TRN1tP(UGG)A 72 nt11.88□□□□□ -0.51
YLR342W-AQ3E810 SUF9tP(UGG)F 72 nt11.88□□□□□ -0.51
YLR342W-AQ3E810 SUF8tP(UGG)H 72 nt11.88□□□□□ -0.51
YLR342W-AQ3E810 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt11.88□□□□□ -0.51
YLR342W-AQ3E810 SUF7tP(UGG)M 72 nt11.88□□□□□ -0.51
YLR342W-AQ3E810 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt11.88□□□□□ -0.51
YLR342W-AQ3E810 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt11.88□□□□□ -0.51
YLR342W-AQ3E810 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt11.88□□□□□ -0.51
YLR342W-AQ3E810 SUF11tP(UGG)O2 72 nt11.88□□□□□ -0.51
YLR342W-AQ3E810 CCC1YLR220W 969 nt11.77□□□□□ -0.53
YLR342W-AQ3E810 RVS167YDR388W 1449 nt11.62□□□□□ -0.55
YLR342W-AQ3E810 RPP1BYDL130W 321 nt11.52□□□□□ -0.57
YLR342W-AQ3E810 YOL085CYOL085C 342 nt11.52□□□□□ -0.57
YLR342W-AQ3E810 PKP1YIL042C 1185 nt11.39□□□□□ -0.59
YLR342W-AQ3E810 SCJ1YMR214W 1134 nt11.39□□□□□ -0.59
YLR342W-AQ3E810 SSA3YBL075C 1950 nt11.34□□□□□ -0.59
YLR342W-AQ3E810 PUT4YOR348C 1884 nt11.26□□□□□ -0.61
YLR342W-AQ3E810 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.12□□□□□ -0.63
YLR342W-AQ3E810 SHR5YOL110W 714 nt11.1□□□□□ -0.63
YLR342W-AQ3E810 PET122YER153C 765 nt11.02□□□□□ -0.65
YLR342W-AQ3E810 URN1YPR152C 1398 nt10.99□□□□□ -0.65
YLR342W-AQ3E810 ARE1YCR048W 1833 nt10.95□□□□□ -0.66
YLR342W-AQ3E810 OPI9YLR338W 858 nt10.91□□□□□ -0.66
YLR342W-AQ3E810 POA1YBR022W 534 nt10.91□□□□□ -0.66
YLR342W-AQ3E810 SAH1YER043C 1350 nt10.9□□□□□ -0.66
YLR342W-AQ3E810 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt10.87□□□□□ -0.67
YLR342W-AQ3E810 DEP1YAL013W 1218 nt10.87□□□□□ -0.67
YLR342W-AQ3E810 SCR1SCR1 522 nt10.87□□□□□ -0.67
YLR342W-AQ3E810 RPN10YHR200W 807 nt10.82□□□□□ -0.68
YLR342W-AQ3E810 YDJ1YNL064C 1230 nt10.78□□□□□ -0.68
YLR342W-AQ3E810 BSC6YOL137W 1494 nt10.75□□□□□ -0.69
YLR342W-AQ3E810 YNL208WYNL208W 600 nt10.7□□□□□ -0.7
YLR342W-AQ3E810 RRN5YLR141W 1092 nt10.66□□□□□ -0.7
YLR342W-AQ3E810 PUN1YLR414C 792 nt10.62□□□□□ -0.71
YLR342W-AQ3E810 BUD23YCR047C 828 nt10.61□□□□□ -0.71
YLR342W-AQ3E810 GAR1YHR089C 618 nt10.58□□□□□ -0.72
YLR342W-AQ3E810 ATS1YAL020C 1002 nt10.56□□□□□ -0.72
YLR342W-AQ3E810 PTC2YER089C 1395 nt10.52□□□□□ -0.73
YLR342W-AQ3E810 YJR018WYJR018W 363 nt10.47□□□□□ -0.73
YLR342W-AQ3E810 YER088W-BYER088W-B 147 nt10.45□□□□□ -0.74
YLR342W-AQ3E810 NAB2YGL122C 1578 nt10.43□□□□□ -0.74
YLR342W-AQ3E810 SPT5YML010W 3192 nt10.38□□□□□ -0.75
YLR342W-AQ3E810 RSB1YOR049C 1065 nt10.38□□□□□ -0.75
