RNA–Protein interactions for RNA: YBL011W

SCT1, Transcript of Glycerol 3-phosphate/dihydroxyacetone phosphate sn-1 acyltransferase, yeast

Gene SCT1, Length 2,280 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SCT1	YBL011W	YGR164W	P53291	111 aa		4.71	□□□□□ -1.65
SCT1	YBL011W	GAT3	Q07928	141 aa		4.71	□□□□□ -1.65
SCT1	YBL011W	IRC25	Q07951	179 aa		4.71	□□□□□ -1.65
SCT1	YBL011W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
SCT1	YBL011W	COA2	Q3E823	68 aa		4.71	□□□□□ -1.65
SCT1	YBL011W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		4.71	□□□□□ -1.65
SCT1	YBL011W	BLM10	P43583	2143 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	TOM6	P33448	61 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	YBL059W	P34224	193 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	YPT10	P38146	199 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	MBB1	P39534	108 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	DFG10	P40526	253 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	HST4	P53688	370 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	YNR064C	P53750	290 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	YLR281C	Q05863	155 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	AHT1	P29589	182 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	NRG2	P38082	220 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	YOR186W	Q08560	144 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	SPO24	Q3E752	67 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	YHL042W	P38729	150 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	YGL118C	P53132	145 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	MST27	P53176	234 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	MIX17	Q03667	156 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	YDL180W	Q12301	547 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	GCN1	P33892	2672 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	YHR140W	P38842	239 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	SVP26	P38869	228 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	TDA4	P47153	279 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	CPD1	P53314	239 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	MIX14	Q04341	121 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	IRA1	P18963	3092 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.69	□□□□□ -1.66	not detected
SCT1	YBL011W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.69	□□□□□ -1.66	not detected
SCT1	YBL011W	SDS23	P53172	527 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	TRS23	Q03784	219 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	GPI2	P46961	280 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	YOL029C	Q08187	201 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	VPS55	P47111	140 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	HNT2	P49775	206 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	PCP1	P53259	346 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	COX12	Q01519	83 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	SWD3	P38123	315 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	NRM1	P53718	249 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	YDR209C	Q03480	137 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	YPL038W-A	Q3E7B4	63 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	IGO2	Q9P305	131 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	YHR139C-A	O13536	103 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	YER181C	P40097	107 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	BRP1	P53194	125 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	CRH1	P53301	507 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	FZF1	P32805	299 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	RRT13	P40042	185 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	YOL118C	Q08259	102 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SCT1	YBL011W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.65	□□□□□ -1.67	not detected
SCT1	YBL011W	FLO9	P39712	1322 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	UBC4	P15731	148 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	BET1	P22804	142 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	YIL163C	P40448	117 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	VHS2	P40463	436 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	RRT15	Q3E811	62 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	DIF1	O13577	133 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	YIL029C	P40538	142 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	ECO1	P43605	281 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	IMP1	P28627	190 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	YKL044W	P36092	106 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	YLR302C	O13544	120 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	GAT4	P40569	121 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	FIP1	P45976	327 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	COX17	Q12287	69 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	QCR9	P22289	66 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	DSE2	P38844	325 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	YGR050C	P53231	118 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	ATP23	P53722	227 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	TIM18	Q08749	192 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCT1	YBL011W	CSF1	Q12150	2958 aa		4.61	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 33.6 ms