YLR342W-AQ3E810 SSA4YER103W 1929 nt10.27□□□□□ -0.77
YLR342W-AQ3E810 TIR1YER011W 765 nt10.25□□□□□ -0.77
YLR342W-AQ3E810 DAL1YIR027C 1383 nt10.24□□□□□ -0.77
YLR342W-AQ3E810 FIS1YIL065C 468 nt10.23□□□□□ -0.77
YLR342W-AQ3E810 RPP2BYDR382W 333 nt10.22□□□□□ -0.77
YLR342W-AQ3E810 FPR4YLR449W 1179 nt10.22□□□□□ -0.77
YLR342W-AQ3E810 INM2YDR287W 879 nt10.17□□□□□ -0.78
YLR342W-AQ3E810 YJR120WYJR120W 351 nt10.16□□□□□ -0.78
YLR342W-AQ3E810 SSA1YAL005C 1929 nt10.15□□□□□ -0.78
YLR342W-AQ3E810 PHO4YFR034C 939 nt10.13□□□□□ -0.79
YLR342W-AQ3E810 MEP2YNL142W 1500 nt10.12□□□□□ -0.79
YLR342W-AQ3E810 YPS1YLR120C 1710 nt10.04□□□□□ -0.8
YLR342W-AQ3E810 YBL100CYBL100C 315 nt10.01□□□□□ -0.81
YLR342W-AQ3E810 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10□□□□□ -0.81
YLR342W-AQ3E810 YDR095CYDR095C 411 nt9.93□□□□□ -0.82
YLR342W-AQ3E810 DCW1YKL046C 1350 nt9.92□□□□□ -0.82
YLR342W-AQ3E810 BDH2YAL061W 1254 nt9.91□□□□□ -0.82
YLR342W-AQ3E810 SRB2YHR041C 633 nt9.86□□□□□ -0.83
YLR342W-AQ3E810 YMR090WYMR090W 684 nt9.86□□□□□ -0.83
YLR342W-AQ3E810 FUN26YAL022C 1554 nt9.85□□□□□ -0.83
YLR342W-AQ3E810 BDF1YLR399C 2061 nt9.84□□□□□ -0.83
YLR342W-AQ3E810 ALF1YNL148C 765 nt9.84□□□□□ -0.83
YLR342W-AQ3E810 EMI2YDR516C 1503 nt9.82□□□□□ -0.84
YLR342W-AQ3E810 PST2YDR032C 597 nt9.82□□□□□ -0.84
YLR342W-AQ3E810 TRM9YML014W 840 nt9.79□□□□□ -0.84
YLR342W-AQ3E810 RPP2AYOL039W 321 nt9.75□□□□□ -0.85
YLR342W-AQ3E810 TAT1YBR069C 1860 nt9.74□□□□□ -0.85
YLR342W-AQ3E810 YDL221WYDL221W 552 nt9.73□□□□□ -0.85
YLR342W-AQ3E810 YBR220CYBR220C 1683 nt9.73□□□□□ -0.85
YLR342W-AQ3E810 WWM1YFL010C 636 nt9.72□□□□□ -0.85
YLR342W-AQ3E810 LSM3YLR438C-A 270 nt9.72□□□□□ -0.85
YLR342W-AQ3E810 PTP1YDL230W 1008 nt9.69□□□□□ -0.86
YLR342W-AQ3E810 CCT6YDR188W 1641 nt9.69□□□□□ -0.86
YLR342W-AQ3E810 SUF2tP(AGG)C 72 nt9.69□□□□□ -0.86
YLR342W-AQ3E810 SUF10tP(AGG)N 72 nt9.69□□□□□ -0.86
YLR342W-AQ3E810 CAC2YML102W 1407 nt9.67□□□□□ -0.86
YLR342W-AQ3E810 SDH1YKL148C 1923 nt9.66□□□□□ -0.86
YLR342W-AQ3E810 SIS1YNL007C 1059 nt9.63□□□□□ -0.87
YLR342W-AQ3E810 YGR021WYGR021W 873 nt9.62□□□□□ -0.87
YLR342W-AQ3E810 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt9.61□□□□□ -0.87
YLR342W-AQ3E810 SCC4YER147C 1875 nt9.56□□□□□ -0.88
YLR342W-AQ3E810 IRC15YPL017C 1500 nt9.53□□□□□ -0.88
YLR342W-AQ3E810 HOM6YJR139C 1080 nt9.51□□□□□ -0.89
YLR342W-AQ3E810 SHU1YHL006C 453 nt9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.6 ms